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Cell: 新型CRISPR转录学编辑“机器”有助于重塑转录记忆

基因编辑技术的进步大幅提升了我们修饰人类基因组的能力。基于sgRNA介导的CRISPR- Cas9相关基因编辑技术能够在指定位点引入DNA断裂以失活基因功能或通过同源性DNA修复引导精确的DNA编辑,这些技术已针对基础DNA序列的靶向变化进行了优化,因此非常适合修复或引入致病性突变。然而,上述技术对内源性DNA修复机制的依赖提出了挑战,因为这些途径的复杂性可能使其难以进一步提升精确性。

2021-04-12

转录因子调控原钙粘蛋白三维基因机制研究取得重要进展

  牛津大学出版社出版的、国际权威学术期刊《核酸研究》在线发表了上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学中心教授吴强团队以“Mechanism of REST/NRSF Regulation of Clustered Protocadherin Alpha Genes”为题目的最新成果,揭示了转录因子REST结合DNA模式和调控原钙粘蛋

2021-04-16

Cancer Research:人类第一个胃癌基质转录图谱建成

以色列科学家提供了第一个人类胃癌间质转录图,并发现癌症相关的成纤维细胞通过热休克因子1介导的细胞外囊泡的分泌促进侵袭性胃癌表型

2021-04-12

PNAS:“实时”转录学揭示果蝇接种肿瘤细胞后的免疫防御机制

此前研究发现,通过将致癌的RasV12细胞注射到成年雄性果蝇中,会在经过几天的滞后期后大量繁殖,并导致2至3周后果蝇死亡。针对这一现象,来自法国斯特拉斯堡大学的Jules A. Hoffmann团队等人对细胞注射期间的转录组特征进行了研究。相关结果发表在最近的《PNAS》杂志上。

2021-04-07

Nature:通过对5万多人不同的全基因进行测序来探究人类危险性疾病的成因

2021年4月8日 讯 /生物谷BIOON/ --先进DNA测序技术的开发及测序成本的降低让科学家们能以前所未有的规模来深入剖析并研究人类遗传突变,为了改善对人类健康的研究和理解,这些先进技术就应该被应用到表型良好的人类样本中,并用于建立一定的资源,比如变异目录、控制集合和推算参考面板等。日前,一篇发表在国际杂志Nature上题为“Sequencing of

2021-04-07

两篇Nat Genet:科学家对诱导多能干细胞进行转录学分析揭示诱发人类疾病的病因!

2021年3月8日 讯 /生物谷BIOON/ --日前,发表在国际杂志Nature Genetics上的两篇研究报告中,来自德国癌症研究中心和欧洲分子生物学实验室等机构的科学家们通过研究发现,诱导多能干细胞(iPSC,Induced pluripotent stem cells)或能揭示人类疾病的病因。研究者表示,iPSC或许适合帮助他们发现引发复杂罕见遗传

2021-03-07

Science:一项里程碑式研究分析了64个人类基因测序结果 有望更好地理解人类遗传多样性!

2021年3月6日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在国际杂志Science上的研究报告中,来自马里兰大学医学院等机构的科学家们详细介绍了64个人类全基因组测序的结果,这一参考数据包括来自全球各地的人群,能够更好地反映人类物种的遗传多样性,除了其它应用外,这项研究也能促进科学家们对人类疾病有遗传倾向的特定人群进行研究,并发现更为复杂的遗传突变形式

2021-03-05

从单细胞转录中解析出人类肿瘤中的拷贝数和克隆亚结构

  美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心Nicholas E. Navin团队开发出新方法,可从单细胞转录组中解析出人类肿瘤中的拷贝数和克隆亚结构。该研究于近日在线发表于国际一流学术期刊《自然—生物技术》。研究人员表示,单细胞转录组学分析被广泛用于研究人类肿瘤。然而,将肿瘤微环境中的正常细胞类型与恶性细胞区分开并解析肿瘤内的克隆亚结构仍然具

2021-01-22

全基因测序揭示番石榴维生素C合成和果实软化遗传基础

   番石榴(Psidium guajava)是桃金娘科的重要果树,主要产于美洲和亚洲热带及亚热带地区。它因适应性强、容易栽培,产量高,且富含维生素C(抗坏血酸)等营养物质而广受欢迎,被誉为“热带苹果”。番石榴果实是重要的天然维生素C来源,但其维生素C合成的遗传基础却少有研究。桃金娘科是植物果实类型演化研究的重要模式,兼有肉质的

2021-01-14

Mol Cell:整合子或能作为人类转录的“守护者”

2021年1月9日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Molecular Cell上的研究报告中,来自奥胡斯大学等机构的科学家们通过研究揭示了一种特殊的细胞特性,其或能保护机体细胞免于基因表达的有毒副产物的影响。这种活性对于多细胞有机体维持一个强大的基因产物进化“库”的能力而言非常重要。制造过程需要质量控制系统来确保功能性产品的适当组装,

2021-01-09