计算机模拟有助于研究细菌的耐药性
据悉，一个关于氨基糖甙类抗生素与它们在细菌的作用位点之间相互作用的最新研究使用了计算机模拟来阐明这个机制，从而建议药物的修饰。 在这篇于7月21日发表在开放期刊《PLoS Computational Biology》上的文章中，波兰华沙大学以及美国加州大学圣地亚哥分校的研究人员描述他们的细菌耐药机制的物质基础研究-抗生素的作用靶点即细菌核糖体RNA的突变。
Nat Commun：模拟铁氢化酶化合物光催化产氢
氢化酶是存在于自然界微生物体内的一种氢气还原生物酶。自然界光合作用是利用光诱导电子转移所生成的长寿命电荷分离态将光能固定，最终实现太阳能高效大规模向化学能的转换，其中氢化酶活性中心能够利用所获电子高效催化质子还原为氢气，实现无污染的放氢过程。
eLife：使用计算机模拟技术揭示病毒扩散的机制
2013年6月19日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，刊登在国际杂志eLife上的一篇研究报告中，来自布兰迪斯大学的研究者通过复杂的计算机模型和图形处理单元来揭示病毒结构与其外壳之间基因组数据的复杂关联。研究者Jason Perlmutter表示，我们希望通过此项研究来帮助改变病毒的装配从而使得病毒不能进行复制。
PNAS：小鼠模型不能很好模拟人类炎症疾病
数十年以来，在进行人体试验之前，实验小鼠模型一直被用于确认和测试候选药物，但是一项研究发现这些模型不能准确地代表人类对炎症疾病的响应。 Junhee Seok及其同事研究了创伤、烧伤和来自例如大肠杆菌等细菌的毒素是如何影响病人的遗传应答的。这组作者将观察到的模式与在小鼠模型中观察到的模式进行了比较。他们确定了来自这些小鼠模型的模式与人类响应模式匹配得不好，以至于这些结果看上去像是随机的。
Simbionix创新型患者专用模拟器获美国同类产品首个专利
克利夫兰2013年4月7日电 /美通社/ -- 全球领先的医疗教育与模拟培训服务供应商 Simbionix USA Corporation 的患者专用模拟器 PROcedure Rehearsal Studio? (PRS) 获得了一项美国专利。在此之前，该产品还获得了一项类似的英国专利，并且在同类产品中获得首个这样的美国专利。
PNAS：三维聚合物支架培养尤因氏肉瘤细胞模拟体内肿瘤生长环境
2013年4月2日 讯 /生物谷BIOON/ --支持植入手术需要的生物组织生长的多孔聚合物支架，具有很大地潜力来加快癌症治疗的开发。Rice大学、得克萨斯大学MD Anderson癌症中心和纽约西奈山医学中心的研究人员最新研究报道，用三维聚合物支架来培养尤因氏肉瘤细胞是有效的，可以模拟体内肿瘤生长的环境。 他们的研究结果发表在最新一期PNAS杂志上。
PLoS ONE：禁食让脑瘤对化疗更加敏感
2012年9月13日 讯 /生物谷BIOON/ --在一项新研究中，来自美国南加州大学的研究人员首次证实控制性禁食(controlled fasting)改善在癌症治疗中的化疗疗效，延长患有侵袭性脑瘤的小鼠的预期寿命。 在这项刊登在PLoS ONE期刊上的最新研究中，研究人员首次证实禁食时间似乎提高化疗在治疗神经胶质瘤上的疗效。神经胶质瘤是一种最为常见被诊断出来的脑瘤。
Plos Genetics:模拟细菌DNA甲基化模式实现穿越其限制修饰屏障
细菌是存在于自然环境中的一个重要生物类群，参与自然环境碳、氮和硫等元素的循环，另外，细菌在人类的健康与疾病、工业微生物发酵及农业生物病虫害防治等领域也占有重要地位。遗传操作是研究细菌生理功能、致病机理及构建基因工程菌株的先决条件。
PNAS：首次成功模拟HIV成熟过程的关键步骤
2012年12月4日讯 /生物谷BIOON/ --西班牙IMIM研究所及庞培法布拉大学（Pompeu Fabra University，UPF）的生物信息学家已利用分子模拟技术来解释HIV病毒粒子成熟过程的每一个具体步骤，例如，新形成的惰性病毒颗粒如何成为感染性病毒，这对于了解病毒复制至关重要。该项研究已在线发表于《美国国家科学院报》（PNAS）。
Cell Stem Cell:科学家用iPS细胞模拟阿尔兹海默氏病
2013年2月22日讯 /生物谷BIOON/--日本长崎大学和iPS细胞研究应用中心科学家成功使用家族型和散发性病人诱导的多能干细胞（iPS细胞）模拟了阿尔兹海默式病（AD），并显示不同药物对AD神经元和星形胶质细胞的胞内Aβ寡聚体影响。相关报道发表在近期Cell Stem Cell上。