Science:开发空间切割和标记新技术绘制组织发育机制图
瑞典卡罗斯卡医学院和耶鲁大学合作开发了一项新技术,可提供特定组织中活跃和失活基因的精确位置信息,为不同组织如何发育,以及表观遗传调控如何促进疾病发展提供重要知识。研究成果在《科学》杂志上发表。不同功能的细胞都包含相同的基因组,差异在于哪些基因被激活,这是由表观遗传学调控的。在胚胎发育过程中,不同的表观遗传修饰会打开和关闭某些基因,从而形成不同的器官。虽然目前
Nucleic Acids Research:同济大学王晨飞团队开发空间转录组分析算法——STRIDE
近些年,高通量单细胞测序技术的发展,使得研究人员能够在单细胞分辨率研究复杂生物系统中细胞的异质性,但在实验过程中需要经历组织消化等操作,导致细胞在组织中原始位置信息的丢失。新兴的空间转录组学技术则在定量基因表达水平的同时,保留了细胞的空间信息,研究人员得以在空间背景下研究细胞不同的功能状态以及细胞间的相互作用。然而,由于技术的限制,目前大多数空间转录组或是检
Nature Methods:科学家利用空间分辨的同位素示踪揭示组织代谢活动
同位素示踪有助于确定器官的代谢活动,但研究不同器官内代谢异质性的方法尚不成熟。美国普林斯顿大学的研究团队利用空间分辨的同位素示踪揭示组织代谢活性,相关论文于近日发表在《Nature Methods》杂志上,题为:Spatially resolved isotope tracing reveals tissue metabolic ac
Science:开发出spatial-CUT&Tag技术,可在空间水平和全基因组水平上观察组织发育背后的表观遗传机制
在一项新的研究中,来自美国耶鲁大学和瑞典卡罗林斯卡学院的研究人员开发出一种技术,使他们能够同时在空间水平和全基因组水平上观察组织发育背后的表观遗传机制,这是一项在多种科学和医学应用上的突破。
Cell:在三维空间中模拟活的最小细胞的行为
在一项新的研究中,来自美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校和克雷格-文特尔研究所研究所的研究人员报道,他们构建出活的“最小细胞”,其基因组只剩下最基本的要素,与此同时,他们构建出一种反映细胞行为的计算机模型。
Science:组织的几何形状或会引导类器官的形成
2022年1月14日 讯 /生物谷BIOON/ --干细胞衍生的类器官是体外组织和器官的模拟物,其能作为研究人类器官发育和疾病发生的重要模型,同时也能作为药物发现和诊断的平台,对于设计新型细胞和基因疗法也至关重要;然而,目前研究人员并不清楚类器官发育背后的干细胞自组装过程是如何被控制的,从而就会导致现有的类器官培养物普遍缺乏可重复性,比如小鼠肠道类器官(其或
Science Advances:我国科学家绘制原发性肝癌高分辨率空间分子图谱
异质性是癌症预防和治疗的主要挑战。近日,我国海军军医大学的研究团队在《Science Advances》发表了题为“Comprehensive analysis of spatial architecture in primary liver cancer”的文章。研究人员对7例原发性肝癌患者的21个组织样本进行空间转录组
新品发布 I PhenoCycler-Fusion上市,开启空间生物学2.0序幕
我们很高兴宣布PhenoCycler™-Fusion正式上市,该系统为整张组织切片在单细胞分辨率下的高速成像设定了空间生物学的新标准。
Cell:揭示组织如何形成复杂的形状从而使让器官发挥功能的机制
如今,在一项新的研究中,来自美国哈佛医学院的研究人员发现了一种机械过程,通过这种过程,细胞层蜕变为内耳的精致、环形的半规管(semicircular canal)。相关研究结果近期发表在Cell期刊上。
Nature:研究解析大麦叶绿体PSI-NDH膜蛋白超大分子复合物空间结构
光合作用光反应过程是在一系列镶嵌在光合膜上的蛋白质超分子机器中进行的,通过光驱动光系统II(PSII)和光系统I(PSI)反应中心电荷分离及光合电子传递,将光能转化为化学能(ATP和NADPH),用于暗反应二氧化碳固定。PSI和PSII催化两种类型光合电子传递,分别为线性电子传递和环式电子传递。在环式电子传递路径中,由NDH蛋白复合物