“机器学习”如何助力新药研发?
今天的新药发现,已经离不开计算学科的支撑,与计算相关的各种技术也因新药研发,而备受行业的重视。机器学习,作为AI的一个重要分支,凭借其辅助发现潜力化合物、预测相关参数、节约试验成本、压缩开发周期等优势,得到了研发及投行的极大关注。本稿件即对机器学习的历史及其于医药领域的应用进行概述,以期与同行进行共同学习。未来:精准医学&药物
Science:利用新型机器学习技术准确预测蛋白和RNA的三维结构
美国斯坦福大学博士生Stephan Eismann和Raphael Townshend在该大学计算机科学副教授Ron Dror的指导下,利用巧妙的新型机器学习技术,开发出一种通过计算预测准确结构来克服这一问题的人工智能算法。最值得注意的是,即使只从少数已知结构中学习,他们的方法仍然成功,这使得它适用于那些结构最难通过实验确定的分子类型。
Nature Communications:研究基于深度学习算法优化序列特异性的C-to-G单碱基编辑器
Nature Communications发表了题为Optimization of C-to-G base editors with sequence context preference predictable by machine learning methods的研究论文,该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心、上海脑科学与类脑研究中心研究员孙
PLoS Biol:人类大脑顶内沟中的神经递质水平可预测数学成绩
2021年7月26日讯/生物谷BIOON/---神经递质γ-氨基丁酸(GABA)和谷氨酸具有互补的作用---GABA抑制神经元,而谷氨酸使其更加活跃。在一项新的研究中,由英国牛津大学的Roi Cohen Kadosh和George Zacharopoulos领导的一个研究团队发现,这两种神经递质在大脑顶内沟(intraparietal sulcus)中的水平
Nature:基于机器学习的工具BoostDM可识别每种肿瘤类型的癌症驱动突变,有助开发个性化癌症治疗
2021年8月4日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自西班牙巴塞罗那生物医学研究所的研究人员开发出一种计算工具,它可以识别每种肿瘤类型的癌症驱动突变。这一发现有助于加速癌症研究,并提供工具帮助肿瘤学家为每名患者选择最佳治疗方法。相关研究结果于2021年7月28日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“In silico saturation
Nature:饥饿感如何增强小鼠对食物的学习能力?
2021年7月17日 讯 /生物谷BIOON/ --表达刺鼠相关肽(agouti-related peptide,AgRP)的神经元能被禁食所激活,而禁食会导致饥饿,饥饿会促使机体寻求和消耗食物;禁食会使AgRP神经元的活性在三个不同的时间尺度上恢复到基线,快速而短暂地随着食物线索进行感官检测,且缓慢而持久地对肠道中的营养物质响应,甚至更为缓慢而永久性地恢复
British Journal of Psychology:揭示基于单眼的无意识奖赏学习机制
奖赏能够影响人的知觉和行为,人们可以从意识和知觉上区分哪些事物能带来奖赏、哪些不能。这种意识和知觉上的差异为追求奖赏提供了重要线索。奖励规则由人制定,但大脑的奖赏系统未必需要意识来调控奖赏学习。奖赏的神经调节信号弥散地分布在整个大脑,奖赏系统与大脑中多个脑区有连接。这种连接的复杂性使无意识的奖赏学习成为潜在的可能,但由于以往研究范式里
侯晓华教授:带动基层的交流学习热情
侯晓华教授是华中科技大学同济医学院附属协和医院大内科主任、消化科主任,毕业于上海医科大学。他同时还担任着华中科技大学同济医学院副院长、附属协和医院院务委员会副主任,中国医师协会消化医师分会副会长、中华医学会消化病学分会常委。他还是农工党武汉市委会主委、市政协副主席。35年来,他在消化病临床诊断上积累了丰富的经验,擅长胃肠疾病疑难杂症的诊断和治疗,特别是针对慢
Nature子刊:通过机器学习模型识别复杂疾病的重要生物标记物
2021年5月27日讯/随着高通量技术的发展,通过世界各地研究人员的共同努力,形成了大型公共数据库,如癌症基因组图谱(TCGA)。这对阐明疾病表型的分子机制具有重大意义。然而,由于癌症等复杂疾病的病理以及其在遗传、基因组和蛋白质组水平上复杂的分子机制,研究复杂的人类疾病仍具有挑战性。目前,已有很多基于机器学习的方法开发出来,包括非线性核支持向量机(SVMs)
Nat Med:开发出新型机器学习技术 或有望改善胎儿先天性心脏病等出生缺陷的筛查
2021年5月30日 讯 /生物谷BIOON/ --先天性心脏病(CHD,Congenital heart disease)是一种最常见的出生缺陷,胎儿超声筛查能提供5个心脏视图,而这些视图能帮助检测90%的复杂先天性心脏病,但在医学实践中,这种筛查的敏感性会低至30%。日前,一篇发表在国际杂志Nature Medicine上题为“An ensemble o