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研究开发出基于深度学习的单细胞转录组分析模型

  单细胞转录组作为单个细胞的特征,可更加精确地定义细胞的类型。常规的基于单细胞转录组的分类方法首先是进行无监督的聚类,然后根据每个集群(Cluster)特异表达的细胞标记基因来对集群进行标注。虽然基于无监督的分类方法更容易发现新细胞类型,但是人工标注的过程费时费力。目前已有的基于监督学习的自动分类方法,大部分无法兼顾到方法的可解释性以及

2020-11-12

elife:光遗传学帮助开发亨廷顿动物模型

亨廷顿舞蹈病是一种遗传性神经退行性疾病,其特征是由于大脑纹状体核中神经元的变性导致运动,认知缺陷和精神疾病的改变。 UB神经科学研究所(UBNeuro)的研究人员领导的一项研究对这种疾病的发展所涉及的神经元回路之一进行了描述:背外侧纹状体核(DSL)中的次级运动皮层(M2)的连接。

2020-11-12

Nature:构建出一种计算机模型,可以准确预测新冠肺炎在美国10个大型城市的传播情况

2020年11月15日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国斯坦福大学和西北大学的研究人员构建出一种计算机模型,并利用这种模型通过分析驱动感染风险的三个因素---人们在一天中去了哪里,停留了多长时间,以及有多少其他人在同一时间访问同一地点---准确预测了今年春天COVID-19在美国10个主要城市的传播情况。相关研究结果于2020年11月10

2020-11-15

Cell:“畸胎瘤”有望作为科学家研究人类发育过程的理想模型

2020年11月7日 讯 /生物谷BIOON/ --在长达十几年的时间里,寻找合适的模型来研究人类发育(从早期胚胎发育阶段往前)对于科学家们而言一直是一大挑战;近日,来自加利福尼亚大学等机构的科学家们就通过研究锁定了一种不寻常的可供研究的候选者:畸胎瘤(teratomas),相关研究结果发表在了国际杂志Cell上。畸胎瘤是一种由不同组织组成的肿瘤,包括骨质、

2020-11-07

科学家3D打印出逼真的心脏瓣膜模型

  近几年来,3D打印技术可谓是突飞猛进的发展,几个月就上升一个新高度。近日,发表在《Science Advances》上的一项新研究中,来自美国明尼苏达大学的研究人员在美敦力公司的支持下,开发出一种突破性的技术,用多材料3D打印出了逼真的心脏主动脉瓣和周围结构模型,它可以模仿真实病人的外观和感觉。这些特定于患者的器官模型,包括集成到结构

2020-10-17

Nat Commun:科学家成功开发出一种深度学习模型工具 或有望更好地预测肺癌患者的治疗疗效

2020年10月22日 讯 /生物谷BIOON/ --在过去20年里,肺癌患者的个体化疗法的发展和选择已经取得了长足的进展,非小细胞肺癌依然是肺癌的主要类型,而且也是诱发全球癌症相关死亡的主要原因,对于这类肺癌而言目前有两种治疗性策略,即酪氨酸激酶抑制剂和免疫检查点抑制剂疗法,然而,为每一位非小细胞肺癌患者选择最正确的疗法或许并不是一件容易的事情,因为在其治

2020-10-22

研究提出小鼠多发性硬化模型的营养干预方法

营养与免疫之间存在复杂的相互影响关系,饮食干预措施已被证明可有效预防代谢性疾病并延缓衰老进程。多发性硬化症(Multiple sclerosis)是一种常见的自身免疫性慢性炎症和脱髓鞘疾病。近期,中国科学院上海营养与健康研究所陈雁研究组博士生白美娟等利用多发性硬化症小鼠模型,研究间歇性节食的干预功效。该研究利用髓鞘少突胶质细胞糖蛋白的一个多肽免疫小鼠来诱导多

2020-10-05

Sci Adv:实验室培育的新型3D肿瘤模型或有望帮助改善卵巢癌的疗法

2020年10月12日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Science Advances上的研究报告中,来自诺丁汉大学等机构的科学家们通过研究在实验室中开发出了一种用于研究卵巢癌的3D肿瘤模型,相关研究结果或能帮助理解卵巢癌的发病机制并开发新型的靶向性疗法。研究者所创建的这种多细胞3D微环境能够重现卵巢癌中肿瘤细胞生长的模式以及其如何对

2020-10-12

研究解析树鼩抗病毒天然免疫通路基因特异性和HCV病毒感染模型受限的遗传机制

树鼩是灵长类动物的近亲,作为实验动物具有应用价值,日渐受到重视。前期,中国科学院昆明动物研究所研究员姚永刚团队利用新一代测序技术,完善和更新树鼩基因组(KIZ version 1,Nat. Commun. 2013;KIZ version 2,Zool. Res.),利用新版基因组,可更好认识树鼩的遗传特性,解释其用于人类疾病动物模型,特别是病毒感染模型创建

2020-10-01

科学家建立大样本猕猴脑影像标准化模型

近日,Cerebral Cortex在线发表题为Normative Analysis of Individual Brain Differences Based on a Population MRI-Based Atlas of Cynomolgus Macaques的研究论文。该研究由中国科学院昆明动物研究所客座研究员、脑科学与智能技术卓越创新中心(神经

2020-09-06