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Nature:科学家构建基因表达调控DNA序列进化和适应度景观研究框架

 顺式作用元件是位于基因旁侧序列中能影响基因表达的非编码DNA序列。这些顺式作用元件的突变可能影响与基因转录因子相互作用,从而调控基因表达,进而改变生物表型和适应度景观。一个完整的适应度景观由一个适应度函数定义,该函数将序列空间中的每个序列映射到其相关的适应度。但调控DNA序列与适应度建立的映射关系很难可靠地推广到整个序列空间,因此构建完全的适应度

2022-03-24

家猪胸腰椎发育转换基因表达调控研究取得进展

   不同的家猪品种在胸椎和腰椎数量上高度可变,胸椎与腰椎数量与猪的体长密切相关,是重要的经济性状。长期以来,猪体节数量性状是猪遗传育种的重要研究方向之一,但胸腰椎数量的变异与发育转换机制目前仍不清楚。由于胸腰椎的体节发生过程对应于早期胚胎发育阶段,对相应的收集与研究存在众多困难,导致这一过程中的基因表达调控机制研究存在诸多挑战

2021-11-25

Nature子刊发现植物在逆境响应过程中存在RNA介导的基因共表达调控网络

  真核生物基因组可转录产生大量RNA。这些RNA包括编码蛋白质的mRNA和众多非编码RNA(ncRNA)。ncRNA大致可分为两大类:看家ncRNA(housekeeping ncRNA)和调控性ncRNA。看家ncRNA包括参与蛋白质合成的核糖体RNA(rRNA)、转运RNA(tRNA),参与RNA剪接的snRNA和参与RNA修饰的s

2021-10-24

研究开发出新型染色体原位多基因表达调控技术

  对复杂的细胞代谢进行重编程需要对多个基因同时进行表达调控。目前常用的基因表达调控方法是在离位(ex-situ)构建启动子或核糖体结合位点(RBS)的质粒文库,转化进入细胞进行筛选,然而该方法受限于克隆效率和转化效率,难以实现多基因同时的表达调控。MAGE技术可在染色体原位(in-situ)产生遗传多样性,从而同时调节多个基因的表达。但

2021-02-07

研究开发出新型染色体原位多基因表达调控技术

  对复杂的细胞代谢进行重编程需要对多个基因同时进行表达调控。目前常用的基因表达调控方法是在离位(ex-situ)构建启动子或核糖体结合位点(RBS)的质粒文库,转化进入细胞进行筛选,然而该方法受限于克隆效率和转化效率,难以实现多基因同时的表达调控。MAGE技术可在染色体原位(in-situ)产生遗传多样性,从而同时调节多个基因的表达。但

2021-02-05

谷氨酸棒杆菌多基因表达调控技术方面取得进展

 谷氨酸棒杆菌是重要的工业发酵菌种,被广泛用于氨基酸、有机酸的生产。为了提高目标产物的产量,代谢途径关键基因的表达往往需要精细调控。尽管近年来基于CRISPR的基因组编辑技术以及基于CRISPRi的基因表达沉默技术在谷氨酸棒杆菌中取得了突破,为基因敲除和改造提供了重要工具,但目前可用的基因表达快速调控工具还相对有限。中国科学院天津工业生物技术研究所

2020-05-28

研究发现节律性调控染色质重塑和脂代谢基因表达的分子开关

5月4日,国际学术期刊Nature Metabolism 在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所丁秋蓉课题组的研究论文“MRG15 orchestrates rhythmic epigenomic remodeling and controls hepatic lipid metabolism”。该研究发现MRG15作为一个进化上保守的表观调控因子在调控肝

2020-05-08

研究人员绘制人类海马体发育的细胞图谱和基因调控网络

1月16日,《自然》(Nature)在线发表了题为Decoding the development of the human hippocampus 的研究论文。该工作系统阐明了人海马体胚胎发育过程中的基因表达调控网络和细胞命运决定因子,绘制了高精度发育细胞图谱,解析了海马发育过程中的不同细胞类型及其关键的分子与调控网络。海马体,是由端脑的内侧区域发育而来,

2020-01-19

研究揭示基因表达调控核心复合物LDB1/SSBP2的分子机制

 近期,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了题为Crystal structure of human LDB1 in complex with SSBP2 的论文,该项工作由中国科学院生物物理研究所许文青/梁栋材课题组和美国国立卫生研究院Ann Dean课题组合作完成。增强子是一种控制基因表达与否的开关,它们往往远离其控制的基因,坐落于编码

2020-01-09

研究揭示基因表达调控核心复合物LDB1/SSBP2的分子机制

 12月31日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了题为Crystal structure of human LDB1 in complex with SSBP2 的论文,该项工作由中国科学院生物物理研究所许文青/梁栋材课题组和美国国立卫生研究院Ann Dean课题组合作完成。增强子是一种控制基因表达与否的开关,它们往往远离其控制的基因,坐

2020-01-06