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北大教授开发单细胞全转录测序新技术

2014年4月29日,北京大学生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表题为“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的论文。

2015-02-15

Nat Biotechnol && J Comput Biol:开发出新算法对单细胞基因进行测序

2012年8月13日 讯 /生物谷BIOON/ --美国加州大学圣地亚哥分校计算机科学家Pavel Pevzner领导的一个国际研究小组开发出一种新的算法来对有机体单个细胞的基因组进行更加快速地和更加准确地测序。这个新的算法被称作SPAdes,能够被用来对不能利用标准克隆技术进行处理的细菌进行测序,其中研究人员将这些细菌称作生命的暗物质,比如医院中发现的一些病原体,在深海或人胃肠道中存在的细菌。

2012-11-19

贺建奎:单细胞基因的兴起

上周在美国冷泉港(Cold Spring Harbor)参加了单细胞分析会议(single cell analysis), 这是一个非常令人激动的前沿学术会议,深深的体会到了单细胞基因组学的时代已经来临。 Cold Spring Harbor的会议是公认的高水准的会议,它有几个特点:首先,所做的报告都是最新的研究,组织方特别强调,希望介绍尚未发表的研究进展。

2013-03-20

Science:单细胞基因测序

2012年12月22日讯 /生物谷BIOON/-- 基因组测序需要用PCR技术扩增出足够量的DNA片段。由于PCR扩增具有偏好型而且基因组具有大量的冗余,造成了基因组测序准确性不高。

2012-12-23

Nature:用单细胞基因探索多样性

宏基因组研究极大地提高了我们对于细菌以及古细菌多样性的理解。然而,环境宏基因组数据往往不容许个别物种的基因组组装,因此,大多数完整的基因组序列来自于培养的微生物。如今,两个新的大规模研究利用单细胞基因组,直接从未培养的环境样本中恢复了细菌和古细菌基因组。

2013-10-13

Science:科学家揭示了大脑发育过程的表观基因变化

2013年7月7日讯 /生物谷BIOON/--包括DNA化学修饰等的表观基因组变化能够基因组的信息量,被认为在学习记忆和衰老相关的认知减退中起重要作用。索尔克生物学研究所的科学家的最新发现表明DNA甲基化状态与从个体出生到成年的整个发育过程中的神经元动态变化高度相关,该发现有望揭示个体从胎儿发育到成年的神经元内基因组信息如何控制。大脑比机体的其他器官都要复杂,该发现为深入理解大脑联系打开了一扇门。

2013-07-07

Biotech:供者细胞类型影响人诱导性多功能干细胞表观基因和分化潜能

已有研究表明小鼠诱导性多功能干细胞(induced pluripotent stem cells, iPSCs)保留着它们起源的细胞类型的表观遗传“记忆”。Kitai Kim等研究人员近日在人类细胞中研究了这个问题,并且把重编程过程中DNA甲基化的不完全擦除和异常的重新甲基化(de novo methylation)记录下来。该研究结果于2011年11月27日在线发表在《自然-生物技术》杂志上。

2012-11-18

基因研究揭示癌变细胞进化过程

在世界范围内,临床上七分之一死亡病例是由于罹患癌症。而在西方社会,这一比例更是高达三分之一。很早之前,人们就知道吸烟会导致肺癌,日照会诱发皮肤癌。但是,对于癌变发生的机制和细节,却知之甚少。

2013-01-30

Cell:开发出比较表观基因方法来研究基因调节功能

人类基因组测序已产生大量基因信息,但是理解每个基因的功能的目标仍未实现。在一项新研究中,美国伊利诺伊大学研究人员报道,利用一种他们称作“比较表观基因组学(comparative epigenomics)”的新方法就能够确定基因的作用。相关论文研究结果于2012年6月8日发表在《细胞》期刊上。

2012-11-18

Am J Pathol:成体干细胞产生新的组织时改变它们的表观基因

2012年10月9日 讯 /生物谷BIOON/ --在一项研究中,西班牙巴塞罗那市Bellvitge生物医学研究所癌症表观遗传学与生物学项目(Cancer Epigenetics and Biology Program at the Bellvitge Biomedical Research Institute, IDIBELL)主任Manel Esteller和同事们鉴定出成体干细胞产生人体不同

2012-11-18