Nature:HeLa细胞基因组出乎意料地稳定
HeLa癌细胞系(生物医学研究中使用时间最长、同时也应当是使用最普遍的人细胞系)的首次基因组定性,显示了一个对“点突变”和版本数改变来说都惊人地稳定的基因组。“点突变”率也许并不高于正常组织的体细胞突变率,同时能将在上个世纪50年代彼此分开的不同HeLa细胞系的基因组区分开来的版本数改变也非常少。
蔡卫民:药物基因组学与抗肿瘤药物个体化用药的一些思考
肿瘤是严重威胁人类健康的常见病和多发病。所有的肿瘤均由DNA序列异常造成。基因多态性均可影响抗肿瘤药物的反应。围绕药物基因组学与抗肿瘤药物个体化用药的主题,复旦大学药学院蔡卫民教授,在2012年11月15日召开的“2012个体化用药前沿研讨会”上,重点介绍了各类抗肿瘤药物基因组学的研究进展,并分享了他对个体化用药的一些思考。
Science:人巨细胞病毒病毒基因组测序
2012年11月23日 讯 /生物谷BIOON/ --人巨细胞病毒是一种很常见的疱疹病毒,感染约50-100%的成人,但通常没有不良影响,并且它可以保持潜伏多年。人巨细胞病毒感染是比较常见的,发展中国家感染人数比发达国家人数多。 该病毒可导致出新生儿生缺陷和免疫系统受损,可能会导致致命疾病。该病毒也与癌症发展有关联。这项新的研究分析了病毒的蛋白质组,并描述了所有表达的蛋白质。
:在体细胞重编程过程中保护基因组的稳定性可以显著改善iPS细胞的质量
体细胞重编程技术具有重要的理论和实践意义。在再生医学研究中,通过该技术获得来自患者的多能干细胞,进一步用于自体移植可以避免免疫排斥问题,从而使其成为干细胞和再生医学研究的热点领域。 核移植和iPS技术均能将体细胞重编为多能干细胞,然而两者的重编程的能力却不同。核移植后获得的胚胎干细胞(ESCs)具有与正常ESCs相似的多能性,通过四倍体囊胚注射能够获得小鼠,然而大部分的iPS细胞却没有这一能力。
Nature:基因组学分析揭示细菌进化的自然选择过程
Zachary Blount,密歇根州立大学BEACON进化研究中心的博士后,其阐述了有机体进化出新功能的自然选择过程,这项研究刊登在了国际杂志Nature上。 Credit: Brian Baer。 2012年9月20日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,来自密歇根州立大学的研究者通过研究,阐述了有机体进化出新功能循序渐进的过程。这项研究刊登在了国际杂志Nature上。
Nat Cell Biol:全基因组解析人类细胞的分泌过程
在细胞中,不同的基因都处于沉默状态(中间和底部),相比正常细胞(最上面),特殊位点的分泌过程开始进行(绿色代表开始分泌) (Credit: Image courtesy of UCD Conway Institute of Biomolecular & Biomedical Research) 近日,爱尔兰都柏林大学和欧洲分子生物学实验室(EMBL)的研究者共同努力...
Nature Genet:基因组扫描发现小细胞肺癌中SOX2基因突变
2012年9月6日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,科学家们已经完成了一种致命肺癌类型全面基因突变扫描。约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心科学家发现一个名为SOX2的早期胚胎发育相关基因在小细胞肺癌中发生了突变。
Cell:开发出比较表观基因组学方法来研究基因组调节功能
人类基因组测序已产生大量基因信息,但是理解每个基因的功能的目标仍未实现。在一项新研究中,美国伊利诺伊大学研究人员报道,利用一种他们称作“比较表观基因组学(comparative epigenomics)”的新方法就能够确定基因的作用。相关论文研究结果于2012年6月8日发表在《细胞》期刊上。
Am J Pathol:成体干细胞产生新的组织时改变它们的表观基因组
2012年10月9日 讯 /生物谷BIOON/ --在一项研究中,西班牙巴塞罗那市Bellvitge生物医学研究所癌症表观遗传学与生物学项目(Cancer Epigenetics and Biology Program at the Bellvitge Biomedical Research Institute, IDIBELL)主任Manel Esteller和同事们鉴定出成体干细胞产生人体不同
Nat Biotechnol && J Comput Biol:开发出新算法对单细胞基因组进行测序
2012年8月13日 讯 /生物谷BIOON/ --美国加州大学圣地亚哥分校计算机科学家Pavel Pevzner领导的一个国际研究小组开发出一种新的算法来对有机体单个细胞的基因组进行更加快速地和更加准确地测序。这个新的算法被称作SPAdes,能够被用来对不能利用标准克隆技术进行处理的细菌进行测序,其中研究人员将这些细菌称作生命的暗物质,比如医院中发现的一些病原体,在深海或人胃肠道中存在的细菌。