Nature:解析成神经管细胞瘤基因组复杂性
7月25日,Nature杂志以开放论文的形式在线报道了,科学家对成神经管细胞瘤四个不同亚型的基因组特性的深入解析结果。 成神经管细胞瘤是一种侵袭性生长的肿瘤,起源于小脑和延髓/脑干中。它是儿童最常见的恶性脑肿瘤,并显示出显著的生物学和临床表现的异质性。尽管最近在治疗上获得进展,仍有约40%儿童患者的肿瘤复发,30%将死于该疾病。 即使是那些生存下来的患者,生活质量也显著降低。
Nat Biotechnol && J Comput Biol:开发出新算法对单细胞基因组进行测序
2012年8月13日 讯 /生物谷BIOON/ --美国加州大学圣地亚哥分校计算机科学家Pavel Pevzner领导的一个国际研究小组开发出一种新的算法来对有机体单个细胞的基因组进行更加快速地和更加准确地测序。这个新的算法被称作SPAdes,能够被用来对不能利用标准克隆技术进行处理的细菌进行测序,其中研究人员将这些细菌称作生命的暗物质,比如医院中发现的一些病原体,在深海或人胃肠道中存在的细菌。
贺建奎:单细胞基因组学的兴起
上周在美国冷泉港(Cold Spring Harbor)参加了单细胞分析会议(single cell analysis), 这是一个非常令人激动的前沿学术会议,深深的体会到了单细胞基因组学的时代已经来临。 Cold Spring Harbor的会议是公认的高水准的会议,它有几个特点:首先,所做的报告都是最新的研究,组织方特别强调,希望介绍尚未发表的研究进展。
Science:基因组学研究揭示鸽子多样性的遗传基础及其起源历史
(图片来源:Mike Shapiro/University of Utah) 2013年2月1日电 /生物谷BIOON/ -- 由美国犹他大学、深圳华大基因研究院等单位合作完成的鸽子基因组研究成果在《科学》(Science)杂志在线发表。
Nat Cell Biol:全基因组解析人类细胞的分泌过程
在细胞中,不同的基因都处于沉默状态(中间和底部),相比正常细胞(最上面),特殊位点的分泌过程开始进行(绿色代表开始分泌) (Credit: Image courtesy of UCD Conway Institute of Biomolecular & Biomedical Research) 近日,爱尔兰都柏林大学和欧洲分子生物学实验室(EMBL)的研究者共同努力...
Nature Genet:基因组扫描发现小细胞肺癌中SOX2基因突变
2012年9月6日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,科学家们已经完成了一种致命肺癌类型全面基因突变扫描。约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心科学家发现一个名为SOX2的早期胚胎发育相关基因在小细胞肺癌中发生了突变。
基因组学研究揭示癌变细胞进化过程
在世界范围内,临床上七分之一死亡病例是由于罹患癌症。而在西方社会,这一比例更是高达三分之一。很早之前,人们就知道吸烟会导致肺癌,日照会诱发皮肤癌。但是,对于癌变发生的机制和细节,却知之甚少。
Cell:开发出比较表观基因组学方法来研究基因组调节功能
人类基因组测序已产生大量基因信息,但是理解每个基因的功能的目标仍未实现。在一项新研究中,美国伊利诺伊大学研究人员报道,利用一种他们称作“比较表观基因组学(comparative epigenomics)”的新方法就能够确定基因的作用。相关论文研究结果于2012年6月8日发表在《细胞》期刊上。
Plant Cell:植物细胞核基因组完整性的维持
近日,上海生科院植生生态所黄海课题组科研人员与英国剑桥大学及John Innes Centre的Janneke Balk博士研究组合作在国际植物科学领域权威期刊《The Plant Cell》发表了题为“The DUF59 family gene AE7 acts in the cytosolic iron-sulfur cluster assembly pathway to maintain n
武汉植物园葡萄基因组学研究取得新进展
葡萄是世界上第二大果树作物,鲜果及用其加工品葡萄酒一直广受消费者喜爱。随着社会对葡萄需求量进一步增加,如何高效快速地培育优良葡萄品种是目前葡萄产业发展的瓶颈。近年来,通过新一代测序技术和生物信息学手段相结合,对植物基因组结构和特点深入解析,将获得的信息应用于分子辅助或基因工程育种,成为植物品种选育的有效手段。因此,开展葡萄基因组学研究,将极大地促进葡萄产业的发展。