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Nucleic Acids Research:同济大学王晨飞团队开发空间转录组分析算法——STRIDE

近些年,高通量单细胞测序技术的发展,使得研究人员能够在单细胞分辨率研究复杂生物系统中细胞的异质性,但在实验过程中需要经历组织消化等操作,导致细胞在组织中原始位置信息的丢失。新兴的空间转录组学技术则在定量基因表达水平的同时,保留了细胞的空间信息,研究人员得以在空间背景下研究细胞不同的功能状态以及细胞间的相互作用。然而,由于技术的限制,目前大多数空间转录组或是检

2022-03-12

Horticulture Research:植物基因组LTR类转座子分类研究方面取得进展

 转座子是构成基因组重复序列的主要成分。越来越多的研究表明,转座子在决定基因组大小、基因组结构变异、序列突变、基因丢失、基因融合和新编码基因的起源方面,都具有重要的生物学意义。LTR类转座子是植物基因组中占比最高的重复序列类型,它是逆转录转座子的一种。然而目前大部分软件对LTR类转座子仅停留在超科水平(superfamily level),没有提供

2022-02-22

Diabetes Care:一种基于机器学习的算法或能更好地管理糖尿病和心血管疾病风险

来自耶鲁大学等机构的科学家们通过研究开发了一种名为INSIGHT的新型在线工具,其或能为SGLT2抑制剂在开具处方时提供一种机器学习方法,从而让2型糖尿病患者获益最大。

2022-02-14

尿液中的蛋白可作为新冠轻重型的分类标准

  过去两年来,新冠的爆发让全人类措手不及。截至今天,新冠病毒仍然在地球上大部分地区肆虐。凛冬已至,温度骤降,现在已经进入了感冒等流行病毒的高发季节。随着新的突变株奥密克戎(Omicron)的出现,世界上已经有不少国家对此警戒万分,全球人类也需要共同协作,以控制新一轮新冠的爆发。不管是哪一变株流行,其背后的基础研究都是迫切和必要的。尿液分

2022-01-07

Cell:基于“免疫原型”对癌症进行分类或有望帮助开发新型精准个体化癌症免疫疗法

来自加利福尼亚大学等机构的科学家们利用来自300多名患者机体肿瘤的数据描述了12类“免疫原型”(immune archetypes)来对癌症肿瘤进行分类,相关研究结果表明,来自机体不同部位的癌症或许在免疫学上是彼此相似的,这些分类或能为研究人员提供特殊的策略来增强每名患者对癌症免疫疗法的选择。

2022-01-14

Nature Biotechnology:我国科学家发明计算超分辨图像重建算法拓展荧光显微镜分辨率极限

 自2014年诺贝尔化学奖授予了超分辨显微技术以来,超分辨成像技术取得了巨大的进步,成像的分辨率得到了进一步的提高。然而受限于荧光分子单位时间内发出的光子数,超分辨成像技术在时间分辨率和空间分辨率上难于获得同等提高。近日,发表在《Nature Biotechnology》上的一项题为“Sparse deconvolution improves th

2021-12-09

国家药监局发布《体外诊断试剂分类规则》

10月29日,为规范体外诊断试剂分类管理,根据《医疗器械监督管理条例》,国家药监局组织制定了《体外诊断试剂分类规则》,自发布之日起施行。一、起草背景我国医疗器械(含体外诊断试剂)分类实行分类规则指导下的分类目录制,分类规则和分类目录并存,以分类目录优先。与《医疗器械分类规则》不同,此前我局并未将体外诊断试剂分类规则作为单独的文件发布,而是将有关内容先后写入了

2021-10-31

Ssu72-HNF4α信号轴对脂肪性肝炎向肝细胞癌转变的分类

越来越多的证据表明脂肪性肝炎和肝细胞癌之间存在机制联系。然而,缺乏有代表性的动物模型阻碍了理解脂肪性肝炎相关肝癌的病理生理机制的努力。

2021-10-26

Nature:基于tau蛋白细丝折叠对人类tau蛋白病进行分类

2021年10月5日讯/生物谷BIOON/---错误折叠的tau蛋白在细丝中的异常积累是许多神经退行性疾病的特征---正是因为这个原因,这些神经退行性疾病被统称为tau蛋白病(tauopathy)。英国剑桥医学研究委员会分子生物学实验室的Michel Goedert团队和Sjors Scheres团队在彼此之间的长期合作中见证了利用低温电镜(cryo-EM)

2021-10-05

昆虫分类与进化研究取得新进展

近日,西北农林科技大学植物保护学院鳞翅目系统学研究团队在秆野螟属Ostrinia昆虫分类、形态特征演化及寄主适应性进化研究中取得重要进展,该研究在昆虫学《Systematic Entomology》上发表了题为 “Revisiting the evolution of Ostrinia moths with phylogenomics (Pyraloidea

2021-09-23