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Cell:AI时代的蛋白质从头设计

该文章讨论了基于物理学的建模方法和人工智能(AI)相结合的背景下,蛋白质从头设计领域的当前状态。

2024-12-26

David Baker最新论文:从头设计Hsp70激活剂,溶解细胞内凝聚体

在这项最新研究中,研究团队描述了从头设计的 Hsp70 结合蛋白,这些蛋白要么抑制要么激活 Hsp70 的 ATP 酶活性。

2025-02-09

David Baker再获里程碑突破——AI首次从头设计出蛋白酶

该研究利用 AI 从头设计了具有复杂活性位点的丝氨酸水解酶,这也是首次从头设计一种新的酶,其能够加快一个四步化学反应,该反应对于许多生物和工业过程至关重要,其中包括塑料降解和回收。

2025-02-18

模拟5亿年进化,从头创造出全新荧光蛋白,重新点亮生物学

ESM3 是一款向生命科学领域的前沿人工智能语言模型,也是第一个同时对蛋白质的序列、结构和功能进行推理的生成式人工智能模型,它提升了我们利用生命密码进行编程和创造的能力。

2025-03-28

David Baker团队利用生成式AI从头设计抗体

RFdiffusion是对当前的蛋白质设计方法的一次综合改进,能从头设计总长度达600个氨基酸残基的蛋白,且实现了前所未有的复杂性和准确度。

2024-10-11

Cell:David Baker团队从头设计可口服的迷你抗体,治疗自身炎症性疾病

研究表明,口服给药的从头设计的微型结合剂能够穿过肠道上皮屏障到达治疗靶点,具有高效能、胃肠道稳定性和易于制造的特点。

2024-10-11

西湖大学王怀民/黄晶团队利用AI从头设计抗菌肽,破解抗生素耐药难题

该研究展示了具有特定生物学功能的自组装功能多肽的设计,相比传统方法依赖于天然氨基酸和经验规则,TransSAFP 整合了非天然氨基酸修饰,拓展了多肽的化学空间,且自组装特性增强了局部浓度效应。

2025-03-19

西湖大学王怀民/黄晶团队利用AI从头设计抗菌肽,破解抗生素耐药难题

在这项新研究中,研究团队开发了一种基于深度学习的迁移学习模型——TransSAFP,该模型仅依靠少量实验工作对样本进行注释,就能有效地预测自组装功能多肽(SAFP)的功能活性。 

2025-03-22