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安捷伦基因组学系列讲座 —— 安捷伦RNA和DNA平行测序文库构建方案,一天当作两天用

利用DNA和RNA的平行靶向测序可以比对序列差异、验证基因融合,检测DNA突变的关联基因表达水平变化。利用SureSelect XT HS2 RNA建库试剂盒,结合之前推出的 XT HS2 DNA试剂盒就可以轻松实现DNA和RNA的平行建库,实现上述应用。

之前我们已经介绍过XT HS2 DNA建库方案,本期将要介绍的SureSelect XT HS2 RNA 试剂盒是安捷伦最新推出的一款链特异性,靶向富集的RNA文库构建试剂盒。该试剂盒针对低起始量的FFPE样品进行了优化,样品起始量可低至10ng;试剂盒提供384对双端样本标签,接头序列中引入了分子标签,极大降低了测序中标签跳跃问题, 在去除Duplication时更准确;该试剂盒对整体建库流程进行了优化,建库时间缩短至11个小时。SureSelect XT HS2 RNA与SureSelect XT HS2 DNA采用同一建库流程,两款试剂盒的配套使用可以实现DNA和RNA的平行建库。

直播时间:2020-11-26

单细胞分析主题之ICP-MS/MS创新应用网络讲座

题目一:《ICP-MS在单细胞水平金属相关分析研究应用新进展》
在单细胞中金属及其形态(聚集态)分析领域以下几个方面的研究进展:
1.基于流式进样,采用时间分辩ICP-MS对单细胞(Hela)铬形态Cr(III)和Cr(VI)的摄取进行研究及其胞内分布进行分析;
2.通过采用一种三维微交叉液滴发生系统与时间分辨ICP-MS在线联用系统,对单个细胞对金纳米粒子的摄取及胞内分布进行测定,从而揭示了MCF-7细胞在摄取金纳米粒子时存在的明显异质性研究的进展;
3.借助流体的惯性效应,通过平面和三维螺旋通道-惯性流辅助,操控粒子的运动路径,从而实现单细胞/颗粒排列,以及高通量单细胞进样。结合ICP-MS对单细胞对金属纳米粒子的摄取及分布进行研究和分析。

题目二:《ICP-MS在人体细胞多元素分析中的应用》
近年来,国内外有很多学者采用ICP-MS技术进行生物体中单细胞的分析,利用ICP-MS对于超痕量元素的检测能力,对于单个细胞中的特定元素进行有效的定量和研究。S和P作为生物体细胞中的重要元素组成,在进行ICP-MS分析时受到严重的多原子离子干扰,本报告采用ICP-MS/MS技术,利用该仪器两级串联质谱的质量筛选功能,以及多元素同时扫描的方式,分别对大鼠红细胞以及人体细胞中的S和P进行测试,通过与商品化细胞的参考值进行比对,证明了该方法对于定量单细胞中的元素含量具有良好的准确性。

直播时间:2020-06-16

安捷伦基因组学系列讲座:安捷伦最新二代测序建库方案,攻克 FFPE、液态活检等复杂样本的难题答疑

随着样本量增加,高通量测序平台,如 NovaSeq 被越来越多的采用,而标签跳跃问题、样本标签数目限制混样数量等问题也随之而来。而随着精准医疗的发展,肿瘤样本,特别是FFPE样本、液态活检样本的测序需求越来越大,但建库环节、PCR环节、测序本身的错误率,以及前面提到的标签跳跃问题都限制了低频变异的检出,给测序服务与产品的开发带来难题。

本次讲座将介绍安捷伦最新推出的 SureSelect XT HS2 DNA 试剂盒,看它如何破解上述难题,并为使用者带来最大的灵活性。

本次讲座将覆盖:
* SureSelect XT HS2 DNA Reagent Kit 的特点与实际表现
* SureSelect XT HS2 DNA Reagent Kit 如何解决标签跳跃问题
* SureSelect XT HS2 DNA Reagent Kit 如何降低假阳性读数,提升结果准确性
* SureSelect XT HS2 DNA Reagent Kit 的其它灵活性能
* 安捷伦二代测序整合解决方案

直播时间:2020-03-17

安捷伦基因组学系列讲座 —— 超长片段 DNA 样本分离与质控的终极解决方案

脉冲场电泳可以分离几十 Kb 的超长片段 DNA,然而传统的脉冲场电泳动辄就要运行过夜,实验结果还受诸多外界因素影响。当样本量很大,时间是个关键因素时,该如何解决?本次讲座,我们将向您系统阐述脉冲场电泳的基本原理,您将了解到最先进的十倍于传统脉冲场电泳速度的 Femto Pulse 全自动脉冲场电泳系统,以及 Femto Pulse 系统如何解决三代测序样本质量控制的问题。
讲座概要:
1. 脉冲场电泳的基本原理
2. 安捷伦 Femto Pulse 全自动脉冲场电泳系统
3. 全自动脉冲场电泳系统用于三代测序的样本质量控制

直播时间:2019-12-18

安捷伦基因组学系列讲座:二代测序文库构建新理念

实验室样本量增加了,原先的机械打断仪不够用了,再买一台又没有预算,怎么办?样本来源过于稀有,初始样本量不足以支撑常规建库方法,怎么办?趋动基因的突变频率低,接近测序错误率,无法区分是真实突变还是系统错误,怎么办?安捷伦文库构建新方案,帮你省去机械打断仪,让用户获得更好的文库复杂性和覆盖率,解决低起始量样本建库问题,有效区分真实突变与系统错误,并实现快速文库构建。新方案,新理念,新高度。
本次讲座将覆盖:
* 安捷伦高随机性酶切片段化方案
* 安捷伦 SureSelect XT HS/Low Input 分子标签与低起始量建库方案

直播时间:2019-11-27

CST肿瘤微环境主题系列讲座 第三讲:细胞骨架、细胞基质动态调控及EMT

肿瘤微环境(Tumor microenvironment, TME),即肿瘤细胞产生和生活的内环境,其中不仅包括了肿瘤细胞本身,还有与肿瘤细胞有密切联系的成纤维细胞、免疫和炎性细胞、胶质细胞等各种细胞,同时也包括附近区域内的细胞间质、微血管以及浸润在其中的生物分子。肿瘤微环境长期以来都是肿瘤研究当中一个关键和核心的方向,对于认识肿瘤的发生、发展、转移等过程有着重要的意义,而且对于肿瘤的诊断、防治和预后亦有着重要的作用。

第三讲将重点介绍与细胞骨架、细胞基质动态调控及EMT相关的主要调节分子和信号通路,并为各位听众提供在上述领域的主要评价指标作为参考。大家可以访问CST官方网站肿瘤微环境主题页面http://learn.cst-c.com.cn/tme,下载相关讲座PPT及高清信号通路图,全面了解肿瘤微环境研究相关知识和CST研究工具。

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直播时间:2019-05-23

CST肿瘤微环境主题系列讲座 第二讲:肿瘤免疫微环境

肿瘤微环境(Tumor microenvironment, TME),即肿瘤细胞产生和生活的内环境,其中不仅包括了肿瘤细胞本身,还有与肿瘤细胞有密切联系的成纤维细胞、免疫和炎性细胞、胶质细胞等各种细胞,同时也包括附近区域内的细胞间质、微血管以及浸润在其中的生物分子。肿瘤微环境长期以来都是肿瘤研究当中一个关键和核心的方向,对于认识肿瘤的发生、发展、转移等过程有着重要的意义,而且对于肿瘤的诊断、防治和预后亦有着重要的作用。

第二讲将重点介绍肿瘤免疫微环境相关的主要参与细胞、调节分子和信号通路,并为各位听众提供在上述领域的主要评价指标和新的研究方法作为参考。大家可以访问CST官方网站肿瘤微环境主题页面http://learn.cst-c.com.cn/tme,下载相关讲座PPT及高清信号通路图,全面了解肿瘤微环境研究相关知识和CST研究工具。

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直播时间:2019-04-24

CST肿瘤微环境主题系列讲座第一讲:缺氧代谢与血管生成

肿瘤微环境(Tumor microenvironment, TME),即肿瘤细胞产生和生活的内环境,其中不仅包括了肿瘤细胞本身,还有与肿瘤细胞有密切联系的成纤维细胞、免疫和炎性细胞、胶质细胞等各种细胞,同时也包括附近区域内的细胞间质、微血管以及浸润在其中的生物分子。肿瘤微环境长期以来都是肿瘤研究当中一个关键和核心的方向,对于认识肿瘤的发生、发展、转移等过程有着重要的意义,而且对于肿瘤的诊断、防治和预后亦有着重要的作用。

第一讲将重点介绍肿瘤微环境当中缺氧代谢与血管生成相关的调节分子和信号通路,并为各位听众提供在上述领域的主要评价指标作为参考。大家可以访问CST官方网站肿瘤微环境主题页面http://learn.cst-c.com.cn/tme,下载相关讲座PPT及高清信号通路图,全面了解肿瘤微环境研究相关知识和CST研究工具。

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直播时间:2019-04-04