中科新生命:生命表型体现者,从“代谢到脂质到修饰”组学专场报告
报告一:《代谢组学入门—从检测分析到数据挖掘》13:30-14:30 代谢组学是系统生物学下游的重要组成部分,在biomarker筛选方面具有独特优势,也是病理/药理机制研究的突破口,同时也可以对转录组或蛋白组学的结果做进一步的验证和挖掘,因此在近几年研究中日益突显出其重要的价值。由于小分子代谢物在理化性质、生物变化等方面的特殊性,代谢组的检测分析方法与数据挖掘均与其他组学有较大的差异。 报告二:《脂质组学--新兴崛起的研究领域,高分研究的“捷径”》14:30-15:30 国家自然科学基金委公布的“十三五”发展规划中,“糖脂代谢的稳态与功能调控机制”被列为生命科学优先发展领域。2010年,脂质组被《Cell》杂志预测为是继基因组学、蛋白质组学之后的一大新兴崛起的研究领域。从目前发表的文章来看,单个脂质组学就发表在《Nature Medicine》等顶级期刊上,是当之无愧的高分“捷径”。 报告三:《修饰组学--解析代谢改变背后的调控机制》15:30-16:30 从文章发表角度,单个代谢组已经很难满足高水平杂志的要求;从研究意义的角度,我们进一步关心代谢变化背后的分子调控机制是什么。多篇CNS等顶级期刊中已经报道,乙酰化、磷酸化等修饰是代谢调节的关键机制。因此,修饰当仁不让的成为代谢机制研究的最重要方向,而“代谢组”+“修饰组”更将是打通表型与机制与的最有效手段。
打通表型与调控机制的代谢通路 —— 翻译后修饰组 + 代谢组联合分析
(1) “多”组学联合分析(TransOmics)逐渐成为近几年文献发表和国自然申请的新风向标 —— 新技术、新思路、新突破; (2) 从翻译后修饰角度出发进行代谢研究,叫做表型验证;从代谢角度出发进行翻译后修饰研究,叫做机制研究; (3) 如何打通“表型”和“机制”之间高效的沟通桥梁?如何从高通量组学产生的大数据中挖掘最有效的信息? (4) 本期报告将为您一一解答,并向您介绍修饰组学与代谢组学之间是如何进行相关性分析的。
使用安捷伦SeahorseXF分析仪实时分析功能代谢表型以进行干细胞研究
细胞能量代谢和干细胞功能调控之间存在明确的关联性。近期研究数据表明,需要将代谢表型从相对以糖酵解为主转变为相对以氧化磷酸化为主,以分化为特定细胞(例如神经细胞)。这个过程在细胞从相对增殖状态进入通常的分解代谢、已分化状态时发生。目前的研究工作主要集中在利用代谢技术手段调控细胞,从而促进特定细胞谱系分化。安捷伦 Seahorse XF 分析仪通过对两个重要细胞通路的速率进行定量,来测定代谢表型。安捷伦采用活细胞和无创无损的方式进行测定。目前,研究人员正在运用该技术确定细胞分化时的最优代谢表型。本演示文稿将介绍这些领域中的最新研究,以及在这些研究中用于评估相对代谢平衡的代谢表型分析的基本原理。