蜜蜂及其真菌病原的纳米孔全长转录组研究
高通量的RNA测序方法在生成全长转录本时常常由于逆转录的过早终止而存在困难,由于大多数传统测序方法需要进行片段化,准确组装完整的转录本仍然存在困难。纳米孔长读长测序技术,不需要进行长度选择,整个转录可以进行单读长的端到端测序,能够实现简单、准确的组装,区分高度相似的异构体、识别新转录本及不同转录本之间的差异表达。
福建农林大学蜜蜂保护课题组/蜜蜂-病原互作机制科研创新团队陈大福老师和郭睿老师与百迈客生物科技有限公司共同合作,利用纳米孔超高通量测序平台PromethION,对蜜蜂的两种主要真菌病原东方蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)和蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis)进行纳米孔全长转录组研究,显著提高了东方蜜蜂微孢子虫的转录组质量并为完善蜜蜂球囊菌的转录组和基因组以及探究转录本的可变剪接和可变多聚腺苷酸化提供了宝贵资源。研究成果发表在预印网站《BioRxiv》。
DOI:https://doi.org/10.1101/2020.03.11.987271
7月22日,我们邀请到福建省养蜂学会副秘书长,福建农林大学校蜂疗研究所副所长,院实验室副主任,校硕士生导师团队带头人郭睿,北京百迈客高级产品经理马晶,在线上分享他们利用纳米孔长读长测序平台进行全长转录组研究的经验和成果。
会议日程
时间 | 主题 | 讲师 |
15:00-15:20 | 欢迎与纳米孔测序技术与应用介绍 | 王 海 Oxford Nanopore 战略客户经理 |
15:20-15:55 | 蜜蜂及其真菌病原的ONT全长转录组研究 | 郭睿 福建农林大学 |
15:55-16:00 | 在线答疑 | 郭睿 福建农林大学 |
16:00-16:25 | ONT全长转录组的产品优势及应用场景 | 马晶 北京百迈客高级产品经理 |
16:25-16:30 | 在线问答与结束致辞 | 马晶 北京百迈客高级产品经理 |
直播时间:2021-07-22