安捷伦基因组学系列讲座 —— 安捷伦RNA和DNA平行测序文库构建方案,一天当作两天用
利用DNA和RNA的平行靶向测序可以比对序列差异、验证基因融合,检测DNA突变的关联基因表达水平变化。利用SureSelect XT HS2 RNA建库试剂盒,结合之前推出的 XT HS2 DNA试剂盒就可以轻松实现DNA和RNA的平行建库,实现上述应用。
之前我们已经介绍过XT HS2 DNA建库方案,本期将要介绍的SureSelect XT HS2 RNA 试剂盒是安捷伦最新推出的一款链特异性,靶向富集的RNA文库构建试剂盒。该试剂盒针对低起始量的FFPE样品进行了优化,样品起始量可低至10ng;试剂盒提供384对双端样本标签,接头序列中引入了分子标签,极大降低了测序中标签跳跃问题, 在去除Duplication时更准确;该试剂盒对整体建库流程进行了优化,建库时间缩短至11个小时。SureSelect XT HS2 RNA与SureSelect XT HS2 DNA采用同一建库流程,两款试剂盒的配套使用可以实现DNA和RNA的平行建库。
安捷伦基因组学系列讲座:二代测序文库构建新理念
实验室样本量增加了,原先的机械打断仪不够用了,再买一台又没有预算,怎么办?样本来源过于稀有,初始样本量不足以支撑常规建库方法,怎么办?趋动基因的突变频率低,接近测序错误率,无法区分是真实突变还是系统错误,怎么办?安捷伦文库构建新方案,帮你省去机械打断仪,让用户获得更好的文库复杂性和覆盖率,解决低起始量样本建库问题,有效区分真实突变与系统错误,并实现快速文库构建。新方案,新理念,新高度。
本次讲座将覆盖:
* 安捷伦高随机性酶切片段化方案
* 安捷伦 SureSelect XT HS/Low Input 分子标签与低起始量建库方案
AgilentV1高通量前处理技术助力NGS文库构建
伴随着生物及分析实验的成熟,建立了众多成熟复杂的实验平台,无论是化合物筛选、二代测序文库构建、微量蛋白筛选纯化、液相质谱样品前处理,复杂的移液操作和海量的样品都使得实验人员力不从心,自动化的普及除了能摆脱重复劳动,解放双手,更能高质量高通量的完成这些实验,提高重新性。安捷伦自动化解决方案,不仅有高精度高可靠性易维护的硬件基础,更有简单易学的软件操作,无需编程基础即可轻松上手。