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生物信息学:如何使用纳米孔数据对基因组甲基化进行检测和定相

表观遗传学是有关化学修饰的研究,这是一个正在蓬勃发展的研究领域,研究人类表观遗传修饰(包括对 DNA、RNA 和组蛋白的修饰)对于很多领域具有重要意义。然而,传统检测表观遗传学的技术存在一些局限性。例如,短读长测序技术包含聚合酶链式反应 (PCR),在这期间会丢失表观遗传修饰。由于其不能对甲基化直接测序,因此在测序前需要对 DNA 样本进行化学处理,以此推断甲基化的存在。 纳米孔测序可在无需 PCR 的情况下,制备和测序天然 DNA 和 RNA 分子。这样就可以在检测核苷酸序列的同时直接检测完整甲基化,无需任何化学转化或额外的文库制备步骤。端到端的纳米孔工作流程具备简单的文库制备流程,结合灵活的测序选项,可满足各类实验目标,针对靶向区域或人类全基因组提供了前所未有的甲基化解决方案。

11.23日,来自Oxford Nanopore 应用团队的生物信息学家Philip将为大家介绍如何使用纳米孔数据对基因组甲基化进行检测和定相,主要内容有:
甲基化定义及其重要性
如何进行甲基化分析,需要什么样的数据,读长建议
利用纳米孔测序技术进行甲基化检测的结果与分析

直播时间:2021-11-23

使用Nanopore技术从头组装药用植物地黄基因组

中国拥有丰富的药用植物资源,对药用植物的使用、栽培历史悠久,测序行业的不断发展推动药用植物的研究,加速了传统的研究方法向微观分子水平的转变。由贝纳基因主导,多家单位共同参与的千种药用植物基因组数据库于2021年6月正式上线:www.herbgenome.com ,目前已收录100+种药用植物基因组数据。

继9月9日湖北中医药大学研究员、博士生导师刘义飞老师的“黄连基因组揭示了小檗碱多样性"和9月16日深圳中国科学院仙湖植物园万涛研究员的“百岁兰基因组揭示其在沙漠极端干旱环境下的长寿机制”之后,9月23日,我们邀请到武汉贝纳科技有限公司项目总监牛妍博士,带来“使用Nanopore技术从头组装药用植物地黄基因组”的在线技术讲座。

会议日程

时间 主题 讲师
15:00-15:15 欢迎与纳米孔测序技术介绍 王小薇 Oxford Nanopore 大客户经理
15:15-15:55 使用Nanopore技术从头组装药用植物地黄基因组 牛妍博士 武汉贝纳科技有限公司项目总监
15:55-16:00 在线答疑 all

直播时间:2021-09-23

安捷伦磁珠大批量使用中的优化建议

磁珠作为化学发光产品及其他目标物分离应用中的关键组分,已广泛使用于各研发机构,但是在转产及大批量使用过程中仍会遇到各种挑战。本次讲座将以客户的角度来提供建议,探讨大体积磁珠操作过程中的各注意事项,避免踩雷,节约宝贵的产品开发时间。

直播时间:2020-07-31

Oxoid微生物培养基原料产品及使用技巧

提到Oxoid微生物培养基,只知道胰(酪)蛋白胨和酵母(粉)提取物?那你该来听课了!作为教科书级的培养基,Oxoid针对不同需求的各式微生物都有很好的产品方案。有了好产品,当然要用得好才行,但是培养基使用中的那些坑,你了解吗?这里还有一些微生物培养基使用技巧的分享。

直播时间:2019-10-10

实验室生物安全管理及主要设备使用维护

无论你是生物实验室的新人、实验室主管,还是企业高管,不管你在意与否,每天都会涉及实验室安全问题。

什么是实验室安全管理?
如何通过日常设备保护人员和样品的安全?
如何使用和维护保养好相关设备?

欢迎参加《实验室生物安全管理及主要设备使用维护》网络课程。本课程通过生动案例讲解、视频和讨论,帮助您轻松了解和掌握实验室安全管理基本概念,更好的使用和维护生物安全设备。

真正帮你做到“安全你我他,幸福一家门!”

直播时间:2018-04-20

使用安捷伦SeahorseXF分析仪实时分析功能代谢表型以进行干细胞研究

细胞能量代谢和干细胞功能调控之间存在明确的关联性。近期研究数据表明,需要将代谢表型从相对以糖酵解为主转变为相对以氧化磷酸化为主,以分化为特定细胞(例如神经细胞)。这个过程在细胞从相对增殖状态进入通常的分解代谢、已分化状态时发生。目前的研究工作主要集中在利用代谢技术手段调控细胞,从而促进特定细胞谱系分化。安捷伦 Seahorse XF 分析仪通过对两个重要细胞通路的速率进行定量,来测定代谢表型。安捷伦采用活细胞和无创无损的方式进行测定。目前,研究人员正在运用该技术确定细胞分化时的最优代谢表型。本演示文稿将介绍这些领域中的最新研究,以及在这些研究中用于评估相对代谢平衡的代谢表型分析的基本原理。

直播时间:2017-11-07