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安捷伦基因组学系列讲座:二代测序文库构建新理念

实验室样本量增加了,原先的机械打断仪不够用了,再买一台又没有预算,怎么办?样本来源过于稀有,初始样本量不足以支撑常规建库方法,怎么办?趋动基因的突变频率低,接近测序错误率,无法区分是真实突变还是系统错误,怎么办?安捷伦文库构建新方案,帮你省去机械打断仪,让用户获得更好的文库复杂性和覆盖率,解决低起始量样本建库问题,有效区分真实突变与系统错误,并实现快速文库构建。新方案,新理念,新高度。

2019-11-27 课时:43分钟

安捷伦基因组学系列讲座 —— 超长片段 DNA 样本分离与质控的终极解决方案

脉冲场电泳可以分离几十 Kb 的超长片段 DNA,然而传统的脉冲场电泳动辄就要运行过夜,实验结果还受诸多外界因素影响。当样本量很大,时间是个关键因素时,该如何解决?本次讲座,我们将向您系统阐述脉冲场电泳的基本原理,您将了解到最先进的十倍于传统脉冲场电泳速度的 Femto Pulse 全自动脉冲场电泳系统,以及 Femto Pulse 系统如何解决三代测序样本质量控制的问题。

2019-12-18 课时:43分钟

安捷伦基因组学系列讲座:安捷伦最新二代测序建库方案,攻克 FFPE、液态活检等复杂样本的难题

随着样本量增加,高通量测序平台,如 NovaSeq 被越来越多的采用,而标签跳跃问题、样本标签数目限制混样数量等问题也随之而来。而随着精准医疗的发展,肿瘤样本,特别是FFPE样本、液态活检样本的测序需求越来越大,但建库环节、PCR环节、测序本身的错误率,以及前面提到的标签跳跃问题都限制了低频变异的检出,给测序服务与产品的开发带来难题。 本次讲座将介绍安捷伦最新推出的 SureSelect XT HS2 DNA 试剂盒,看它如何破解上述难题,并为使用者带来最大的灵活性。 本次讲座将覆盖: * SureSelect XT HS2 DNA Reagent Kit 的特点与实际表现 * SureSelect XT HS2 DNA Reagent Kit 如何解决标签跳跃问题 * SureSelect XT HS2 DNA Reagent Kit 如何降低假阳性读数,提升结果准确性 * SureSelect XT HS2 DNA Reagent Kit 的其它灵活性能 * 安捷伦二代测序整合解决方案

2020-03-03 课时:55分钟

生物谷空中讲坛:单细胞多组学分析论坛

组织中细胞的异质性已经是大家的共识,近年来,研究人员从细胞的基因组、 转录组、蛋白组及代谢组多组学等多个层面去研究生殖发育、肿瘤转移、器官病变、肿瘤微环境的机制。然而,在单细胞水平同时完成多个组学的测序分析依然是一个较大的挑战。同时,随着基础研究和技术的进一步发展,单细胞组学在多个疾病领域的应用也逐步受到更多关注。

2020-04-16 课时:114分钟

毛细管区带电泳-质谱技术应用于自下而上蛋白质组学研究

研究蛋白质组在不同生物状态下的动态变化对于阐明蛋白质在疾病发生与发展过程中的作用极其的重要。基于质谱的自下而上蛋白质组学方法已经被广泛的应用于各种生物问题的研究。在线反相色谱质谱(RPLC-MS)一般是蛋白质组学研究的首选技术。目前,基于RPLC-MS的自下而上蛋白质组学方法并不完美, 还有一些技术挑战亟待解决。 首先,大规模的准确的区分蛋白质变体 (protein isoforms) 非常困难,因为大多数蛋白质的鉴定仅仅是依赖于有限的几条肽段。进一步改进肽段分离的峰容量有望改善蛋白质变体的表征。其次,单细胞蛋白质组分析极具挑战,因为目前的RPLC-MS技术的灵敏度还相差甚远。发展更高灵敏度的蛋白质组学方法势在必行。毛细管区带电泳质谱技术(CZE-MS) 被认为是另一个自下而上蛋白质组学的重要工具,因为它可以实现高效的肽段分离以及高灵敏度的肽段检测。 在此次演讲中,将介绍应用新型超低流速鞘流液接口和离子源(深圳市永道致远科学技术有限公司CMP Scientific品牌EMASS-II ion source)的CZE-MS技术而开发的蛋白质组学方法,并对蛋白质组学的历史及其主要挑战和机遇,对如何提高CZE-MS对蛋白质组学的灵敏度和峰容量的方法进行讨论,和对基于CZE-MS的蛋白质组学的未来发展方向进行一些思考。

2020-06-03 课时:63分钟

毛细管区带电泳-质谱技术应用于自下而上蛋白质组学研究

研究蛋白质组在不同生物状态下的动态变化对于阐明蛋白质在疾病发生与发展过程中的作用极其的重要。基于质谱的自下而上蛋白质组学方法已经被广泛的应用于各种生物问题的研究。在线反相色谱质谱(RPLC-MS)一般是蛋白质组学研究的首选技术。目前,基于RPLC-MS的自下而上蛋白质组学方法并不完美, 还有一些技术挑战亟待解决。 首先,大规模的准确的区分蛋白质变体 (protein isoforms) 非常困难,因为大多数蛋白质的鉴定仅仅是依赖于有限的几条肽段。进一步改进肽段分离的峰容量有望改善蛋白质变体的表征。其次,单细胞蛋白质组分析极具挑战,因为目前的RPLC-MS技术的灵敏度还相差甚远。发展更高灵敏度的蛋白质组学方法势在必行。毛细管区带电泳质谱技术(CZE-MS) 被认为是另一个自下而上蛋白质组学的重要工具,因为它可以实现高效的肽段分离以及高灵敏度的肽段检测。 在此次演讲中,将介绍应用新型超低流速鞘流液接口和离子源(深圳市永道致远科学技术有限公司CMP Scientific品牌EMASS-II ion source)的CZE-MS技术而开发的蛋白质组学方法,并对蛋白质组学的历史及其主要挑战和机遇,对如何提高CZE-MS对蛋白质组学的灵敏度和峰容量的方法进行讨论,和对基于CZE-MS的蛋白质组学的未来发展方向进行一些思考。

2020-06-03 课时:58分钟

PTMScan® HS:CST新一代修饰蛋白质组学解决方案

PTMScan® 技术是 Cell Signaling Technology 科学家们开发的用于检测蛋白翻译后修饰(Post-Translational Modification,PTM)的实验方法。它结合了抗体富集PTM肽与液相色谱-质谱(LC-MS/MS)检测肽的技术,解决了PTM肽在酶消化后样品中呈现低丰度而无法被检测到的难题。PTMScan® 系列实验工具是针对不同的PTM肽的免疫亲和纯化试剂盒。 本讲座会介绍最新产品,包括新一代PTMScan® HS(High Sensitivity, High Specificity, High Simplicity 高灵敏度, 高特异性,高度简化)泛素化/小类泛素化试剂盒,也会介绍对研究工具及方法的优化及其应用。 嘉宾简介: 朱奕颖 博士(CST),2014年在美国Brown大学获得博士学位,之后在哈佛牙医学院附属Forsyth研究所质谱中心从事博士后研究。2015年加入美国Cell Signaling Technology (CST) 公司总部。现任CST资深科学家,主要负责蛋白质组学类新产品的研发。 已有十几年蛋白质组学研究经验,有丰富的质谱应用类产品及质谱服务开发经验,深谙实验痛点及技术难点,熟悉各类方法的细节及其应用,并为研究者提供切实可行的解决方案。

2020-08-12 课时:44分钟

布鲁克-核磁共振在生物样本代谢组学研究中的新进展和新应用

作为生物样本代谢组学研究的两大利器之一,近年来核磁共振技术的发展,尤其是在高度自动化、标准化和精确定量等方面的突破,促进了代谢组学在慢病转化研究中的新应用。 本报告将分享Bruker Biospin最新发布的疾病诊断研究(IVDr)方案,包括一键式全自动地完成人体体液样本的核磁数据采集、代谢物定性定量和疾病诊断研究,并将分享在心脑血管疾病、癌症、遗传代谢病、精准营养和新冠肺炎中的重要应用。 敬请期待。

2020-09-16 课时:55分钟

安捷伦基因组学系列讲座 —— 安捷伦RNA和DNA平行测序文库构建方案,一天当作两天用

利用DNA和RNA的平行靶向测序可以比对序列差异、验证基因融合,检测DNA突变的关联基因表达水平变化。利用SureSelect XT HS2 RNA建库试剂盒,结合之前推出的 XT HS2 DNA试剂盒就可以轻松实现DNA和RNA的平行建库,实现上述应用。 之前我们已经介绍过XT HS2 DNA建库方案,本期将要介绍的SureSelect XT HS2 RNA 试剂盒是安捷伦最新推出的一款链特异性,靶向富集的RNA文库构建试剂盒。该试剂盒针对低起始量的FFPE样品进行了优化,样品起始量可低至10ng;试剂盒提供384对双端样本标签,接头序列中引入了分子标签,极大降低了测序中标签跳跃问题, 在去除Duplication时更准确;该试剂盒对整体建库流程进行了优化,建库时间缩短至11个小时。SureSelect XT HS2 RNA与SureSelect XT HS2 DNA采用同一建库流程,两款试剂盒的配套使用可以实现DNA和RNA的平行建库。

2020-11-30 课时:33分钟

单细胞多组学系列论坛之肿瘤研究

肿瘤与免疫是生物体内最复杂的生理环境,由于细胞存在异质性,即使是处于同一阶段的同一种肿瘤细胞,不同的患者间细胞内基因和蛋白的表达也有可能完全不同。即使是同一个病人体内,表达水平也是呈现持续动态变化的,在不同时期或肿瘤组织的不同部位,也很可能有着很大的差异。随着单细胞测序技术和空间多组学突飞猛进的发展,越来越多的证据表明,基于单细胞基因组学和蛋白组学的研究,能够提供前所未有的临床和科研大数据,在单细胞水平上的多组学分析,有助于识别和理解细胞类型和细胞亚群之间的差异,这在发现癌症如何扩散,或如何在再生医学中最佳地利用特化细胞方面非常重要。 在此背景下,生物谷携手10x Genomics和上海伯豪生物技术有限公司的专家组共同举办本次论坛,希望通过本次论坛能够与从事单细胞多组学研究和应用领域的行业人士结成更广泛的交流与合作,通过单细胞多组学技术对肿瘤异质性、肿瘤和免疫微环境、生物标志物发现和治疗展开研究与探讨,为开发出更有效的个性化肿瘤治疗药物或手段助力。 主要话题:运用新兴的单细胞组学研究手段,揭示个体差异的分子基础,阐明肿瘤疾病的发病机制和病因等领域前沿科学问题;单细胞层次的多组学分析在识别和理解细胞类型和细胞亚群之间的关系;基于单细胞多组学技术的新方法、新技术等创新性研究。

2021-04-08 课时:75分钟