使用Nanopore技术从头组装药用植物地黄基因组
中国拥有丰富的药用植物资源,对药用植物的使用、栽培历史悠久,测序行业的不断发展推动药用植物的研究,加速了传统的研究方法向微观分子水平的转变。
单细胞蛋白组技术在CAR-T细胞治疗中的应用
要点: 1.单细胞功能蛋白组学技术背景介绍 2.细胞多功能指数PSI:重要的评价标尺 3.细胞治疗开发案例分享 4.软件及数据分析简介
时空组学如何带来生命科学领域第三次科技革命?
华大STOmics™技术的诞生,突破了现有空间技术分辨率和检测组织大小的限制,成为全球领先能同时实现“亚细胞级分辨率”和“厘米级全景视场”的原位捕获空间转录组测序技..
生物信息学:如何使用纳米孔数据对基因组甲基化进行检测和定相
表观遗传学是有关化学修饰的研究,这是一个正在蓬勃发展的研究领域,研究人类表观遗传修饰(包括对 DNA、RNA 和组蛋白的修饰)对于很多领域具有重要意义。然而,传统检测表观遗传学的技术存在一些局限性。例如,短读长测序技术包含聚合酶链式反应 (PCR),在这期间会丢失表观遗传修饰。由于其不能对甲基化直接测序,因此在测序前需要对 DNA 样本进行化学处理,以此推断甲基化的存在。 纳米孔测序可在无需 PCR 的情况下,制备和测序天然 DNA 和 RNA 分子。这样就可以在检测核苷酸序列的同时直接检测完整甲基化,无需任何化学转化或额外的文库制备步骤。端到端的纳米孔工作流程具备简单的文库制备流程,结合灵活的测序选项,可满足各类实验目标,针对靶向区域或人类全基因组提供了前所未有的甲基化解决方案。 11.23日,来自Oxford Nanopore 应用团队的生物信息学家Philip将为大家介绍如何使用纳米孔数据对基因组甲基化进行检测和定相,主要内容有: 甲基化定义及其重要性 如何进行甲基化分析,需要什么样的数据,读长建议 利用纳米孔测序技术进行甲基化检测的结果与分析
单细胞多组学测序技术在免疫生物学的应用
人体的免疫系统是一个非常庞大,而且非常分散、各自为政的守卫大军。这数十亿分工明确的特殊细胞在不停地运动,守护着人体的安全,由于技术和方法的制约,要确定哪些细胞..
“前沿研究:利用纳米孔测序进行快速病原体基因组监测” 空中讲坛
纳米孔测序提供了传染病样本全面、实时的洞察,能立即获得有效控制传染病爆发所需的关键基因组流行病学数据。 7月14日,Oxford Nanopore将举办“前沿研究:利用快速纳米孔测序进行病原体基因组监测”的网络研讨会。我们邀请到了葡萄牙国立卫生研究院、英国帝国理工学院和伦敦国王学院的传染病专家们分享他们如何使用纳米孔技术快速监测病原体基因组。
前沿研究:利用纳米孔测序进行快速病原体基因组监测系列2
纳米孔测序技术可即时获取关键基因组流行病学数据,从病原体鉴定和抗菌素耐药性 (AMR) 分析,到高质量基因组组装和变体鉴定,对传染病样本进行全面、实时洞察,用于有效控制传染病暴发。 7月25日,我们邀请到Oxford Nanopore战略客户经理王海,河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所BSL-3实验室主任赵嘉咏,中国科学院微生物研究所博士后曹佳宝,带来前沿研究:利用纳米孔测序进行快速病原体基因组监测系列2线上讲座。
类器官与蛋白质组学的应用研究
类器官技术自诞生以来,由于其具有能高度模拟体内环境,并在体外展现真实器官的三维构造及生理功能,使得建立器官研究模型以及实现器官移植具有巨大前景,而类器官技术也逐渐被认为将极大助力再生医学和个性化治疗、精准治疗的发展。 当下,类器官疾病模型的构建目前正在应用于药物敏感性检测;通过多组织类器官的培养构建,利用交叉学科方法,研究疾病分子机理;通过类器官培养并开展相关的药筛以及临床评估研究,开展疾病特异性识别等类器官相关的基础科学、临床研究。众所周知,类器官技术的发展离不开先进技术的有效支持,而蛋白质组学分析具有功能研究和临床转化等巨大价值。那么,当下蛋白多组学如何助力类器官技术的研究进展及应用?类器官研究过程中蛋白组学分析的实验方法及相关注意细节有哪些?有哪些相关的研究实例以及当下的研究进展如何? 本期由生物谷携ProteinSimple召开的空中讲坛——《类器官与蛋白质组学的应用研究》,将于 11 月 17 日 14:00 正式上线,围绕以上疑问,邀请业界资深从业者,展开相关研究干货分享,并与直播间观众进行问答互动,相信将给同行带来启迪!
基于Oxford Nanopore平台的单细胞全长转录组 ——应用和实践
多重免疫组化学在人类疾病研究中的应用
在人类疾病研究中,我们往往需要借助不断更新迭代的先进技术来实现人类疾病的认知以及相关治疗。 我国有上亿脑神经疾病患者,由于脑神经收到损伤或者发育异常所致,包括自闭症、抑郁症、阿尔兹海默症、帕金森综合征、脑中风、中枢神经系统脱髓鞘疾病、自身免疫性脑炎等。此外,据国家癌症中心数据显示,我国恶性肿瘤发病、死亡数持续上升,每年恶性肿瘤所致的医疗花费超过2200亿。 多重免疫组化技术可以在一张组织切片上进行多重生物标志物检测的技术,主要利用不同标记物标记的抗体识别组织切片上的靶蛋白,再通过不用的实验平台或者专业仪器实现图像的采集与分析。由于获得的生物学信息众多,不仅可以对组织细胞原位靶标类别、组分、表达量等信息进行分析,还可以研究各靶标相互作用的空间位置信息, mIHC 技术在脑神经科学、肿瘤微环境,肿瘤异质性及肿瘤发生发展等研究中均能发挥重要。 12月13日,生物谷联合Bio-Techne召开空中讲坛——《多重免疫组化学在人类疾病研究中的应用》,邀请致力于神经科学、肿瘤等人类疾病发生机制及相关技术等研究领域的专家,分享当前的研究进展,相信将为基础研究和临床工作起到启发作用。