宁光:内分泌代谢病生物样本中心建设与信息管理
瑞金内分泌代谢性疾病样本库是一个基于人群队列研究的,标准化、高质量、信息化的大型样本库。样本库由生物样本库实体,样本库信息管理系统,临床资料数据库构成。样本库储存了约45万人次,400万份的自然人群生物样本。所有的生物样本都来源于相应的研究队列,主要探讨城市化进程中代谢性疾病的患病情况、危险因素以及糖尿病与肿瘤的发生风险等。样本库储存样本类型包括血液、尿液、唾液、内分泌相关肿瘤组织。样本库占地约300平方米,拥有超过100台-80℃超低温冰箱,20台-20℃低温冰箱,10台大容量液氮罐,1台大型的全自动生化免疫检测仪和10台糖化血红蛋白检测仪。同时,拥有1台大型的服务器负责对样本库进行信息化管理。
样本库采用信息管理系统进行标准化管理与运行,信息管理系统实现了对样本的精确定位和样本库操作日志的详细记录,从而实现了样本与临床信息的精确无缝链接,每例样本都包含其相对应的完备的临床信息,包括基本健康信息,生活方式,以及相关的临床检测信息等1000余条,全部的样本信息组成了一个包含约十亿条信息的庞大的临床数据库,用于内分泌代谢性疾病的环境与遗传因素的研究。
样本库的建设和信息化管理严格按照标准化的操作规范和流程(SOPs)进行,并附有相关的质量保证和质量控制(QA/QC)体系,保证样本库的质量和信息系统的完备性。
基于样本库的数据资源,多项重要的研究成果已经发表在JAMA,AnnalsofInternalMedicine,DiabetesCare等国际高水平杂志上。
郜恒骏:中国生物样本库与转化医学的思考
郜恒骏:同济大学消化内科学教授、主任医师、博士生导师,同济消化疾病研究所所长。
众所周知,生物样本库是生命科学基础与临床研究的关键源头,是进行大样本验证、快速实现生物医药转化医学的核心环节。近几年,我国生物样本库与转化医学得到政府与科学家们的高度关注、医院领导与专家们的高度重视、企业与技术部门大力支持,广大科研、医务工作者的积极响应,呈现良好发展势头。
中国医药生物技术协会组织生物样本库分会(BBCMBA),于2009年9月由卫生部、民政部批复成立,并于2013年顺利进行了改选,第二届专业委员会由全国100多家知名医院、134名领域著名、知名专家组成。分会已牵头举办了五届中国组织生物样本库标准化建立与应用研讨会、两届上海生物样本库与转化医学论坛。
今年,第六届全国大会在北京隆重召开,预计规模达千人。分会与国家863分子分型项目组、癌症基因组共同编写了中国生物样本库与数据库建立的指南,并牵头组织全国生物样本库领域的20余名专家制定了中国医药生物技术《生物样本库》行业标准(试行版)、翻译《2012 ISBER最佳实践》,均已公开发布,为我国数百家医院提供了培训。
2013年分会成立了中国生物样本库的质量检查与达标论证工作组,制定了自评表与质量达标检查细则和评分标准,并着手制定系列生物样本的国家标准以保证其样本资源的质量。分会还建立了中国虚拟生物样本库,旨在利用此网站加强我国生物样本优势资源的交流、合作和共享。该组织越来越成为我国该领域唯一国家级权威机构。
目前,我国生物样本库有专家库、科室库、多学科库、重大项目库、医院库、区域库等,不少医院(尤其三甲医院)纷纷着手建立自己的样本库,其中有精品库、价值库、特色库,恕我直言,也有不少垃圾库、死库。转化医学中心也如雨后春笋,已达数百个。
然而,什么是转化医学?其本质是什么?转化什么?如何实践?有这样的担心:几年后老外的仪器设备卖了,而漂亮的转化医学中心却空着、仪器设备沦为废铁。还是静下心来、脚踏实地地做成一些转化工作。
中国生物样本库与转化医学的发展思考:生物样本库的发展趋势是标准化、专业化(人才)、特色化(地域与学科)、精品化(求质量不比数量)、信息化(中心)、集约化(银行)、自动化、国际化与价值化(强调应用)。为促进我国转化医学研究与产业化的健康发展,加强国际交流与合作,我中心、分会与美国转化医学杂志(AJTR)在美国联合注册成立了美中转化医学协会(UCATM),分别在中国、美国召开中美转化医学论坛。
云BIMS生物样本库解决方案
海尔云BIMS生物样本库解决方案,通过云布署、云集成,建立生物样本库标准化管理平台,实现样本、设备、实验、人员、试剂耗材的大数据汇集和共享。提供包括生物样本库、分子生物实验室、微生物及理化实验室的整体规划设计方案。新一代BIMS灵珑系统,是专为生命科学领域科研工作者量身打造的一款基于云模式的生物样本库信息化管理产品,集平台化、个性化、图形化三大优势于一体。
张勇:生物样本库的春天-未来“医疗”系统下的重要组成之一
介绍了生物样本库的主要作用:1.高质量的文章。2.生物样本库标准的国内外进展。3.专业人才的培训与教育。4.未来样本库的发展思考。
狄文:女性生育力保存与生物样本库
介绍了生物样本库建设的一个趋势,开展“转化医学”的物质基础。介绍了肿瘤生殖学:女性生殖力的保存及保存方法。提到了卵巢组织冷冻移植与肿瘤生殖,卵巢组织冷冻移植适应症,提到了冷冻方法以及影响卵巢冻存效果的因素,卵巢组织存活情况的检测,肿瘤微残留检测。卵巢组织移植效果的影响因素。
吕有勇:基因组技术和生物样本与精准医学
介绍了生物样本、基因组技术、大数据智能分析与精准医学方面的内容,提到了现代医学与未来生物医学发展的目标,医学科学文化史与未来医学。介绍了一些现代医药科学发展历程的启迪。生物样本与临床和科学问题的关系,提到了大数据智能分析获得新认知和创造新价值的源泉等。
孙孟红:病理学精准医学生物样本库
介绍了病理学诊断的一些相关概念,提到了病理学在疾病诊治中的作用,生物样本库中的作用,介绍了病理学的重要性,小手术标本怎样收集样本。介绍了样本信息的收集。
2017生物样本库网络研讨会(特种样本库)
随着精准医学时代的来临, 生物样本库(Biobank)作为转化医学研究的重要资源,是其发展的基石。生物样本库的重点在于生物样本的采集、存储、管理、全流程质控等管理。建立高质量的生物样本库对于探索新的治疗途径,开拓新的诊治手段,优化医药研发的资源配置都有极其重要的意义。也对于提高科研效率具有极大的帮助各地生物样本库的建设已经大部分完成,下一步就是如何使保存在样本库的样本说话——产生价值,为此我们特邀一线专家与大家共同探讨这一问题。