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郑培永:上海市重大疾病生物样本库建设

以医院为基础,建立面向本市主要疾病的分散存储的生物样本库。研发基于云计算的市级生物样本库信息平台,实现两大应用功能,一为实体库建设单位提供标准化的样本库管理系统,二是通过与医联平台互联,实现临床信息与样本库信息的整合,为科研工作者提供一站式查询等服务功能;实现上海医疗机构生物样本实体标本分布存储和信息集中管理;制定统一的生物样本库采集规则、质量管理规则。

2014-12-26 课时:33分钟

杜祥:医院生物样本库的建设和管理

生物样本是科研工作的原油,不可替代、不可再生。一方面样本在不断流失、另一方面样本却异常匮乏。生物样本库的出现给生物医药研究和转化医学研究带来了生机,“样本”成为备受关注的对象。医院生物样本库的建设包括“收什么、怎么收、经费来源、样本属于谁、各利益方的平衡、伦理道德”等一系列问题需要面对。

样本库的管理是需要严格的操作流程来作为保障的,建立样本库SOPs是至关重要的一步。样本的质量是样本的灵魂,没有质量的样本给研究结果带来的负面影响要在相当长的时间内才能够消除。质量控制体现在很多方面,包括对取材处理各个环节时间记录、形态复检、生物大分子稳定性分析等。在建立生物样本库的职业队伍时,对人员的培训成为关键。
生物样本库的样本使用规范、样本共享原则和科研合作是生物样本库日常需要面对的问题。
生物样本库可持续性发展也是在建立样本库之始就需要考虑的重要问题。

2014-12-30 课时:47分钟

宁光:内分泌代谢病生物样本中心建设与信息管理

瑞金内分泌代谢性疾病样本库是一个基于人群队列研究的,标准化、高质量、信息化的大型样本库。样本库由生物样本库实体,样本库信息管理系统,临床资料数据库构成。样本库储存了约45万人次,400万份的自然人群生物样本。所有的生物样本都来源于相应的研究队列,主要探讨城市化进程中代谢性疾病的患病情况、危险因素以及糖尿病与肿瘤的发生风险等。样本库储存样本类型包括血液、尿液、唾液、内分泌相关肿瘤组织。样本库占地约300平方米,拥有超过100台-80℃超低温冰箱,20台-20℃低温冰箱,10台大容量液氮罐,1台大型的全自动生化免疫检测仪和10台糖化血红蛋白检测仪。同时,拥有1台大型的服务器负责对样本库进行信息化管理。

样本库采用信息管理系统进行标准化管理与运行,信息管理系统实现了对样本的精确定位和样本库操作日志的详细记录,从而实现了样本与临床信息的精确无缝链接,每例样本都包含其相对应的完备的临床信息,包括基本健康信息,生活方式,以及相关的临床检测信息等1000余条,全部的样本信息组成了一个包含约十亿条信息的庞大的临床数据库,用于内分泌代谢性疾病的环境与遗传因素的研究。

样本库的建设和信息化管理严格按照标准化的操作规范和流程(SOPs)进行,并附有相关的质量保证和质量控制(QA/QC)体系,保证样本库的质量和信息系统的完备性。

基于样本库的数据资源,多项重要的研究成果已经发表在JAMA,AnnalsofInternalMedicine,DiabetesCare等国际高水平杂志上。

2014-12-31 课时:39分钟

利用凝胶成像系统分析软件测定样本分子量

凝胶成像分析系统由摄像与分析两部分组成。凝胶分析软件重要功能之一即测定计算凝胶条带样本的分子量。

Dolphin-1D全自动凝胶成像分析软件是美国Wealtec公司为Dolphin系列凝胶成像分析系统开发的高端凝胶分析软件,下面我们通过这个视频来一同了解一下如何使用Dolphin-1D软件来计算样本分子量。

2015-02-03 课时:7分钟

郜恒骏:中国生物样本库与转化医学的思考

郜恒骏:同济大学消化内科学教授、主任医师、博士生导师,同济消化疾病研究所所长。

众所周知,生物样本库是生命科学基础与临床研究的关键源头,是进行大样本验证、快速实现生物医药转化医学的核心环节。近几年,我国生物样本库与转化医学得到政府与科学家们的高度关注、医院领导与专家们的高度重视、企业与技术部门大力支持,广大科研、医务工作者的积极响应,呈现良好发展势头。

中国医药生物技术协会组织生物样本库分会(BBCMBA),于2009年9月由卫生部、民政部批复成立,并于2013年顺利进行了改选,第二届专业委员会由全国100多家知名医院、134名领域著名、知名专家组成。分会已牵头举办了五届中国组织生物样本库标准化建立与应用研讨会、两届上海生物样本库与转化医学论坛。

今年,第六届全国大会在北京隆重召开,预计规模达千人。分会与国家863分子分型项目组、癌症基因组共同编写了中国生物样本库与数据库建立的指南,并牵头组织全国生物样本库领域的20余名专家制定了中国医药生物技术《生物样本库》行业标准(试行版)、翻译《2012 ISBER最佳实践》,均已公开发布,为我国数百家医院提供了培训。

2013年分会成立了中国生物样本库的质量检查与达标论证工作组,制定了自评表与质量达标检查细则和评分标准,并着手制定系列生物样本的国家标准以保证其样本资源的质量。分会还建立了中国虚拟生物样本库,旨在利用此网站加强我国生物样本优势资源的交流、合作和共享。该组织越来越成为我国该领域唯一国家级权威机构。

目前,我国生物样本库有专家库、科室库、多学科库、重大项目库、医院库、区域库等,不少医院(尤其三甲医院)纷纷着手建立自己的样本库,其中有精品库、价值库、特色库,恕我直言,也有不少垃圾库、死库。转化医学中心也如雨后春笋,已达数百个。

然而,什么是转化医学?其本质是什么?转化什么?如何实践?有这样的担心:几年后老外的仪器设备卖了,而漂亮的转化医学中心却空着、仪器设备沦为废铁。还是静下心来、脚踏实地地做成一些转化工作。

中国生物样本库与转化医学的发展思考:生物样本库的发展趋势是标准化、专业化(人才)、特色化(地域与学科)、精品化(求质量不比数量)、信息化(中心)、集约化(银行)、自动化、国际化与价值化(强调应用)。为促进我国转化医学研究与产业化的健康发展,加强国际交流与合作,我中心、分会与美国转化医学杂志(AJTR)在美国联合注册成立了美中转化医学协会(UCATM),分别在中国、美国召开中美转化医学论坛。

2015-05-26 课时:42分钟

徐沪济:利用大样本进行中国汉族人风湿病的免疫遗传学致病机理研究

徐沪济,第二军医大学附属长征医院,主任医师,教授,现任风湿免疫内科主任,博士生导师。徐教授长期工作在临床和科研第一线,对多种风湿免疫性疾病的诊治有丰富的经验,医学研究方向主要是临床免疫学。

徐沪济教授以“利用中国大样本对强直性脊柱炎和类风湿关节炎进行研究”为主题,介绍了基因和环境共同作用下对身高的影响,以及调节性淋巴细胞对淋巴因子分泌的影响。尤其是对风湿病致病机理的探索、靶向治疗的探索以及新型CD4调节性T细胞在AS中的作用分析。

2015-06-05 课时:42分钟

如何在斑马鱼完整胚胎样本中使用RNAscope®技术进行研究

整胚原位杂交是在完整胚胎和组织中研究基因时空表达模式的有力工具。但现有的实验方法无法准确的直接检测RNA,而且操作耗时,结果和蛋白表达水平不一致。新一代原位定量杂交技术RNAscope®可以在斑马鱼整胚上实现快速高效、精准定量、特异性的多重RNA原位检测。该webinar由美国ACD公司(Advanced Cell Diagnostics, Inc., California, USA)邀请德国Münster大学细胞生物学研究所Erez Raz教授实验室两位研究员Azadeh Paksa 和 Theresa Gros介绍他们利用RNAscope®技术实现斑马鱼整胚上同时原位检测3个RNA分子进行三维荧光分析。详细介绍了实验操作过程,如何优化条件,降低信噪比以及RNAscope®技术相比传统原位杂交技术的绝对优势。

ACD公司提供RNAscope®原位定量杂交专利技术和产品,详细信息请访问ACD官网www.acdbio.com。更多中文资料请关注中国官方微信号(ACD_China)咨询。 文章题目: Simultaneous high-resolution detection of multiple transcripts combined with localization of proteins in whole-mount embryos. Gross-Thebing T, Paksa A, Raz E. BMC Biol. 2014 Aug 15;12(1):55.

2018-02-01 课时:63分钟

石蜡包埋切片样本的RNAscope®检测操作步骤:棕色显色方法

对于石蜡包埋切片(FFPE)类型的样本,使用RNAscope®技术进行RNA原位定量检测分析,结果以棕色化学显色法显示。本视频对该实验进行了分步详细描述,供大家在实验开始时参考学习。

RNAscope®®原位定量专利技术由美国ACD公司(Advanced Cell Diagnostics, Inc., California, USA)开发,通过专利的双“Z”探针设计,使RNA原位杂交具有高度特异性、RNA单分子检测的敏感性并兼容自动化高通量分析,能够在单细胞水平同时定量多个RNA的表达。该视频由ACD公司制作,详细信息请访问ACD官网www.acdbio.com。更多中文资料请关注中国官方微信号(ACD_China)咨询。

2018-03-15 课时:2分钟

云BIMS生物样本库解决方案

海尔云BIMS生物样本库解决方案,通过云布署、云集成,建立生物样本库标准化管理平台,实现样本、设备、实验、人员、试剂耗材的大数据汇集和共享。提供包括生物样本库、分子生物实验室、微生物及理化实验室的整体规划设计方案。新一代BIMS灵珑系统,是专为生命科学领域科研工作者量身打造的一款基于云模式的生物样本库信息化管理产品,集平台化、个性化、图形化三大优势于一体。

2016-04-20 课时:6分钟

海尔-190℃全自动化样本存储管理系统

在信息化时代,大数据、样本库、精准医疗等获得全球各国的认可,未来全世界样本存储数量也将在目前十亿的基础上呈几何倍数的增长。 海尔生物医疗与美国Brooks达成战略合作,获得该品牌自动化样本存储方案在大中华区的唯一总代理授权,双方将在自动化生物样本库领域携手共赢,并推进中国生物样本库建设向更高水平发展。 在计算机上输入或扫描样本编号,机械臂自动提取液氮容器中相应位置的冻存盒,放入低温整理箱,实验人员在箱内取出样本,再将冻存盒放回机械臂窗口,机械臂自动将冻存盒存入液氮容器。 全过程不脱离-190℃深低温环境 ,不需要开启液氮罐,机械臂一键提拉,自动化替代人力; 全过程信息化管理,样本信息一目了然。

2016-09-29 课时:9分钟