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胡欣:个性化医学研究与应用中的高通量测序:如何克服样品制备与质控瓶颈

NGS技术近年来飞速发展,不单使得生命科学及医学研究从中受益,也为个性化医疗与保健提供了新的途径。相比于快速得到成本可接受的大量数据,目前如何足够有效而稳定的获得高质量的测序样品,以“喂饱”我们胃口日益膨胀的测序仪,并达成临床检验所需的标准化、自动化、可追溯,以及如何从海量数据中“掘金”,已成为制约科学家及普罗大众从NGS技术中更大化获益的主要瓶颈。

PerkinElmer逐步推出并完善了一系列基于其实验室自动化及微流控lab-on-chip技术,真正ready-to-use的NGS自动化文库制备及样品QC的平台,以及核酸抽提纯化、数据分析相关产品,以期帮助NGS科学家们解决上述样品制备及质控瓶颈。PerkinElmer的NGS suite 4年来已被全球数百家NGS中心所采用。

2015-04-22 课时:7分钟

如何提高NGS样品制备实验成功率

新一代测序技术过程中样品制备的质量是测序结果可靠性的根本保障,从核酸的提取、DNA 片段化、末端修复、标记添加,以及产物磁珠纯化、文库构建的每一个步骤,都对最终的实验结果有着巨大的影响。
除了拥有一台高大上的NGS测序仪以及配套的仪器和试剂是远远不够的。很多用户在实验操作中都被繁琐冗长的样品制备过程所困扰,从而严重影响了NGS实验的成功率。其实,从样本核酸的获得到文库构建,每一个步骤都对最终的实验结果产生失之毫厘谬以千里的影响。
在整个繁琐和复杂的NGS样本制备过程中,很多用户都有着诸如此类的疑问: 怎样减少可能出现的手工失误,如何选择合适实验工具进行,怎样避免样本的交叉污染,如何提高珍贵样品的文库构建效果,如何保证RNA样品的测序成功率?
在此次系列NGS网络讲座中,拥有丰富分子生物学产品的Eppendorf 公司将会为各位老师带来涉及NGS样本制备过程中的一系列技巧:
1. 影响文库构建成功率的操作因素;
2. 怎样避免样本制备过程中的交叉污染;
3. 如何保证微量样品文库构建的成功率;

2015-07-24 课时:32分钟

应用于NGS临床检测的游离核酸自动化样品处理解决方案

第二期NGS系列网络研讨会为大家重点介绍目前NGS临床应用中最热门的话题——游离核酸的自动化提取解决方案以及后续的样品自动化处理解决方案。

2015-12-03 课时:41分钟

实验室中的温度控制:冷却保存样品

低温保存实验室样品,样本和试剂在生物医学研究实验室中会经常用到。本短片将讨论让实验室样品保持冷却的一些方法,还将阐明针对每个实验要求选择使用正确的冷却方法。例如,冰和干冰这一类冷却试剂,通常用来在实验过程中保持样品冷却。本视频讨论了最常用的冷却试剂的物理属性,以及操作使用它们时要注意的安全事项。若要在不同实验之间保存样品冷却,则需用到制冷仪器,包括实验室级别的冰箱和冻箱来对样品做长时间的保存。本视频还讨论了可用目前常用实验室制冷仪器存储的样品和试剂的类型。最后还介绍了超低温保存的概念,它是将组织,细胞和生物分子冷却到0度以下的过程,可有效终止所有降解样品的生物学反应。这里讨论了几种可以尽量减小或避免形成能造成损伤的冰晶的超低温保存方法。

2015-12-11 课时:9分钟

制备组织学样品用于光学显微镜技术

组织学是指对细胞和组织的研究,它通常需要借助于光学显微镜。根据样品本身属性如大小,硬度以及处理后使用的染色技术和下游应用的不同,制备组织学样品的过程也会有很大不同。如本视频中介绍的,样品的制备通常是从固定步骤开始,用以防止濒临死亡细胞所释放出的酶对样品的降解。固定后,样品会被置于包埋试剂来使样品完全被支撑起来。最常用的是石蜡,但是其他的一些试剂,例如含甘油的冷冻试剂和琼脂也可以在切片的时候用于包埋样品。然后在切片机或其他切片仪器中将样品切割成厚度为几微米到几毫米的薄片。切片之后,薄片会被固定在载玻片上,根据需要进行染色以获得特定的标记,而后在显微镜下成像。

2015-12-11 课时:10分钟

GE:2016第一弹之蛋白样品制备

蛋白样品制备是进行样品分析前的第一步,制备的质量对于成功进行蛋白分析来说至关重要。本次内容主要从蛋白收集提取、亲和富集、准确定量到脱盐除杂进行讲解,努力为在蛋白质分析研究领域入门或探索阶段的科研人员提供完整的解决方案。

2016-03-26 课时:40分钟

GE:蛋白样品过滤注意事项

蛋白质研究已经成为当今研究的热点之一,从蛋白表达,到分离纯化,再到结构功能研究。其中会不同程度地用到蛋白样品处理,这次我们基于高品质的Whatman过滤产品,介绍蛋白样品过滤处理中应该注意的小细节。

2016-04-05 课时:40分钟

Western Blot 第1阶段:样品制备

Novus Biologicals Visual Protocols: In phase 1 of the western blot procedure, you will learn how to prepare your samples before loading them into a gel. Here we isolate protein from cultured cells, quantify total protein concentrations with a BCA assay, add loading buffer to the sample, and heat the sample. Additional help can be found in the support section of http://www.novusbio.com, through our live chat service, or by calling us directly to talk with our elite customer and technical service scientists.

2016-05-13 课时:4分钟