临床医生在生物样本库建设中应起主导作用

陆舜：临床医生在生物样本库建设中应起主导作用

Personalized medicine may be defined as “a medical model using molecular profiling technologies for tailoring the right therapeutic strategy for the right person at the right time, and determine the predisposition to disease at the population level and to deliver timely and stratified prevention”. Progress in the understanding of driven genes and drug actions are opening opportunities to match therapies to lung cancer patient populations, and thus pave the way towards a more personalized medicine. The use of driven genes such as EGFR, ALK, and ROS1 et al can help identify patients that are more likely to respond favorably to a given therapy which is approved by clinical trials. Increasingly, we find application in order to stratify different patient groups in terms of clinical response, so as to develop personalized, preventive or therapeutic strategies.

葛明华：肿瘤生物样本库整体建设--问题与思考

肿瘤生物样本库是肿瘤转化研究的基石。建设前要落实管理人员，然后紧跟国内外肿瘤领域的发展制定肿瘤生物样本库中长期规划。另外，肿瘤生物样本库建设是需要长期投入的一项工程，建设单位领导一开始应在专职人员、场地、资金等方面有充分的投入。

肿瘤生物样本库的建设对于单位肿瘤学科发展起着关键作用。前提是肿瘤样本库建设要高质量的实施，其核心是长期有效保存样本的分子信息，并准确记录其附加信息（包括患者信息、随访信息、样本分子检测信息等）。肿瘤生物样本库建成后能够通过国内、国际专家认证，最好能通过各种质量认证（例如17025等）。

肿瘤生物样本库是一个服务机构，其服务内容包括最初级的原始样本（包括肿瘤冷冻组织、正常冷冻组织、石蜡切片、血清、血浆、白细胞层等），大分子提取和质控，实验数据等。有条件的还开展肿瘤样本库相关研究和咨询、培训工作等。

苏健：肺癌标本库建设与转化医学研究

广东省肺癌研究所于2003年成立后，便着手筹建肺癌单病种肿瘤标本库，建立了大库容量、覆盖各种临床类型、连续动态观察的标本库。目前拥有近7000例，80 000多份包括肿瘤组织、癌旁组织、正常组织、血液、胸水等各类型标本。为加强标本库规范化、信息化管理，2010年开发了《临床医学标本管理系统》，与医院EMR及HIS系统对接，保证了数据信息的准确性。以标本库为支撑，广东省肺癌研究所开展了一系列肺癌转化医学研究，国内最早开展EGFR临床检测，第一次提出EGFR突变丰度与EGFR-TKI疗效相关的概念，明确我国非小细胞肺癌驱动基因突变谱，明确EGFR/ALK双变异流病特征等。

王从容：代谢性疾病生物样本库建设

上海交通大学附属第六人民医院内分泌科/上海市糖尿病研究所/上海市糖尿病重点实验室是一个集临床、科研、教学为一体的综合性糖尿病研究单位。在项坤三院士和973首席科学家贾伟平教授领导下，于九十年代初开始进行以糖尿病、肥胖为主攻方向的临床应用基础研究，并逐步形成大规模代谢性疾病临床样本资源库。已建成国内最大的糖尿病家系库（1400个家系、7100人），形成了门诊高危人群、糖尿病-肥胖-代谢综合征社区人群、糖尿病住院患者、等各类样本库和临床资料数据库，总样本量超过10万人。2011年在科技部新药创制子课题资助下，专门成立了代谢性疾病样本库。2013年被授予"上海交通大学医学院国家'985工程'项目生物样本库"、"科技创新平台上海高校转化医学知识服务平台样本库"。样本库占地500m2，拥有双路供电系统、专业视频监控设备、独立计算机房、生物安全二级实验室以及独立生物样本存储空间。样本库已形成并实施与国际接轨的标准操作流程，构建出入库管理系统、冷链监控系统和临床信息管理系统。标准化管理实施2年来，已电子化管理样本5万人（50万份）；已拥有年处理20万份以上样本的能力。近年来利用上述大规模人群，支持多项国家级研究项目（973、863、国家支撑计划、国家自然基金重点项目等）；在NatureGenetics、BMJ、Diabetes、Diabetologia等国际知名杂志发表多篇学术论着；并获得与糖尿病有关的各类奖项20余项。

郑培永：上海市重大疾病生物样本库建设

以医院为基础，建立面向本市主要疾病的分散存储的生物样本库。研发基于云计算的市级生物样本库信息平台，实现两大应用功能，一为实体库建设单位提供标准化的样本库管理系统，二是通过与医联平台互联，实现临床信息与样本库信息的整合，为科研工作者提供一站式查询等服务功能；实现上海医疗机构生物样本实体标本分布存储和信息集中管理；制定统一的生物样本库采集规则、质量管理规则。

杜祥：医院生物样本库的建设和管理

生物样本是科研工作的原油，不可替代、不可再生。一方面样本在不断流失、另一方面样本却异常匮乏。生物样本库的出现给生物医药研究和转化医学研究带来了生机，“样本”成为备受关注的对象。医院生物样本库的建设包括“收什么、怎么收、经费来源、样本属于谁、各利益方的平衡、伦理道德”等一系列问题需要面对。

样本库的管理是需要严格的操作流程来作为保障的，建立样本库SOPs是至关重要的一步。样本的质量是样本的灵魂，没有质量的样本给研究结果带来的负面影响要在相当长的时间内才能够消除。质量控制体现在很多方面，包括对取材处理各个环节时间记录、形态复检、生物大分子稳定性分析等。在建立生物样本库的职业队伍时，对人员的培训成为关键。
生物样本库的样本使用规范、样本共享原则和科研合作是生物样本库日常需要面对的问题。
生物样本库可持续性发展也是在建立样本库之始就需要考虑的重要问题。

宁光：内分泌代谢病生物样本中心建设与信息管理

瑞金内分泌代谢性疾病样本库是一个基于人群队列研究的，标准化、高质量、信息化的大型样本库。样本库由生物样本库实体，样本库信息管理系统，临床资料数据库构成。样本库储存了约45万人次，400万份的自然人群生物样本。所有的生物样本都来源于相应的研究队列，主要探讨城市化进程中代谢性疾病的患病情况、危险因素以及糖尿病与肿瘤的发生风险等。样本库储存样本类型包括血液、尿液、唾液、内分泌相关肿瘤组织。样本库占地约300平方米，拥有超过100台-80℃超低温冰箱，20台-20℃低温冰箱，10台大容量液氮罐，1台大型的全自动生化免疫检测仪和10台糖化血红蛋白检测仪。同时，拥有1台大型的服务器负责对样本库进行信息化管理。

样本库采用信息管理系统进行标准化管理与运行，信息管理系统实现了对样本的精确定位和样本库操作日志的详细记录，从而实现了样本与临床信息的精确无缝链接，每例样本都包含其相对应的完备的临床信息，包括基本健康信息，生活方式，以及相关的临床检测信息等1000余条，全部的样本信息组成了一个包含约十亿条信息的庞大的临床数据库，用于内分泌代谢性疾病的环境与遗传因素的研究。

样本库的建设和信息化管理严格按照标准化的操作规范和流程（SOPs）进行，并附有相关的质量保证和质量控制（QA/QC）体系，保证样本库的质量和信息系统的完备性。

基于样本库的数据资源，多项重要的研究成果已经发表在JAMA,AnnalsofInternalMedicine,DiabetesCare等国际高水平杂志上。

张桂荣：顺应肿瘤个体化诊疗需求的分子诊断平台建设

一、国内外肿瘤相关分子诊断的现状
1、国外分子诊断开展机构：独立实验室，伴随诊断试剂生产厂家；
认证：CLIA认证、CAP认证；
2、国内较复杂：少数单位成立分子诊断科、依托于病理科、检验科、中心实验室、外科（胸科、乳腺科）、药剂科等、独立实验室、试剂公司、制药企业等。质量管理体系不健全，分子检测平台不完整。

二、分子诊断技术的发展：
1、免疫组织化学（蛋白表达）
2、荧光原位杂交（基因拷贝数、基因融合/分离）
3、荧光定量PCR（mRNA表达，基因突变，DNA载量)
4、基因/蛋白芯片（基因、蛋白表达谱）
5、测序（SNP、突变、基因结构）
一代、二代、三代及技术特点

三、NGS在肿瘤个体化治疗中的应用
NGS技术的特点：自动化、高通量、深度测序
NGS技术与肿瘤个体化治疗的结合：64 gene panel

四、临床应用新方向-预后基因检测
分子标志物能否发挥更大的作用?
具有潜在临床应用价值的肺癌预后基因；
肺癌预后基因提高预后判断的准确性。

五、完整的分子检测平台
1、软硬件建设是前提：人才培养、实验室建设、仪器设备的选择、质量控制体系SOP；
2、检测平台完整：FISH、PCR、测序等；
3、检测方法多样：基因扩增、突变、表达、融合、蛋白表达等；
4、检测样本齐全：组织、血液、尿液、胸腹水、分泌物等；
5、室内质控及室间质评。

六、完整平台建设的必要性
1、癌症本质上是一种基因病，因此，进行准确的分子分型和基因诊断在癌症诊疗中 起重要作用；
2、同一基因可能参与多种肿瘤的发生、发展；
3、同一类型肿瘤可能由多种基因参与驱动，在肿瘤的进展过程中，发挥不同的作用；
4、肿瘤组织、体液、血液中某一分子或基因的变化可能具有相同或不同意义；
5、肿瘤驱动基因的改变多样：拷贝数、RNA或蛋白表达水平、突变、基因融合或分离等。

王彭：北京生物银行标准化建设与管理

介绍了转化医学、精准医学概念提出背景，提到了是生物样本库的重要性及中国样本库的分布，介绍了样本库的大致分类以及几个基本理念。介绍了北京生物银行建设背景及相关内容。