Keith Barry的大脑魔术表演
这是第一次, Keith Barry告诉我们的大脑如何愚弄我们的身体.Keith Barry邀请了观众参与令人瞠目结舌(甚至有点危险)的大脑魔术表演.
MicroRNa研究的综合解决方案
对于microRNa的研究,已进行了十多年。基因芯片和新一代测序等高通量技术有力地推动了microRNa的研究。李明辉博士在视频中先介绍了microRNa的背景,概括了microRNa研究的基本问题和研究方法。然后结合上海伯豪的服务内容,详细介绍了microRNa研究的微阵列芯片和新一代测序方法,并辅以上海伯豪的多个具体技术服务案例进行详细说明。视频还对microRNa的验证和功能研究方法进行了阐述。最后,结合实际案例,视频还介绍了如何将microRNa作为生物标志物进行研究。
NanoString--陈巍学基因(19)
本节课程向大家谈一下NanoString的分析方法。
从以下方面进行阐述:
NanoString的优点
NanoString的化学原理
孙毅:RNa深度测序相关(TBD)
孙毅,博士,同济大学教授。美国加州大学洛杉矶分校终身教授,***“***” 国家***。长期致力与神经系统发育和疾病的表观遗传学及分子机制研究。在神经发育方面主要贡献在于阐明了神经干细胞或祖细胞在往神经元或胶质细胞分化过程中命运决定的分子机制,包括首次发现LIF 激动的JaK-STaT pathway 是星形胶质细胞命运决定的主要通路(co 1st author Science, 1997),首次阐明决定神经元命运的pro-neural bHLH 因子和JaK-STaT pathway 之间的相互抑制作用(1st author Cell, 2001)。
2001年孙毅教授在美国加州大学(UCLa) 建立实验室后潜心研究DNa 甲基化,组蛋白修饰,及非编码RNa 在神经系统发育,包括细胞命运决定,神经元功能成熟,及其可塑性变化过程中的作用。在神经疾病研究方面,她的实验室是最早开始用人类ES 细胞iPS 细胞做神经系统疾病模型的实验室之一,并取得了突破性成果。
2009年回国后,开始进行大量转化医学研究主要在干细胞治疗脊髓损伤方面开始了一系列原创性的研究。另外在用干细胞建立孤独症模型方面已取得突破性成果。她带领的团队在同济大学原创性地研发了体细胞单细胞全基因组转录本的RNa 深度测序方法并用于研究成体神经干细胞的分子生物学性状,探讨成体干细胞及肿瘤干细胞静息活化过程中的机制,该技术对未来寻找各类疾病包括衰老的分子标记会有划时代的推动。
金颖:Fox3 suppresses NFaT-mediated differentiation to maintain self-renewal of embryonic stem cells
金颖教授为分子发育生物学研究室主任,健康科学中心研究员。金教授介绍了Fox3通过抑制NFaT介导的分化维持了胚胎干细胞的自我更新的机制等前沿发现。
Pluripotency-associated transcription factor Foxd3 is required for maintaining pluripotent cells. However, molecular mechanisms underlying its function are largely unknown.
Here, we report that Foxd3 suppresses differentiation induced by Calcineurin-NFaT signaling to maintain the ESC identity. Mechanistically, Foxd3 interacts with NFaT proteins and recruits co-repressor Tle4, a member of the Tle suppressor family highly expressed in undifferentiated ESCs, to repress NFaTc3’s transcriptional activities.
Furthermore, global transcriptome analysis shows that Foxd3 and NFaTc3 co-regulate a set of differentiation-associated genes in ESCs. Collectively, our study establishes a molecular and functional link between a pluripotency-associated factor and an important ESC differentiation-inducing pathway.
Fluidigm BioMark-陈巍学基因(22)
Fluidigm公司出品的BioMark系统,是一个基于微流控的,高通量的实时定量PCR系统。它可以高效、快速地对多个样本的、多个基因的表达量进行检测,也可以对多个样本的、多个SNP位点进行分型。同时它还可以大量地节约试剂、人工、实验时间。
本视频介绍了BioMark系统的工作原理,和其优势、特点。
贾立军:Neddylation蛋白修饰-CRL 泛素连接酶通路调控肿瘤细胞自噬应答的机制与潜在应用
贾立军博士,复旦大学附属肿瘤医院肿瘤研究所研究员和博士生导师。目前主要从事“针对蛋白质翻译后修饰通路进行抗肿瘤分子靶点发现”等研究工作。
相关研究在 J Natl Cancer Inst(JNCI)、Cancer Research、Clinical Cancer Research、autophagy、Cell Death & Differentiation、Cell Death & Disease、Int J Cancer和J Biol Chem等学术期刊发表文章40篇、获邀参编英文专著4部。主持国家自然科学基金(81372196,31071204,30500637,81172092)、国家重大科学研究计划(2012CB910302,课题负责)、上海市卫生局a类重点项目 (2010012)、上海市“浦江人才 ”资助计划(12PJ1400600)和上海高校特聘教授(东方学者)资助计划等科研项目。
学术兼职包括:国家自然科学基金委员会医学科学领域学科评审组专家、中华医学科技奖评审委员会委员、上海市免疫学会肿瘤免疫专业委员会委员、高等学校自然科学奖和技术发明奖评审专家和十余种学术期刊审稿专家。荣获上海高校特聘教授(东方学者)和上海市浦江人才等荣誉称号。
秦正红:DRaM1 regulates autophagy flux and Bid-mediated cell death via lysosomes
秦正红,博士,教授,神经药理专业博士生导师。1994年在美国宾州医学院研究生院获博士学位,先后在美国国家卫生研究院(NIH)及麻省总医院和哈佛大学医学院从事研究工作。2003年从哈佛大学引进,现为苏州大学医学部基础医学与生物科学学院科研中心实验室主任,中国药理学会生化药理学专业委员会委员,中国药理学会神经药理学专业委员会委员,美国神经科学学会会员。
Damage-regulated autophagy modulator1 (DRaM1), a novel TP53 target gene, is an evolutionarily conserved lysosomal protein and plays an essential role in TP53-dependent autophagy activation and apoptosis (Crighton et al, 2006). However, the mechanisms by which DRaM1 promotes autophagy and apoptosis are not clear.
3-Nitropropionic acid (3-NP) is an inhibitor of mitochondrial respiratory complex II. Intrastriatal administration of 3-NP produces neuropathology resemble to Huntington disease. 3-NP-induced neuronal death was involved in autophagy and apoptosis. In vitro studies with 3-NP in TP53 wt and null cells, 3-NP or CCCP increased the protein levels of DRaM1 in a TP53-dependent or independent manner. DRaM1 induction contributed to 3-NP-induced autophagy activation. Knock-down of DRaM1 with siRNa inhibited the activity of V-aTPase, acidification of lysosomes and activation of lysosomal proteases. Knock-down of DRaM1 reduced the clearance of autophagososmes.
3-NP also induced a transcription independent upregulation of BaX protein levels. Knock-down of DRaM1 suppressed the increase in BaX levels. Co-immunoprecipitation and pull-down studies revealed an interaction of DRaM1 and BaX protein. Stably expression of exogenous DRaM1 increased the half-life of BaX. Upregulation of DRaM1 recruited BaX to lysosomes and induced cathepsin B-dependent cleavage of Bid and cytochrome c release. Knockdown of DRaM1, BaX or inhibition of lysosomal enzymes reduced 3-NP-induced cytochrome c release and cell death.
These data suggest that DRaM1 plays important roles in regulating autophagy flux and apoptosis. DRaM1 promotes autophagy flux through a mechanism involves activation of V-aTPase and enhances the acidification of lysosomes. DRaM1 promotes apoptosis via a mechanism involving recruitment of BaX to lysosomes to trigger cathepsin B-mediated Bid cleavage.
第一代DNa测序--陈巍学基因(25)
第一代DNa测序,是最经典的DNa测序方法。
本视频以BigDye试剂为主线,介绍了一代测序的三个最主要的技术:
Sanger先生发明的双脱氧(ddNTP)测序原理
BigDye的荧光标记方法
aBI 3500毛细管电泳分析原理
上海伯豪lncRNa芯片服务
上海伯豪针对广大客户的需求,开发出全新的lncRNa芯片,并利用agilent公司专利的SurePrint技术制造。为您提供完善的基因芯片技术服务,并完成数据分析,提供完整的实验报告。
SBC-lncRNa芯片技术特点:
1)芯片采用agilent earray平台设计,使用agilent SurePrint技术合成,探针长60mer,检出率高,技术重复性高于99%;
2)覆盖主流数据库几乎所有lncRNa和mRNa,可同时检测lncRNa和mRNa,并挖掘两者之间的关联;
3)随机引物扩增方式,可同时扩增带Ploy-a和不带Poly-a的lncRNa,
同时,上海伯豪利用affymetrix开发的GeneChip® Human Transcriptome array 2.0 (HTa2.0)芯片,为客户提供常规mRNa以及超过40,000个非编码转录本的表达检测服务,也是研究lncRNa非常合适的技术手段。