张勇:国家基因库-样本库管理、联盟与应用
2013年,国家基因库已经累计处理近210万份生物样本,随着未来科研和相关临床产业的飞速发展,样本库的质量管理、高通量能力、联盟建设以及最后的产出变得尤为重要。
本报告将通过对2013年的总结,与各位专家分享现实工作中面临的问题,同时对未来技术的简要介绍,展望2014年样本库将承载的重大任务。
本报告还将对国家基因库使用的存储硬件、管理软件、监控设备、高通量制备提取经验进行分享。2014年将进一步扩大存储容量,本报告也将探讨联盟样本库(虚拟样本库、网络样本库),第三方存储服务等模式在样本库领域的潜在可能性。
本报告最后将宣布几个大型科学研究计划,吸引更多的科研专家一同为发挥样本库资源做出贡献。
New Trends in RNA-Seq
来自Illumina China的测序产品经理余菽亮,分别从以下几个方面做了详细介绍: 在RNA序列的新的趋势,RNA序列的好处,RNA序列的挑战RNA序列的进化,TruSeq Standed RNA dUTP method ,提供完整的rRNA转录覆盖更多还原,TruSeq @ RNA库准备概述,单细胞测序的方法个别肿瘤细胞的转录组分析,细胞类型特异性基因表达标记,Fluidigm单细胞自准备系统概述等。
p63和增强细胞迁移和转移的前列腺癌的miR-205的靶结果损失
Gerry Melino教授介绍了p63和miR-205在细胞迁移和前列腺癌转移中的作用,指出实验证明p53突变能够抑制p63及miR-205的表达。
概述 - 生物谷微信开放平台M-Bio(1)
M-Bio是生物谷自主研发的第三方微信运营平台。课程重点介绍了生物谷微信开放平台M-Bio的主要优势。
M-Bio主要优势包括了平台优势、功能优势及创新整合的优势。尤其在创新方面,M-Bio平台紧跟时代潮流,将目前市场上最新,最酷,最炫的功能融入到平台中,另外独特整合了生物在线产品系统、生物谷资讯系统及更多交互内容。
M-Bio基础功能可以实现:
轻量App的实现、个性化移动端网站。还可获取行业常用小功能导航(如影响因子查询,订单查询等)
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微站-生物谷微信开放平台M-Bio(2)
生物谷微信开放平台(M-Bio)
演示案例:生物在线
微信公众号搜索“生物在线”,或直接搜索 bioonline。
微站的入口
自定义菜单可以作为微站入口
与微信公众号对话,通过关键词进入微站,比如“首页”,“home”
微站是什么?
微站,个性化微信站。
关注企业微信公众号的读者可以在微站中查看企业简介,产品展现,服务说明,促销信息,活动公告,地址,联系方式等内容。
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葛明华:肿瘤生物样本库整体建设--问题与思考
肿瘤生物样本库是肿瘤转化研究的基石。建设前要落实管理人员,然后紧跟国内外肿瘤领域的发展制定肿瘤生物样本库中长期规划。另外,肿瘤生物样本库建设是需要长期投入的一项工程,建设单位领导一开始应在专职人员、场地、资金等方面有充分的投入。
肿瘤生物样本库的建设对于单位肿瘤学科发展起着关键作用。前提是肿瘤样本库建设要高质量的实施,其核心是长期有效保存样本的分子信息,并准确记录其附加信息(包括患者信息、随访信息、样本分子检测信息等)。肿瘤生物样本库建成后能够通过国内、国际专家认证,最好能通过各种质量认证(例如17025等)。
肿瘤生物样本库是一个服务机构,其服务内容包括最初级的原始样本(包括肿瘤冷冻组织、正常冷冻组织、石蜡切片、血清、血浆、白细胞层等),大分子提取和质控,实验数据等。有条件的还开展肿瘤样本库相关研究和咨询、培训工作等。
small RNA-seq - 陈巍学基因(9)
本期课程介绍:
1、small RNA建库测序的方法;
2、small RNA测序数据的生物信息学分析(A、表达量差异分析;B、聚类分析;C、GO分析;D、KEGG Pathway分析);
3、血清和血浆micro RNA测序的意义、和样本准备
illumina测序化学原理 - 陈巍学基因(1)
本期课程介绍Illumina测序的化学原理。
包括文库(library)、芯片(flowcell)、桥式PCR、双端测序。
HiSeq测序仪工作原理 - 陈巍学基因(2)
Illumina HiSeq 2500是精密的显微光学仪器,结合液流、温控、数据处理等一系列系统,输出海量的测序数据。
本课程介绍了其光学结构、扫描方式、图像处理、数据判读、和数据输出方面的知识。
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