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单细胞转录组分析技术在生命科学研究中的应用

2009年,孙毅教授回国后,开始进行大量转化医学研究主要在干细胞治疗脊髓损伤方面开始了一系列原创性的研究。另外在用干细胞建立孤独症模型方面已取得突破性成果。

她带领的团队在同济大学原创性地研发了体细胞单细胞全基因组转录本的RNA深度测序方法并用于研究成体神经干细胞的分子生物学性状,探讨成体干细胞及肿瘤干细胞静息活化过程中的机制,该技术对未来寻找各类疾病包括衰老的分子标记会有划时代的推动。

2014-09-22 课时:39分钟

单细胞DNA测序 - 陈巍学基因(10)

从一个细胞做全基因组的测序,是很有用的分析手段。目前MALBAC方法和MDA方法是两个最主要的单细胞全基因组扩增方法。

本视频介绍了:1、MALBAC方法的原理,和其巧妙之处;2、MDA方法的原理;3、单细胞测序在胚胎植入前检测中的应用

2015-01-01 课时:13分钟

单细胞mRNA测序 - 陈巍学基因(11)

单细胞mRNA测序是很有用的科研方法。

本课程介绍其中2种:Clontech公司的SMART-seq方法,和EpiCentre公司的TargetAmp方法。2种方法各有巧妙,即大量扩增了核酸,又尽可能减少核酸扩增过程中的偏差、失真。

2015-01-19 课时:14分钟

单细胞测序解决方案

单细胞测序针对单个细胞的核酸放大产物进行测序,测序结果具有针对性,更能反映异质性强的组织中某类细胞核酸的变化情况。侯睿博士在视频中先介绍了全基因组重测序的实验和数据分析流程,然后分别介绍了单细胞的基因组和转录组测序的应用领域。视频指出了单细胞测序的技术难点,并介绍了单细胞测序反转录和建库过程中质量控制信息。对单细胞测序,视频从测序位置的偏好性、测序重复性、测序饱和性、基因覆盖度等角度进行了进一步的介绍。最后,还指出了单细胞测序的注意事项。

2015-11-17 课时:24分钟

顶复动物亚门—最原始、最简单、最低等的单细胞动物

David Roos (U Penn) Part 1: Biology of Apicomplexan Parasites

There are more than 5000 species of single-celled eukaryotes in the biological phylum known as the Apicomplexa, including the parasites responsible for malaria, neurological birth defects, and opportunistic infections associated with HIV/AIDS. These ancient protozoa provide a unique window into the evolution of subcellular organelles that have long fascinated cell biologists. Familiar features help to elucidate the origins, functions and design parameters for the secretory pathway, endosymbiotic organelles, the cytoskeleton, and cell cycle control. Conversely, parasite-specific organelles highlight the evolutionary diversity of eukaryotes, and suggest novel targets for treating disease. See more at http://www.ibioseminars.org

2016-03-25 课时:38分钟

黄岩谊:微流控技术与单细胞测序

介绍了精准医学的功能核心,通过生物信息学大数据挖掘来指导癌症临床研究,通过测序来确定个性化药物治疗,介绍了一些基因测序的例子,通过癌症组学信息来指导治疗。通过分子信息来预测病人,制定治疗决策。

2017-06-16 课时:44分钟

常青:单细胞研究进展与细胞异质性

介绍了1.单细胞分析与肿瘤异质性研究。2.单细胞研究技术的发展.

2017-08-23 课时:34分钟

文路:肝癌异质性的单细胞三重组学分析及肝癌患者循环游离DNA甲基化组分析

介绍了单细胞三重组学测序技术,可以检测基因组拷贝数变异、DNA甲基化组和转录组.对一例肝细胞癌症分析,发现了两个细胞亚群。提到CpG岛异常超甲基化存在于几乎所有人类肿瘤。介绍了MCTA-Seq技术。

2017-08-24 课时:33分钟

施奇惠:循环肿瘤细胞单细胞分子与功能检测

主要讨论了循环肿瘤细胞的分选方法、单细胞分子与功能检测,以及潜在的临床应用。

2017-10-11 课时:42分钟

生物谷空中讲坛:单细胞多组学分析论坛

组织中细胞的异质性已经是大家的共识,近年来,研究人员从细胞的基因组、 转录组、蛋白组及代谢组多组学等多个层面去研究生殖发育、肿瘤转移、器官病变、肿瘤微环境的机制。然而,在单细胞水平同时完成多个组学的测序分析依然是一个较大的挑战。同时,随着基础研究和技术的进一步发展,单细胞组学在多个疾病领域的应用也逐步受到更多关注。

2020-04-16 课时:114分钟