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组织染色质在心血管疾病中的作用研究--未来展望

近年来,在研究真核基因组DNA三维结构的技术上取得了突飞猛进的进展。这种组织包括染色体区域、隔间、拓扑相关结构域(TADS)和调控元件之间的相互作用。

2021-10-27

Adv Sci (Weinh) :结直肠癌肝转移的染色质重塑由 HGF-PU.1-DPP4 轴介导

结直肠癌肝脏转移是癌症相关死亡的主要原因。这项研究提出了一种针对转移性癌症中染色质重塑的潜在策略,并有望重新利用药物来治疗转移。

2021-10-27

Genome Biology:染色质lncRNA Platr10控制干细胞多能性

核心干细胞因子基因的特定三维染色体内结构需要将体细胞重编程为多能性。

2021-09-07

中山医学院丁俊军教授团队系统绘制相分离溶解与重建过程的染色质三维结构图谱

细胞内广泛存在相分离(Phase Separation)现象,成千上万的蛋白或核酸分子在复杂的细胞内部形成一个一个无膜“隔间”,就像油滴在水中一样,彼此互不干扰地参与细胞内如转录调控、应激、蛋白质质量控制、DNA复制等多种重要的生物学过程。1,6-己二醇(1,6-HD)是一种能够使得相分离液滴溶解的化学小分子,它是目前唯一的能同时破坏多种相的工具,所以非常有

2021-09-03

Genome Biology:科研人员开发出在单细胞中识别染色质染色质拓扑相关结构域结构的算法

  基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中,这一高级结构即三维基因组学,对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获(3C),尤其是高通量技术(Hi-C,ChIA-PET)的发展推动了三维基因组的研究,发现了包括染色质拓扑相关结构域(TAD),染色质环等一系列层次化的结构特征。近年来,单细胞水平下的Hi-C研究成为三维

2021-08-02

Nat Commun:表观遗传学代码重塑的染色质状态或能赋予小鼠肝脏一定的再生潜能

2021年7月10日 讯 /生物谷BIOON/ --研究人员推测,对肝脏再生至关重要的基因表达的高度控制模式是由静止的肝脏细胞中的表观遗传学代码所编码的;近日,一篇发表在国际杂志Nature Communications上题为“Chromatin states shaped by an epigenetic code confer regenerative

2021-07-10

Cell Reports:组蛋白变体的染色质组装研究取得进展

   Cell Reports在线发表了中国科学院生物物理研究所研究员周政课题组与中科院物理研究所副研究员李伟课题组合作完成的研究论文Recognition of the inherently unstable H2A nucleosome by Swc2 is a major determinant for unidirect

2021-05-29

关于相分离通过调控染色质三维结构重组促进细胞命运转变的研究在Cell Stem Cell发表

真核细胞染色体通常会有序的折叠,在空间上会形成有序的三维结构。这些三维结构由大到小主要分为区室分隔(compartments)、拓扑相关结构域(Topological-Associated Domains,TADs)以及染色质环状结构(loops)等。细胞命运转变过程中往往伴随着染色体三维结构的剧烈变化,而这些变化对于推动细胞命运转变的进行起到重要作用。TA

2021-06-03

研究揭示人类衰老细胞空间基因组表观调控核心机制并绘制衰老相关染色质全局景观图谱

   中国科学院上海营养与健康研究所研究员孙宇课题组经合作研究在Nature Aging上,在线发表题为KDM4 Orchestrates Epigenomic Remodeling of Senescent Cells and Potentiates the Senescence-Associated Secretory Ph

2021-05-19

研究从染色质三维结构水平揭示籼粳稻耐热性差异机制

  近日,中国农业科学院生物技术研究所作物耐逆性调控与改良创新团队从染色质三维结构上揭示了籼稻和粳稻的高温抗性差异机制,为研究表观遗传调控作物重要农艺性状及提高抗逆性提供了新的研究视角。相关研究成果发表在国际学术期刊《BMC Biology》(BMC生物学)上。据专家介绍,染色质三维结构与基因组功能高度相关。目前少数真核生物中仅报道了环境

2021-04-08