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Nat Commun:实验室”重建“基因组

合成生物学研究不仅包括观察和描述生命过程,而且试图模仿天然的生命过程。在最近的一项研究中。马丁斯里德马克斯·普朗克生物化学研究所的科学家们制作了一个系统,该系统能够再生其自身的DNA和蛋白质构件的一部分。

2020-02-21

安捷伦基因组学系列讲座:安捷伦最新二代测序建库方案,攻克 FFPE、液态活检等复杂样本的难题

随着样本量增加,高通量测序平台,如 NovaSeq 被越来越多的采用,而标签跳跃问题、样本标签数目限制混样数量等问题也随之而来。而随着精准医疗的发展,肿瘤样本,特别是FFPE样本、液态活检样本的测序需求越来越大,但建库环节、PCR环节、测序本身的错误率,以及前面提到的标签跳跃问题都限制了低频变异的检出,给测序服务与产品的开发带来难题。

2020-02-21

新冠病毒的基因组序列分析

2月3日,《自然》在线发表论文介绍了上海公共卫生临床中心和复旦大学公共卫生学院教授张永振等人对2019-nCov的基因组序列的分析。该病毒基因组从就职于出现首批患者的海鲜市场的一名病人身上获得。基因组分析显示,该病毒与此前在中国蝙蝠体内找到的一组SARS样冠状病毒密切相关。最近出现在武汉的一种2019-nCov已传播到中国其他地区和其他几个国家,其中包括美国

2020-02-07

研究人员发布高质量角苔参考基因组

 苔藓类包括苔、藓和角苔三大分支,是现存最早的陆生植物,代表了植物演化过程中从水生到陆生的过渡类群。长久以来关于早期陆地植物的起源与植物登陆一直存在诸多争论和未解之谜。近年来,人们利用组学数据将早期陆地植物的系统位置争论聚焦到了角苔类上。角苔类以其难解的系统位置、衍生与原始兼具的形态特征、与细菌和真菌广泛共生的特异现象而备受关注。在中国科学院植物研

2020-02-12

国家基因组科学数据中心首次公开新型冠状病毒全基因组序列

国家基因组科学数据中心(NGDC)信息显示,1月26日,该中心收录了由中国医学科学院/北京协和医学院病原生物学研究所提供的5株2019新型冠状病毒全基因组序列。

2020-01-30

关于癌症全基因组 我们有了全新的认识

今日,最新一期《自然》杂志如约上线,而登上封面的“癌症全基因组”则是本期的主题:在本期《自然》杂志上,一共发表了6篇相关的论文。而在Nature Genetics、Nature Biotechnology、以及Nature Communications等子刊上,也有系列论文发表。那么,是什么样的研究项目引起了如此的重视呢?具体来看,主导这些研究的是“泛癌症全

2020-02-06

Nat Genet:揭秘线粒体基因组奥秘 或有望帮助开发多种癌症新型疗法

2020年2月11日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Genetics上的研究报告中,来自德克萨斯大学安德森癌症中心等机构的科学家们对细胞的能量工程—线粒体进行了深入研究,由于线粒体在肿瘤发生中扮演着关键角色,因此深入研究线粒体的基因组对于揭示肿瘤发生机制及开发新型疗法至关重要。图片来源:CC0 Public Domain

2020-02-11

科学家成功揭秘人类癌症基因组中“染色体碎裂”的奥秘

2020年2月12日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Genetics上的研究报告中,来自哈佛医学院和欧洲分子生物学实验室的科学家们对癌症中新发现的染色体碎裂(chromothripsis或chromosome shattering)现象进行了最大规模的分析,这项研究是迄今为止同类研究中规模最大的一项研究,其包含了38种不

2020-02-13

Nature:首个系统性癌症基因组图谱问世——揭示癌细胞演化之谜

近日,《Nature》杂志在线发表了由EMBL-EBI领导的一系列新研究,即系统性癌症全基因组分析项目。该项目参与机构包括惠康桑格研究所,麻省理工学院,哈佛大学,牛津大学大数据研究所以及俄勒冈州健康与科学大学等。

2020-02-07

两篇Cell子刊文章深度剖析基因组自我调节的新型分子机制

2020年2月7日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,两篇刊登在国际杂志Molecular Cell上的研究报告中,来自加州理工学院等机构的科学家们通过研究揭示了基因组自我调节的分子机制。生物体的基因组中包含了每个细胞和组织发育和发挥正常功能所需要的所有信息,当被写入DNA后,每个基因都会进行信息编码,包括帮助确定组织形状的结构蛋白、催化生命化学反应的酶、

2020-02-08