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研究完成肯尼亚两种吊兰属物种叶绿体基因组的解析

 吊兰属(Chlorophytum),是一个物种较多而又极为复杂的属,隶属于天门冬科(Asparagaceae),包含215种,6亚种,14变种,具有重要的观赏和药用价值,特别在园艺上,占据着重要地位。新一代测序技术使得基因组测序成本急剧下降,每年都有大量物种的叶绿体基因组信息被揭开,数据被广泛应用于植物系统学研究。当前,吊兰属叶绿体全基因组数据有

2020-05-22

Nat Commun:基因组研究有助于抗细菌感染

嗜麦芽孢杆菌菌株长期存在与自然界中,长期以来,我们一直认为这种细菌对人类健康没有威胁,但如今逐渐被发现为最令人担忧的医院来源的病原体之一,因为它经常引起感染并且对多种抗生素具有抵抗力。

2020-05-16

Nat Genet:基因组学研究揭示导致乳腺癌发生的原因

最近,一项对涵盖26.6万名女性的遗传研究的分析表明,人类基因组中有32个新位点的变异似乎影响了乳腺癌的患病风险。该发现被认为首次将此类风险变异与多种乳腺癌亚型相关联起来。文章作者来自美国约翰霍普金斯大学。

2020-05-20

水生植物莲的基因组进化研究取得进展

 全基因组复制(whole-genome duplication, WGD)亦称古多倍化,在被子植物辐射进化过程中频繁发生。在现存的被子植物中,绝大多数的物种在其进化历史中曾发生过至少一次全基因组三倍化或多次连续的基因组加倍,少数物种发生了单次全基因组加倍。植物基因组的加倍所获得的冗余复制基因为植物进化提供了遗传原料,在后续植物表型进化及其对(极端

2020-05-06

Transl Psych:大量使用大麻或会影响人类机体基因组的功能

2020年5月11日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在国际杂志Translational Psychiatry上的研究报告中,来自坎特伯雷大学等机构的科学家们通过研究发现,大量使用大麻会对机体DNA产生影响,但这对于吸烟的人群影响似乎更大。文章中,研究者揭示了大量使用大麻诱发DNA甲基化改变的分子机制,DNA的甲基化改变会影响机体基因的表达和功能

2020-05-11

科学家在9天内成功对11个人类基因组进行完整测序

2020年5月7日 讯 /生物谷BIOON/ --三年前,来自加利福尼亚大学圣克鲁兹分校的科学家们就通过研究证明,利用在校园开发的相同纳米孔测序就能实现对对人类基因组的长时间阅读分析,这在当时的确是一项巨大的研究进展,但其却需要15万小时的计算时间和数周的工作。一年后,研究者开发的名为PromethION的纳米孔测序仪就被证明是非常快速、且便宜而且容易操作的

2020-05-07

JVI:在新冠病毒SARS-CoV-2基因组中发现一种独特的新突变

2020年5月14日讯/生物谷BIOON/---随着冠状病毒大流行席卷全美,除了追踪COVID每日病例数外,全球科学界也在参与追踪SARS-CoV-2病毒本身。美国亚利桑那州立大学生物设计研究所助理教授Efrem Lim及其团队研究了这种病毒如何随着时间的推移进行传播、突变和适应。为了在全球范围内追踪这种病毒的踪迹,Lim团队正在使用一种新的技术---下一代

2020-05-14

研究以基因组为中心解析北美白垩纪晚期尖角龙化石中的新型微生物谱系

  古生物学研究曾频繁报道,中生代恐龙化石经过约2.5亿年~6500万年仍然出乎意料地保存着胶原蛋白、血管等内源性有机物。但考虑到蛋白质易于降解,且在逾百万年的时间里微生物很多已聚居于骨骼中的孔隙内,所以这些内源性的软组织是否可以残存在中生代化石骨骼中一直备受争议。研究人员对蛋白质不稳定性进行了广泛研究,但恐龙化石骨骼中微生物群的基因组多

2020-05-16

PLoS ONE:科学家利用机器学习技术成功追踪COVID-19的基因组特性

2020年5月12日 讯 /生物谷BIOON/ --日前,一篇发表在国际杂志PLoS ONE上的研究报告中,来自西安大略大学等机构的科学家们通过研究利用机器学习技术识别出了29种不同COVID-19 DNA序列的潜在基因组特性。这种新型的数据发现工具能够帮助研究人员快速且容易地在几分钟内对诸如SARS-CoV-2等致死性病毒进行分类。图片来源:PLOS ON

2020-05-12

基因组测序揭示喀斯特植物适应性进化机制

中国南方喀斯特起源古老、分布广泛。该地区气候温和、水分充足,广泛分布的峰林、峰丛、溶洞、天坑等复杂的地貌形态形成独特的岛屿化生境,被认为是生态与进化研究的“天然实验室”。经过漫长的演化,华南喀斯特地区孕育了高度的物种多样性和特有性。喀斯特植物是我国植物多样性和特有性的重要组成部分,但迄今为止对喀斯特植物的多样性起源和适应性进化的理解还非常缺乏。全基因组复制(

2020-04-17