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科研人员发表高质量染色体级醋栗番茄基因组序列

醋栗番茄是栽培番茄的野生祖先种,以其优异的抗性、浓郁的风味、可与栽培番茄直接杂交、快速转育优良性状等特点,广泛用作现代番茄育种的重要种质资源。其基因组和遗传多样性的研究,对充分挖掘该野生种质资源的育种潜力和价值,促进番茄产业发展意义重大。因此,醋栗番茄的基因组研究受到研究者关注,此前已有个别基因组草图发布,但是,这些草图并不完整,高度碎片化,限制了它们在育种

2020-12-02

中国水产科学研究院珠江所叶星研究员团队发布首个大口黑鲈染色体水平基因组图谱

 近日,珠江水产研究所叶星研究员团队完成了大口黑鲈染色体水平基因组精细图谱的绘制和遗传解析,研究论文“Chromosome-level genome assembly for the largemouth bassMicropterus salmoidesprovides insights into adaptation to fresh and

2020-11-11

纳米孔PromethION测序+Shasta完成人类基因组端粒到着丝粒的高效从头组装

 Shasta是一个用于纳米孔测序数据的从头组装和矫正算法,由加州大学圣克鲁兹分校(UCSC)和陈-扎克伯格倡议计划(CZI)联合开发。团队在2019年利用初代Shasta分析流程对纳米孔测序数据进行从头组装、矫正和Hi-C拼接Scaffold(图1),使用一台纳米孔PromethION测序设备在9天内完成了11个人类基因组测序,研究成果发表在《N

2020-11-19

一种新型系统能在3小时内对染色体端粒进行准确分析!

2020年9月22日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Science Advances上题为“Massively parallel single-molecule telomere length measurement with digital real-time PCR”的研究报告中,来自新加坡国立大学等机构的科学家们通过研究开发了一

2020-09-22

首个染色体水平大蒜基因组图谱绘制成功

7月27日,《分子植物》(Molecular Plant)在线发表首个染色体水平大蒜基因组图谱。被测序的大蒜品种是二水早紫皮蒜,其适用性广,在我国种植地域最广。这项成果由中国农业科学院麻类研究所(以下简称麻类所)南方蛋白饲料植物资源开发与利用团队联合有关高校和企业,历时4年完成。论文通讯作者、麻类所研究员刘头明介绍,大蒜是重要的蔬菜作物之一,我国大蒜的年播种

2020-08-04

Nat Biotechnol:新型DNA碱基编辑器扩大精准基因组编辑的应用领域

2020年7月26日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国麻省总医院和哈佛医学院的研究人员开发出的新型基因组编辑技术有潜力有助于理解基于C→G(由胞嘧啶突变为鸟嘌呤)单碱基变化的疾病相关基因突变。这些新的碱基编辑器也被设计为最大限度地减少可能导致不良副作用的非预期(“脱靶”)突变。相关研究结果于2020年7月20日在线发表在Nature Bi

2020-07-26

研究揭示脊椎动物异源多倍基因组演化的动态历史

 多倍化现象在脊椎动物中极为罕见;多倍体脊椎动物在多倍化发生和其后的二倍化进程中可能经历基因组休克效应。但对于相关演化遗传机制是什么、机制是否相同等问题,存在不同假说和许多尚待澄清的问题(PNAS 2016及其他文献)。在张亚平院士领导下,云南大学省部共建云南省生物资源保护与利用国家重点实验室罗静教授、中科院昆明动物研究所吕雪梅研究员、湖南师范大学

2020-06-24

科学家成功揭秘人类癌症基因组中“染色体碎裂”的奥秘

2020年2月12日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Nature Genetics上的研究报告中,来自哈佛医学院和欧洲分子生物学实验室的科学家们对癌症中新发现的染色体碎裂(chromothripsis或chromosome shattering)现象进行了最大规模的分析,这项研究是迄今为止同类研究中规模最大的一项研究,其包含了38种不

2020-02-13

原因竟是Y染色体关键基因的缺失

大量研究发现,男性要比女性更容易患癌,但目前研究人员并不清楚造成这种差异背后的原因,近日,一项刊登在国际杂志Journal of the National Cancer Institute上的研究报告中,来自巴塞罗那全球卫生研究所等机构的科学家们通过研究鉴别出了一种能够让男性患癌风险增加的关键生物学机制,即决定性别的Y染色体特定基因的功能缺失。

2020-02-02

中国科学家公布斑马鱼1号染色体基因敲除研究成果

斑马鱼是一种小型热带淡水鱼。自上世纪70年代美国俄勒冈大学的George Streisinger教授将斑马鱼首次引入实验室以来,斑马鱼逐渐成为与小鼠、果蝇、线虫并列的四大模式动物之一。在40多年的斑马鱼研究发展历史中,欧美斑马鱼学者发起了几次大规模的斑马鱼随机诱变突变体库(Mullins et al. 1994; Solnica-Krezel et al.

2020-01-11