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单细胞多组技术揭示三维基因与基因表达的关系

在高等真核生物中,基因组在细胞核内的三维空间构象对细胞功能至关重要。例如,增强子常常通过三维空间相互作用对远端目的基因的转录活性起调控作用

2023-06-21

EMBO Reports丨钟国华团队揭示果蝇卵巢生殖干细胞单细胞转录特征及eggplant调节分化发育潜在机制

果蝇卵巢生殖干细胞(germline stem cell,简称GSC)是干细胞生物学研究的理想模型【1】,其增殖与分化受细胞内在调控因子和微环境信号共同作用。许多参与调控GSC的内源基因与哺乳动物干细

2023-08-24

单细胞转录测序,揭示动物发育过程“古老”和“年轻”基因的表达模式

这一研究揭示了不同细胞类型在转录组年龄上的显著差异,有助于对不同细胞的进化起源进行估计,为理解驱动物种进化的遗传机制提供了新的视角

2023-05-17

应晓敏/伯晓晨团队开发基于生成式人工智能的新算法MIDAS,实现单细胞多组数据的马赛克整合

研究提出了一种用于单细胞多组学数据马赛克整合及知识迁移的计算工具——MIDAS,首次实现了通用的单细胞多组学马赛克数据的模态对齐、数据补全、批次校正等整合功能。

2024-01-25

Nat Methods | 单细胞三维基因与基因表达联合分析:北京大学谢晓亮等团队揭示嗅觉受体选择的动态过程

该研究结果揭示了一个值得注意的模式:在OSN发展过程中,OR增强子的可及性降低,表明只有一部分增强子在成熟的OSN中保持活性。

2024-04-17

Nat Aging | 华中科技大学王世宣/栗妍/戴俊揭示人类卵巢衰老的时空转录变化及FOXP1的调控作用

该研究提出了一个时空图谱,系统地描述了在卵巢生命周期的三个代表性阶段人类卵巢衰老的空间原型和细胞异质性:生殖年轻(18-28岁),中年(36-39岁)和老年(47-49岁)。

2024-04-11

Cell:张鹏/周虎/季红斌/高大明团队合作绘制小细胞肺癌蛋白基因图谱

该研究是国际上首次大规模对小细胞肺癌临床队列开展蛋白质组和磷酸化蛋白质组表征。

2024-01-08

2023(第六届)单细胞多组研究与应用研讨会,9月14日开幕在即!

2023第六届单细胞多组学研究与应用研讨会,2023年9月14-15日,上海北虹桥绿地铂骊酒店

2023-09-06

迄今最大规模研究破解持久性CAR-T细胞转录特征

Ghorashian团队认为,他们这个研究最重要的发现是发现了持久性CAR-T细胞的独特转录特征。而且这个特征在不同人群、不同CAR-T疗法中也存在。因此这暗示着,这种独特的转录特征有可能代表了持久性

2023-07-14

第六届单细胞多组峰会嘉宾日程公布,20+大咖技术分享,800+业界同行9月共聚魔都

全议程首发!第六届单细胞多组学峰会嘉宾日程公布,20+大咖技术分享,800+业界同行9月共聚魔都

2023-08-11