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研究揭示拟南芥细胞基因组重组与变异积累规律

 近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所绿色轻简超级稻遗传解析与分子育种创新团队研究揭示了MSH1基因参与介导拟南芥细胞器基因组重组与变异积累规律,为改造细胞器遗传物质,优化作物育种提供了理论支撑。

2022-10-06

Science:微生物单细胞时代正式开启:微生物高通量单细胞基因组学

该方法应用面广泛,可用于具有复杂微生物群落的样本,如粪便、土壤和海洋等,在微生态研究中具有极大的市场应用潜力。

2022-06-08

南海所首次完成斑节对虾单细胞基因图谱构建

 近日,中国水产科学研究院南海水产研究所李运东博士等人成功完成斑节对虾单细胞测序,构建了首个斑节对虾单细胞基因图谱,为对虾抗逆机制的遗传解析提供了重要理论依据。相关研究成果发表在Frontiers

2022-05-14

Science:利用单细胞eQTL定位确定自身免疫性疾病的细胞类型特异性基因控制

人类的免疫系统已经进化到通过调节专门的细胞群体来维持组织稳态和靶向外源性病原体。它在不同个体之间显示出巨大的差异,决定了人们对疾病易感性和对病原体或癌症的反应是如何不同。

2022-04-09

Cell:新研究构建出人类基因组中的单细胞染色质图谱

在一项新的研究中,来自美国加州大学圣地亚哥分校的研究人员为人类基因组构建出单细胞染色质图谱。染色质是真核细胞中发现的由DNA和蛋白组成的复合物;在某些细胞核内,关键基因调控元件所在的染色质区域以开放的结构出现。在不同人类组织类型的细胞中精确地确定这些可访问的染色质区域将是理解基因调控元件(非编码DNA)在人类健康或疾病中的作用的重要一步。

2021-11-22

Cell:基因表达和单细胞形态的全身整合

本研究系统地探索了细胞类型特异性基因表达与形态之间的联系。根据基因表达对分段细胞进行聚类揭示了空间连贯的组织。通过对全身连接组学和转录组的全面整合比较内部和之间的细胞和神经回路生物在基因和超微结构水平,更有助于理解生命系统的发展和演变。

2021-10-27

Gastroenterology:研究通过单细胞基因组测序揭示肝细胞癌的双相拷贝数演化模型

胃肠病学领域学术期刊Gastroenterology以长文形式在线发表了北京大学第一医院肿瘤转化研究中心张宁课题组的研究成果。在题为“Single cell DNA sequencing reveals punctuated and gradual clonal evolution in hepatocellular carcinoma”的研究论文中,研究人

2021-09-15

癌症免疫技术进展:从免疫基因组学到单细胞分析和人工智能

2021年8月28日讯/生物谷BIOON/---免疫疗法在癌症治疗中起着至关重要的作用。

2021-08-28

Science:利用sci-Space技术在单细胞水平上揭示细胞基因转录的空间分布模式

2021年7月6日讯/生物谷BIOON/---一项名为sci-Space的新技术与来自其他技术的数据相结合,可能会在哺乳动物胚胎发育过程中,通过不同细胞的基因表达绘制出四维图谱。这类图谱将描绘出单个细胞中的基因转录本如何反映出时间的流逝、细胞谱系、细胞迁移以及发育中的胚胎位置。它们还将有助于阐明基因表达的空间调节。哺乳动物胚胎发育是一种了不起的现象:一个受精

2021-07-06

Genome Biology:开发出单细胞基因组单分子测序新方法

单细胞全基因组测序技术(scWGS)可以有效揭示生物样品中不同细胞之间的异质性,并系统鉴定单个细胞的基因组中发生的遗传变化,例如拷贝数变异(CNV)和点突变(单核苷酸变异,SNV)等。过去十年,研究人员已经开发出多种单细胞基因组扩增技术,例如简并寡核苷酸引物PCR扩增技术(DOP-PCR)、多重置换扩增技术(MDA)、多重退火和基于环的扩增循环技术(MALB

2021-07-07