Nature：利用单细胞转录组学揭示成神经管细胞瘤不同亚型的细胞组成
2019年7月28日讯/生物谷BIOON/---成神经管细胞瘤（medulloblastoma）是一种恶性儿童小脑肿瘤类型，包含不同的分子亚型。成神经管细胞瘤已被分为四种不同的分子亚型：WNT和SHH（均由它们的同名基因发生的突变驱动），组3和组4。组3和组4占所有成神经管细胞瘤病例的60％，但是也最少被人理解的。这部分上是因为当前没有在遗传上准确地模拟组4的实验室模型。此外，尽管这些亚型的基因组
科学家绘制造血干细胞扩增组织的3D转录组图谱
血液系统中贮藏着一种具有自我更新、分化成各种血细胞潜能的成体干细胞，称为造血干细胞，它能够维持机体长久造血和组织稳态。造血干细胞移植是恶性血癌的有效治疗手段，但干细胞来源不足成为限制该治疗广泛应用的瓶颈。因此，造血干细胞的发育，尤其是造血干细胞扩增的研究备受关注。然而，现在的研究主要集中在特定细胞群体或关键因子的“线性化”或“平面化”解析，缺乏全面“立体化”的分析。从系统生物学角度解析
Nat Commun：揭秘转录因子“勘察”细胞基因组的分子机制
2019年2月12日 讯 /生物谷BIOON/ --转录因子（TFs）是一种能调节基因表达的特殊蛋白，其能在完整的基因组中搜索并结合特殊区域来调节基因的表达；我们都知道，转录因子不仅能结合特殊的DNA序列，还能非特异性结合任何DNA链。这些非特异性的关联就能够明显增加转录因子寻找特殊靶点的能力，然而目前研究人员并不清楚在扫描大量基因组、定位以及结合特殊位点时，人类机体中超过1500种转录因子的的效
樟科植物比较转录组学研究获进展
樟科植物在克朗奎斯特分类法中被分到木兰亚纲（Magnoliidae）中，被视为双子叶植物中比较原始的类群。这类植物的萼瓣不分，花瓣和萼片联合在一起，统称花被。樟科树种具有多种经济用途，许多种类的种子富含脂肪酸。然而，这一类群的遗传学与基因组学研究背景十分薄弱，目前仅有鳄梨（Persea americana）、山胡椒（Lindera glauca）和山鸡椒（Litsea cubeba）等
转录组层面上研究蛋白质-RNA相互作用的技术及方法综
两周前，小编给大家推荐了清华大学张强峰教授在QB期刊上发表的关于转录组层面上研究RNA-RNA相互作用的干湿实验方法的综述文章后（点击这里进入该篇文章），引起了许多小伙伴的关注。并且也有小伙伴问，RNA在转录组层面上的相互作用不仅有RNA-RNA之间的，应该还有蛋白质-RNA之间的相互作用呢！那关于RNA-蛋白质相互作用的研究进展又如何呢？
QB期刊 |转录组层面上RNA-RNA相互作用（RRI）的研究进展及机遇综述
最近关注CNS的同学们一定对“Phase Separation”这个词相当眼熟。这个单词翻译成中文就是“相变”或“相分离”。对，你没有看错，就是这个物理化学领域的术语。但最近，这个术语在生命科学领域也掀起了“热浪”。因为据不完全统计，从2018年1月到现在，关于该方面的研究已经有20多项工作分别发表在了Science、Nature或Cell上（对这个领域还不知道的同学，赶紧点击这里，先脑补一下哦
Gotham成立 表观转录组学进入转化阶段
10月11日，纽约的Gotham Therapeutics获得5400万美元A轮投资，正式挂牌成立。Gotham的技术平台是表观转录组学（epitranscriptomics）、即调控RNA的化学修饰。Gotham主要关注一种叫做m6A(6-甲基腺苷)的常见mRNA修饰，这个修饰在RNA代谢中起到关键作用、与多种疾病相关。这是继今年五月Accent Therapeutics
利用sci-CAR方法同时分析上千个细胞中的转录组和染色质可接近性
2018年9月6日/生物谷BIOON/---不同细胞类型的基因组可能是相同的，但是它们的表观基因组和转录组不是相同的。表观基因组由一组影响每个细胞的基因组发挥何种功能的标记组成，而转录组指的是在某一特定条件下，细胞内所有转录产物的集合。转录产物经翻译后会产生蛋白。在RNA转录过程中，细胞仅能够接近它们的染色质包装的双链基因组的某些部分。鉴于这种接近在不同细胞类型之间存在着变化，因此染色质可接近性有
Science：构建出真涡虫细胞类型转录组图谱
2018年4月24日/生物谷BIOON/---真涡虫是一类相对简单的动物，具有不同寻常的生物学特征：成年真涡虫维持着其他有机体仅在胚胎中短暂存在的发育信息和祖细胞（progenitor cell）。真涡虫获得人们的大量研究，部分原因在于它们具有再生丢失的或受损的身体部位的独特能力。图片来自Christopher Fincher/Whitehead Institute。在一项新的研究中，来自美国怀特
转录组学研究领域重要研究进展一览
转录组学，即在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科，近年来，科学家们在转录组学研究领域取得了多项研究成果，本文中，小编对相关重要研究进行整理，分享给大家！【1】Cell：基于高通量单细胞转录组测序小鼠全细胞图谱发表doi：10.1016/j.cell.2018.02.001在国家自然科学基金项目等资助下，近日，浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳