研究鉴定出小麦穗发育的转录调控因子
为促进小麦穗发育研究和分子设计育种,团队与合作者搭建了小麦穗发育多组学数据库,提供了包括基因信息查询、共表达分析、TRN预测、表观图谱绘制及突变体库检索等模块在内的“一站式”服务。
2024-02-12
EMBO Reports丨钟国华团队揭示果蝇卵巢生殖干细胞单细胞转录特征及eggplant调节分化发育潜在机制
果蝇卵巢生殖干细胞(germline stem cell,简称GSC)是干细胞生物学研究的理想模型【1】,其增殖与分化受细胞内在调控因子和微环境信号共同作用。许多参与调控GSC的内源基因与哺乳动物干细
2023-08-24
Cell:揭示生长中的细胞加快转录速度的机制
研究者发现,生长中的细胞之所以能产生所需的 RNA,是因为一种名为 RNA 聚合酶 II(RNAPII)的关键酶的可用性在不断增加,而这种酶的可用性会随着细胞大小的增加而增加。
2024-02-29
Nature:揭示组蛋白修饰调节先锋转录因子协同性结合机制
就像紧紧缠绕在线轴上的线一样,DNA被包裹在组蛋白上,并被包装成称为核小体的结构。在一项新的研究中,来自美国圣犹达儿童研究医院的研究人员探索了一种被称为先锋转录因子(pioneer transcrip
2023-05-30
单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。
2024-02-21
Nature子刊:诸颖团队开发空间转录组语义注释新算法Pianno
在这项研究中,研究团队展示了Pianno在注释各种形状的解剖结构以及病灶和细胞类型方面的卓越性能,这些数据来自不同的空间技术平台。
2024-04-10