菱属泛基因组和结构变异研究中获进展
水稻、玉米和小麦是三大主粮作物,但主粮来源单一成为粮食安全和营养安全的隐患,因此对“孤儿作物”(orphan crop)的重视利用是应对粮食安全危机的有效手段之一。然而,随着城
2023-10-20
研究揭示三维基因组拓扑相关结构域边界的CTCF组织规律
该研究首次解析了三维基因组TAD边界处朝向TAD外CTCF位点的重要生物学功能,揭示了TAD边界CTCF位点的组织架构规律,为阐明TAD边界处成簇CTCF位点的绝缘功能提供了新的思路。
2023-12-17
Nature:新研究解析出参与基因组编辑蛋白质的3D结构
在一项新的研究中,该团队发现了一种名为TnpB的蛋白的三维结构,它可能是CRISPR-Cas12酶的前体。相关研究结果发表在2023年4月13日的Nature期刊上。
2023-04-27
上海交大科研团队精准表征人类完整基因组中的大尺度结构变异
该项研究对GRCh38和T2T-CHM13之间大规模差异基因组区域的结构和功能进行更全面和详细评估。该结果不仅有助于我们对基因组中复杂结构遗传多样性的认识,还提出了消除参考偏差来推动未来的科学研究。
2023-07-17
3篇Nature论文连发:人类泛基因组首个草图公布
田纳西大学健康科学中心的 Erik Garrison 和同事观察了异源着丝粒染色体短臂(中节位于靠近染色体一端)间的重组模式,对一种过去曾推测存在但因缺乏合适数据未观测到的染色体之间的DNA交换机制提
2023-05-15
Science:揭示人类加速进化区发生的结构变异导致人类基因组折叠方式不同于其他灵长类动物
一百多万年前,人类基因组的大部分发生重组---这是卵子或精子形成过程中的偶然事件,可导致了DNA片段的缺失、重复或逆转。如今,在一项新的研究中,来自美国格拉斯通研究所的研究人员发现,这些结构变异(st
2023-05-08
专攻RNA 3D结构预测,Atomic AI欲推出RNA版AlphaFold加速药物发现!
“人们已经摘取了蛋白质大地上所有低垂的果实,”Townshend说,“现在该追逐新的生物学了。”
2023-02-06
Nature子刊:研究揭示三维基因组的单分子拓扑结构多样性和细胞异质性
高等真核生物基因组存在复杂的三维空间结构,在不同尺度下形成如染色质环(Chromatin loops)、拓扑关联结构域(TADs)、活性/非活性染色质区室(A/B compartments)和染色体域
2023-03-10