Genome Biol：科学家识别出能影响基因表达和机体表型的RNA编辑事件
来源：本站原创 2021-03-15 22:14
2021年3月15日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Genome Biology上的研究报告中，来自费城儿童医院等机构的科学家们通过在实验室中将对大数据的计算机挖掘与实验检测手段相结合，识别出了能影响基因表达，进而影响该表达所产生的表型表现的RNA编辑事件；当对所谓的A至I RNA编辑（即RNA分子中的腺苷被化学修饰成为肌苷）进行分析
2021年3月15日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Genome Biology上的研究报告中，来自费城儿童医院等机构的科学家们通过在实验室中将对大数据的计算机挖掘与实验检测手段相结合，识别出了能影响基因表达，进而影响该表达所产生的表型表现的RNA编辑事件；当对所谓的A至I RNA编辑（即RNA分子中的腺苷被化学修饰成为肌苷）进行分析后，研究人员描述了RNA编辑所诱发的单核苷酸改变如何产生下游效应。
研究者Yi Xing说道，如今我们在人类转录组中识别出了数百万个A至I的RNA编辑位点，但大部分RNA编辑事件的功能却是未知的，理解RNA编辑影响基因表达和表型的分子机制或有望帮助研究人员揭开人类多种疾病背后的遗传奥秘。这项研究中，研究人员通过人类遗传突变的视角研究了RNA编辑的功能，或者发生在近1/1000的DNA碱基对中的差异，这些差异不仅会影响基因的表达，还会影响mRNAs被加工的方式。
图片来源：CC0 Public Domain
随后研究人员分析了来自NIH基因型组织表达（GTEx）计划中437名个体中49种组织（共大约8000份人类样本）所匹配的遗传和转录组学数据，他们旨在寻找与不同个体之间基因突变相关的A-I RNA编辑事件。研究人员利用了一种涉及分子数量形状基因图谱（QTL，quantitative trait loci）的方法进行研究，该方法能能分子特征映射到基因型中，从而来发现其对基因调控所产生的遗传效应，分子QTL研究能为阐明指导生物学过程的遗传机制提供新的线索和思路。
利用这一方法，研究人员识别出了3117个特殊的RNA编辑事件与基因突变有关；让他们惊讶的是，14%的RNA编辑QTLs与基因表达的遗传突变直接相关，当将这些研究数据与可用的全基因组关联性研究数据进行比较后，研究人员发现了一类RNA编辑QTLs事件，其或与人群机体的复杂特征或疾病发生相关。
为了深入理解RNA编辑突变如何与基因表达突变相结合，研究人员重点对microRNAs进行研究，其是一类小型非编码RNAs，其能通过结合mRNAs上的互补序列来调节基因表达，并诱发结合的mRNA分子被降解；研究者发现，特定的microRNAs能够降解或不降解靶向mRNAs，这取决于是否mRNA中既定的RNA编辑位点仍然是一种未编辑的腺苷（A）还是已经编辑后的肌苷（I）。如果诸如此类编辑能被人类遗传突变所调节的话，就会通过改变关键mRNA分子的稳定性和丰度来诱发一系列下游事件，进而就会使得mRNA分子影响表型。
最后研究者Xing说道，这种方法之所以有用，因为其对于研究疾病是未知的，后期我们还将会利用这一策略来研究特定的人类疾病，并从疾病的角度来阐明RNA编辑事件所产生的影响。（生物谷Bioon.com）
原始出处：
Park, E., Jiang, Y., Hao, L. et al. Genetic variation and microRNA targeting of A-to-I RNA editing fine tune human tissue transcriptomes. Genome Biol 22, 77 (2021). doi：10.1186/s13059-021-02287-1
版权声明 本网站所有注明“来源：生物谷”或“来源：bioon”的文字、图片和音视频资料，版权均属于生物谷网站所有。非经授权，任何媒体、网站或个人不得转载，否则将追究法律责任。取得书面授权转载时，须注明“来源：生物谷”。其它来源的文章系转载文章，本网所有转载文章系出于传递更多信息之目的，转载内容不代表本站立场。不希望被转载的媒体或个人可与我们联系，我们将立即进行删除处理。
