一个高度注释的与癌症铂耐药相关的基因数据库

10-20% 的癌症患者接受了铂类化疗，包括顺铂、卡铂和奥沙利铂。不幸的是，铂耐药在大量患者中产生，并成为临床结果的决定因素。铂耐药的机制可分为几个广泛的生物学过程，包括调节药物的进入、退出、积累、隔离和解毒，增强铂诱导的DNA损伤的修复和耐受性。

细胞存活途径的改变，多效过程和途径的改变，以及肿瘤微环境的改变。作为癌症研究社区的资源，作者提供了一个全面的概述，并手工整理了过去30年文献中与铂耐药相关的900个基因/蛋白的数据库。该数据库注释了可能的途径，通过其策划的基因与铂耐药性有关，证据类型，和超链接到文献来源。这个可搜索、可下载的数据库可以在http://ptrc-ddr.cptac-data-view.org网站上找到。

图片来源：https://www.nature.com/articles/s41388-021-02055-2

顺铂，第一种基于铂的抗癌疗法，在1978年被FDA批准用于治疗睾丸癌，大约10年前，它的细胞毒性功能被Barnett Rosenberg意外发现。为了减少副作用和增加细胞毒性，两种新的铂化合物，卡铂和奥沙利铂，随后被开发并被FDA批准。其他配方已在其他国家获得批准，新的铂配方目前正在开发中。据美国国家癌症研究所估计，大约10 - 20%的癌症患者将在治疗过程中接受铂类药物。

铂的主要细胞毒性机制是由于在DNA中产生单加合物和交联物，尽管已有其他细胞毒性活性的报道。铂引起的DNA损伤导致严重的细胞应激、细胞凋亡和免疫反应，这些共同解释了铂的抗癌作用。肿瘤对铂治疗的反应是复杂的，异构的，并涉及肿瘤的内在和外在活动。

也许相应地，抗性的发展包含多种机制。在过去的30年里，人们进行了广泛的研究，以了解这些耐药性的机制，它可以大致分为以下生物过程: (1)调节药物的进入、退出、积累、隔离和解毒;(2)增强铂诱导的DNA损伤的修复和耐受性;(3)细胞存活途径的改变;(4)多效过程和途径的改变;(5)肿瘤微环境的改变。了解以铂为基础的治疗的复杂反应将是开发克服铂耐药性的改进方法的关键。

一些优秀的综述已经发表了铂耐药的主题，尽管没有全面的，注释的基因数据库与铂耐药相关的报道。由于大规模基因组学和蛋白质组学的出现，功能相关基因/蛋白质注释集的开发在执行复杂分析(包括人工智能的使用)方面变得越来越有价值。为了便于系统生物学方法研究铂耐药，作者对近30年来铂耐药研究的800篇出版物进行了最新的文献综述，并建立了一个涉及铂耐药的900个基因/蛋白的高度整理和注释数据库。对于每个基因，作者提供了该基因在铂耐药性中可能发挥的作用的描述，支持这一作用的引文的超链接，以及每个基因支持证据类型的数字注释，以及相关途径。此外，作者还创建了一个用于浏览、搜索和下载基因集和注释的数据门户。

铂耐药机理

图片来源：https://www.nature.com/articles/s41388-021-02055-2

铂类药物是治疗上皮性肿瘤的有效抗癌药物。不幸的是，在大量病例中，肿瘤能够破坏铂的细胞毒性作用，导致铂耐药和癌症死亡率。在这里，作者回顾了支持大量基因可以直接或间接促成铂耐药性假说的证据。作者还提供了这些基因的手工注释数据库，可以纳入大规模的组学分析，以促进旨在克服铂耐药性的疗法的发展。（生物谷 Bioon.com）

参考文献

Dongqing Huang et al. A highly annotated database of genes associated with platinum resistance in cancer. Oncogene. 2021 Oct 13. doi: 10.1038/s41388-021-02055-2.