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刘毓文/倪建泉团队开发基于人工智能的DNA顺式调控元件设计新方法

DREAM兼具超高的元件活性性能预测能力以及良好的生物学可解释性,因此DREAM可以将学习到的增强子的调控语法用于后续的元件设计任务之中。

2024-11-27

合成生物学元件与数据库发布

该团队设计并构建了合成生物学元件和数据库RDBSB,在线提供了系统审编的定性和定量催化信息,如元件的活性、底物、催化反应最佳pH值和温度以及底盘特异性等关键参数。

2024-10-18

Science:新研究揭示DNA重复元件阻断造血干细胞吞噬机制

这些研究结果支持这样一种模式,即内源性TLR3配体导致b2m的表达,从而阻断巨噬细胞诱导的吞噬,并通过用巨噬细胞监测干细胞质量来确定造血干细胞的克隆性。

2024-09-20

谷氨酸棒杆菌全基因组规模筛选新型功能元件方面获进展

本研究作为生物铸造厂的应用场景之一,提供了新型功能元件筛选的系统策略。

2024-11-22

Mol Cell:涂镇波等揭示转座元件衍生基因在肿瘤中的关键作用机制

本研究阐明了POGK通过其KRAB结构域与转录抑制因子TRIM28结合,形成转录抑制复合物,从而抑制小核糖体亚基RPS16和RPS29的基因转录。

2024-11-25

Cell:揭开人类肠道中数量最多遗传元件——隐秘质粒pBI143

研究团队通过霰弹枪宏基因组学和全新质粒预测算法对来自人类肠道的68000多个质粒进行了表征,并在不同地理、不同种族的人群中发现了一种最普遍存在的隐性质粒——pBI143。

2024-03-31

Nature: 新开发的TATSI技术利用转座元件将定制DNA整合到植物基因组的特定位点

TATSI 技术利用了植物转座元件 20 多亿年进化的优势,这些转座元件就像经过磨练的分子机器,自然而然地将 DNA 导入宿主基因组中。

2024-07-14

研究水稻分蘖调控基因RCN22调控分蘖芽伸长的分子机制

该研究在分子水平上揭示了碳同化模块与独脚金内酯信号传导模块形成的负反馈调控环共同影响水稻分蘖芽伸长的机制,为水稻株型改良提供了新见解。

2024-09-10

确定了DNA中的一类新的调控元件---促进子

在一项新的研究中,来自英国牛津大学和美国纽约大学的研究人员在DNA中的密码如何被读取方面取得新的进展。他们提出“促进子(facilitator)”,即一种新发现的非编码DNA,

2023-12-20

气孔运动调控机理研究获进展

该研究从分子构象、通道活性和生理功能等层面揭示了磷酸化修饰驱动SLAC1通道激活的分子机制,推进了科学家从分子层面研究气孔对外界环境变化的感知和响应。

2024-07-12