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Science:科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型

研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序,当分析了数以万计已知的人类启动子数据后,这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成,即基序、启动子和三核苷酸(trinucleotides)。

2024-05-27

新型3D体外模型的突破性进展!J Hepatol:3D肝细胞模型助力破解脂肪肝之谜

来自海德堡大学医院等机构的科学家们通过研究开发了一种能用于检测脂肪肝药物疗效的新型模型系统,其是一种基于原代人类肝脏实质细胞(肝细胞)的3D体外细胞培养系统。

2024-09-16

Nature:解码基因调控——GET模型如何颠覆传统预测方法

该研究旨在从染色质开放性数据和基因序列信息中学习调控规则,实现对基因表达的高精度预测。该模型的推出标志着转录调控研究进入了一个全新的阶段。

2025-01-13

Cell Discov | 深度学习模型可提高碱基编辑结果的预测准确性

该研究开发了一种深度学习算法,用于准确预测生物多样性编辑结果。

2024-02-26

Cell:挑战传统感染模型——从HIV的“解体假说”到“完整穿越”

“完整穿越”模型重新定义了HIV的感染逻辑,为研究人员理解病毒与宿主的攻防战提供了全新的视角。这一转变让人们更加接近破解HIV感染的核心机制,也为开发新的治疗手段开辟了道路。

2025-01-23

猪胚胎干细胞诱导形成类囊胚模型

该研究建立了将猪胚胎干细胞诱导为类囊胚的技术体系,首次将猪胚胎干细胞诱导形成类囊胚模型。猪是重要的畜牧业动物,也是理想的疾病模型,更是人源化器官的潜在供体。

2024-07-25

Nature:猫的大脑为什么是研究老年痴呆的理想模型

猫在老化过程中,其大脑会表现出类似人类的萎缩和认知退化特征。研究人员希望通过这些数据,揭示年龄相关疾病,尤其是神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)的病理机制。

2024-11-13

Nature:人类自免疫类器官模型揭示乳糜泻的病理过程

这项研究成功建立了一个保留上皮和免疫细胞多样性的ALI体外CeD类器官病理模型,重现了CeD的Gluten依赖性病理过程,揭示了IL-7在CeD中的关键作用,并为体外研究自身免疫疾病提供了新的方法。

2024-09-09

研究人员发展出蛋白质主链去噪扩散概率模型

该研究对SCUBA-D在多类蛋白质从头设计任务中的应用进行了实验验证。

2024-10-20

科研人员人工智能细胞大模型

清华大学自动化系生命基础模型实验室主任张学工教授、电子系/AIR马剑竹教授和百图生科宋乐博士合作,建立了一个名为scFoundation的细胞大模型。

2024-06-18