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Nature子刊:百图生科宋乐团队开发新型蛋白质结构预测工具,不依赖多序列对比,效率更高

与基于MSA的的主流蛋白质结构预测工具AlphaFold2和RoseTTAFold方法相比,HelixFold-Single在预测效率上具有很大优势,耗时要少得多,可以应用于需要大量预测的蛋白质相关任

2023-10-17

科学家揭示外源核酸诱导的原核生物短Ago蛋白系统发挥功能的分子机理

RNA介导的转录后基因调控在生命个体抵御外源入侵的过程中起到重要作用。Argonaute(Ago)蛋白是存在于古菌、细菌和真核生物中的一种蛋白。它为非编码小RNA提供锚位点,达到降解靶基因或者抑制翻译

2023-10-05

Nature:利用新开发的 Foldseek Cluster算法一次性分析大量的蛋白结构

在一项新的研究中,来自瑞士苏黎世联邦理工学院、瑞士生物信息学研究所和韩国首尔国立大学等研究机构的研究人员通过开发一种有效的方法来比较 AlphaFold 数据库中的所有预测蛋白结构,揭示了不同物种蛋白

2023-09-27

MOL CAN:在人膀胱癌中,CircXRN2可通过激活Hippo通路抑制组蛋白乳糖化所驱动的肿瘤进展

近段时间,来自浙江大学的一个研究团队探索了circRNA在膀胱癌中的作用机制,以进一步了解膀胱癌的发生与发展进程。

2023-10-18

Nature子刊:复旦大学马剑鹏团队开发智能算法,大幅提升冷冻电镜蛋白结构解析分辨率

作为蛋白质结构预测领域顶尖团队,由诺贝尔奖得主 Micheal Levitt 教授和马剑鹏教授领导的复旦大学复杂体系多尺度研究院,聚焦基础科学、交叉学科及源头底层技术,致力于推动生物大分子结构实验测定

2023-10-13

Science重磅:AI设计蛋白新突破,David Baker团队设计出响应刺激的双态铰链蛋白

总的来说,这项新研究开发出了同时具有两种明确状态的铰链蛋白,可以应用于“蛋白质开关”的设计。这种双态开关的研究能使蛋白质设计超越静态结构,转向更复杂的多态组装和生物传感器设计,为蛋白设计提供了更广阔的

2023-08-22

研究揭示小分子调控tau蛋白相分离和聚集的机制

细胞内的蛋白质、核酸等大分子通过液-液相分离(liquid-liquid phase separation,LLPS),动态组装成高度浓缩且具有类似液体性质的凝聚体微区,执行不同的生物学功能。相分离的

2023-09-14

Nature Aging封面:刘光慧团队等揭示调控人类心肌衰老的关键蛋白,或可用于逆转心脏衰老

该研究系统绘制了灵长类心脏衰老的多维基因表达图谱,深入解析了SIRT2-STAT3-CDKN2B通路在灵长类心肌细胞衰老中的关键作用,揭示了可逆转心脏衰老的“乙酰化开关”。

2023-10-05

Cell子刊:治疗期间,“休眠”的HIV仍能产生RNA和蛋白

论文作者写道:我们的研究表明,抗逆转录病毒疗法中活跃的HIV库驱动的残余免疫功能障碍,可能导致治疗中断后病毒控制的缺乏,因为它阻止了功能性干细胞样自我更新的HIV特异性CD8+ T细胞的分化

2023-09-15

研究揭示白叶枯病菌新型主效TALE蛋白”一箭双雕”激活水稻抗感病性的机制

上述结果表明,Tal6b/AvrXa27A是一种新型的主效TALE,具有无毒性(avirulence)和毒性(virulence)双重功能,能同时靶向抗病基因Xa27和感病基因OsSWEET11a。

2023-10-07