Nature子刊:研究揭示三维基因组的单分子拓扑结构多样性和细胞异质性
高等真核生物基因组存在复杂的三维空间结构,在不同尺度下形成如染色质环(Chromatin loops)、拓扑关联结构域(TADs)、活性/非活性染色质区室(A/B compartments)和染色体域
Molecular Psychiatry丨贾怡昌课题组揭示调控小鼠发声的分子机制
语言是人类沟通传递关于世界信息的重要方式,也是知识传承的重要载体。有一种观点认为语言的灵活运用赋予了智人强大的力量,从众多人种中脱颖而出【1】。
基于翻译组大数据分析发现RocA-eIF4A调控翻译延伸动态的新功能
翻译组反映了mRNA翻译合成蛋白质的过程,包含基因表达过程在翻译层级的重要信息。核糖体分析(ribosome profiling)是翻译组研究的主流技术,通过对核糖体保护片段(RPF)的深度测序
Frontiers in Microbiology:解析羊肚菌栽培生活史中土壤微生物组的动态变化
中国科学院昆明植物研究所与西北工业大学生态环境学院等研究人员共同解析了羊肚菌栽培生活史中土壤微生物组的时间动态,为微生物菌剂未来应用和羊肚菌栽培可持续发展提供了理论基础。
上海交大杭化莲/王存团队通过空间多位点测序,为肝癌异质性评估和患者免疫分型提供新思路
当前大多数用于肝癌预后风险评估的模型都是基于单区域采样队列开发,这些风险评估模型在开发时未完全考虑瘤内异质性这一重要因素,因此很容易受采样偏倚的影响,从而导致其准确性受到较大限制。
Genome Biology:解析大豆三维基因组遗传多样性
染色质的高级结构是基因组中顺式作用元件发挥功能的先决条件,其在基因表达调控中发挥着重要作用。在真核生物中,三维基因组的组织呈现出层次模式,染色质可以在多个层次上划分为不同的结构和功能单位
Genome Biology:利用CRISPR-dCas13系统追踪发育胚胎中的转录记忆和mRNP出核
该研究通过在斑马鱼胚胎中建立耗时短和优化的CRISPR-dCas13系统,首次在多细胞生物体内不依赖遗传操作,直接观察并追踪内源mRNA转录和mRNP出核。
APL Bioengin:科学家开发出一种用于解析人类肠道微生物组和生理学特性的新型肠道芯片模型
来自加利福尼亚大学等机构的科学家们通过研究开发了一种新型的肠道芯片设备,其或能为实验室模型和人类生物学的研究搭建起一座桥梁。
曾虎等建立新型空间测序技术,精确测定阿尔兹海默病的脑细胞变化
该研究将STARmap PLUS用于阿尔茨海默病(AD)小鼠模型,揭示了AD病理特征蛋白质周围的细胞组成和基因表达改变。STARmap PLUS将单细胞基因表达与组织病理连接起来,为精确定位病理过程中