Nat Commun:揭秘转录因子“勘察”细胞基因组的分子机制
2019年2月12日 讯 /生物谷BIOON/ --转录因子(TFs)是一种能调节基因表达的特殊蛋白,其能在完整的基因组中搜索并结合特殊区域来调节基因的表达;我们都知道,转录因子不仅能结合特殊的DNA序列,还能非特异性结合任何DNA链。这些非特异性的关联就能够明显增加转录因子寻找特殊靶点的能力,然而目前研究人员并不清楚在扫描大量基因组、定位以及结合特殊位点时,人类机体中超过1500种转录因子的的效
研究揭示YWHA/14-3-3结合并调控转录因子TFEB功能的分子机制
国际学术期刊Autophagy 在线发表了中国科学院生物物理研究所冯巍课题组和杨福愉课题组合作的题为YWHA/14-3-3 proteins recognize phosphorylated TFEB by a noncanonical mode for controlling TFEB cytoplasmic localization 的研究论文,揭示了YWHA/14-3-3与转录因子TFEB结
樟科植物比较转录组学研究获进展
樟科植物在克朗奎斯特分类法中被分到木兰亚纲(Magnoliidae)中,被视为双子叶植物中比较原始的类群。这类植物的萼瓣不分,花瓣和萼片联合在一起,统称花被。樟科树种具有多种经济用途,许多种类的种子富含脂肪酸。然而,这一类群的遗传学与基因组学研究背景十分薄弱,目前仅有鳄梨(Persea americana)、山胡椒(Lindera glauca)和山鸡椒(Litsea cubeba)等
Nat Chem Biol:利用转录因子诱饵激活沉默的生物合成基因簇
2019年1月6日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国伊利诺伊大学的研究人员在链霉菌中引诱抑制沉默基因表达的阻遏分子离开,从而成功地揭示出几个大型的处于沉默状态的基因簇产生新的天然产物。相关研究结果于2018年12月31日在线发表在Nature Chemical Biology期刊上,论文标题为“Activation of silent biosynthetic gene clus
研究发现调控植物抗铝毒转录因子STOP1稳定性的机制
12月17日,国际学术期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心黄朝锋研究组完成的题为F-box protein RAE1 regulates the stability of the aluminum-resistance transcription factorSTOP1 in Arabidops
丹麦科学家通过调控转录因子GntR1和RamA提高谷氨酸棒杆菌的生长和中心碳代谢
适应性进化技术是目前备受瞩目的菌种改良技术,该技术能够有效的增强菌株的某种表型或者生理性状,并且该育种技术会保留菌株原有的优良性状,不会出现基因工程育种技术造成的生长限制。为了探究控制谷氨酸棒杆菌的生长和碳水化合物代谢的关键调控因子,研究人员在葡萄糖的基础培养基中对野生型的谷氨酸棒杆菌(C. glutamicum ATCC 13032)进行了长达1500代的适应性进化。在驯化菌株中分离
揭示DNA甲基化增强基因转录机制
2018年12月13日/生物谷BIOON/---DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式,能够在不改变DNA序列的前提下,改变遗传表现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共价键结合一个甲基基团。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因表达
研究解析人类大脑纺锤形神经元的转录图谱
人类大脑的认知功能如语言、思维和情感等赋予了人类非凡的感知力、智慧和创造力。研究发现,在旧大陆猴、猿类和人类等灵长类的大脑中进化出了一类新的神经细胞,称为von Economo neuron (VEN),又称spindle neuron(纺锤形神经元),但这类神经元在新大陆猴等更原始的灵长类中没有。人类大脑中的VEN数量是最多的,但仅集中分布于前脑岛和前扣带回两个脑区。有鉴于VEN的巨大双极神经元
CDK12控制着DNA修复基因的RNA转录本长短
2018年12月8日/生物谷BIOON/---基因BRCA1和BRCA2发生突变对乳腺癌和卵巢癌构成严重风险,这是因为它们通过干扰同源重组修复(HR)来危害细胞的基因组稳定性,其中同源重组修复是一种准确地修复有害的DNA双链断裂的关键机制。如果没有利用这种机制修复DNA双链断裂的能力,那么细胞就不得不采用更容易出错因而更容易发生癌变的DNA修复方式。基因BRCA1和BRCA2不是唯一的当发生突变时
转录组层面上研究蛋白质-RNA相互作用的技术及方法综
两周前,小编给大家推荐了清华大学张强峰教授在QB期刊上发表的关于转录组层面上研究RNA-RNA相互作用的干湿实验方法的综述文章后(点击这里进入该篇文章),引起了许多小伙伴的关注。并且也有小伙伴问,RNA在转录组层面上的相互作用不仅有RNA-RNA之间的,应该还有蛋白质-RNA之间的相互作用呢!那关于RNA-蛋白质相互作用的研究进展又如何呢?