Science子刊:高强/孙怡迪/周虎团队使用患者来源类器官揭示肝癌药物蛋白基因组学特征
此外,研究团队开发了一个交互式门户网站(http://cancerdiversity.asia/LICOB/)以实现类器官数据的分析和探索,使肝癌类器官生物样本库(LICOB)所产生的药物蛋白质组数据
空间转录组数据多模态可视化工具研究取得进展
目前已有工具可以将二维切片的基因表达模式进行可视化,或者进一步堆叠多张切片并形成组织的三维静态视图,但在三维空间中对空间转录组数据的分子特征和空间形态进行交互式探索仍然是一个难点。
免费获得时空组学STOmics项目支持
评审委员会最终评选出具有临床转化潜力的10个计划书,同时为提出这10个项目的科学家提供免费时空组学STOmics®项目支持(包含测序和基础分析服务)。
Nature Aging:揭示调控灵长类器官衰老的表观转录组机制
该研究揭示了三种重要的灵长类器官/组织在生理性衰老过程中的动态m6A修饰变化及其与基因表达稳态的关系,并阐释了METTL3–m6A–NPNT通路维持人类骨骼肌稳态的作用和机制。
Nature Aging:刘光慧团队等揭示调控衰老的表观转录组时钟
该研究系统揭示了三种重要的灵长类器官/组织在生理性衰老过程中的动态m6A修饰变化及其与基因表达稳态的关系,并且深入阐明了METTL3–m6A–NPNT通路维持人类骨骼肌稳态的作用和机制。
Cell:开发新型邻近蛋白质组学技术,第一作者秦为已回国加盟清华大学
大城市内的地铁线路错综复杂,每天不同的人会从一个站点通勤到另一个站点,承担着自己的社会责任。细胞内的蛋白质在时间和空间等维度上也是高度动态的,很多蛋白会在不同的细胞器之间甚至是不同的细胞之间进行转运和
单细胞多组学技术揭示三维基因组与基因表达的关系
在高等真核生物中,基因组在细胞核内的三维空间构象对细胞功能至关重要。例如,增强子常常通过三维空间相互作用对远端目的基因的转录活性起调控作用
Nature重磅:樊荣团队率先实现表观遗传组-转录组联合分析
除了成功实现整个领域期待的在同一组织样品上实现总体染色质可及性和基因表达的联合空间组学分析(Spatial ATAC–RNA-seq),该研究还同时报道了三个特定的组蛋白修饰和基因表达的联合分析
《细胞·代谢》:南京医科大研究团队首次揭示肠道微生物代谢产物吲哚-3-乳酸影响结直肠癌发展的表观遗传学机制
在最近的《细胞·代谢》杂志上,南京医科大学的刘星吟教授团队发表了最新研究成果[2],植物乳杆菌L168及其代谢产物吲哚-3-乳酸(ILA)可以改善肠道炎症和肠道微生态,抑制结直肠癌的发展。ILA可以使
单细胞转录组测序,揭示动物发育过程“古老”和“年轻”基因的表达模式
这一研究揭示了不同细胞类型在转录组年龄上的显著差异,有助于对不同细胞的进化起源进行估计,为理解驱动物种进化的遗传机制提供了新的视角