微生物基因组测序的应用
一、传染病暴发的时代 致死性大肠杆菌传染病在欧洲暴发,至本报道发表前,已导致27人死亡,2800人染病。在拿到明斯特大学医院卫生研究所的研究人员分离的致病株后,Guenther所在的Life Technologie公司德国实验室利用Ion PGM仅用了3天时间就完成了该致病型大肠杆菌菌株的全基因组测序和序列的组装,为快速研究该致病菌株的致病机理创造了条件。
Protein Cell:生物物理所揭示人类心肌细胞和神经干细胞的基因组DNA甲基化图谱
2013年10月14日 讯 /生物谷BIOON/ --心脏病和神经系统疾病是威胁人类健康的杀手,无论在发达还是发展中国家,这些疾病的发病率和致死率均居高不下,给公共卫生事业带来了极大的压力和负担。追根溯源,心脏和神经系统疾病的病因是心肌和神经细胞(或神经前体细胞)的功能或器质性损伤。体外获得高纯度且富有活力的人类心肌和神经(干)细胞并鉴定其特征性分子标记物是认识和干预这些疾病的必要手段。
英国制定生物医药基因组计划
2013年10月10日讯 /生物谷BIOON/ --英国首相卡梅伦制定了一个旨在使英国走在世界生物医药基因组研究前列的计划。英国计划投入1亿6千万美元测定超过10万个完整基因组序列。一家由英国卫生部成立的名为Genomics England的生物信息学公司将要把卡梅伦的这一设想变成现实。不过现在看来,1亿6千万美元的投资相对于10万个基因组的目标还是显得不足。
基因组编辑工具锌指核酸酶(ZFN)研究进展——2011生物谷研究盘点
锌指核酸酶(zinc finger nuclease, ZFN),又名锌指蛋白核酸酶,不是自然存在的,而是一种人工改造的核酸内切酶(图1),由一个 DNA 识别域和一个非特异性核酸内切酶构成,其中DNA识别域赋予特异性,在DNA特定位点结合,而非特异性核酸内切酶赋剪切功能,两者结合就可在DNA特定位点进行定点断裂。
Nature:未培养微生物的基因组
现有基因组序列只能让我们对微生物引人注目的多样性有一个很有限的认识,因为它们中绝大部分从未被培养出纯培养物。在这项研究中,Tanja Woyke及其同事利用单细胞基因组学方法来研究和测序来自九个多样化生境的201种未培养的古生菌和细菌细胞。该信息显示了无数的“门”内和“门”间关系以及若干出乎意料的代谢特征。
Nature:未被培养的微生物基因组
现有基因组序列只能让我们对微生物引人注目的多样性有一个很有限的认识,因为它们中绝大部分从未被培养出纯培养物。在这项研究中,Tanja Woyke及其同事利用单细胞基因组学方法来研究和测序来自九个多样化生境的201种未培养的古生菌和细菌细胞。该信息显示了无数的“门”内和“门”间关系以及若干出乎意料的代谢特征。
JCI:人胚胎干细胞产生的神经衍生物染色体1q基因组不稳定
人胚胎干细胞系VUB03-DM1产生的神经衍生物特征。 能够产生任何胎儿或成体细胞类型的人干细胞也被称作多能性干细胞(pluripotent stem cell)。人们希望这些细胞---它们当中最为著名的是人胚胎干细胞(human embryonic stem cells, hESCs)---能够被用于产生具有治疗用途的细胞群体。
广东家蚕基因组生物学国家重点实验室挂牌
4月16日上午,家蚕基因组生物学国家重点实验室蚕桑抗病育种中心挂牌暨蚕桑抗病育种学术研讨会在广东省农科院蚕业与农产品加工研究所举行,中国工程院向仲怀院士,省科技厅刘炜副厅长,省农科院廖森泰副书记、肖更生副院长,西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室主任夏庆友教授出席会议并讲话。
基因组所“肿瘤个体化治疗和系统生物学”科技创新交叉与合作团队获资助
近日,由中科院北京基因组研究所(以下简称:基因组所)“百人计划”方向东、王前飞研究员, “杰出技术引进人才”吕雪梅研究员,以及国家纳米科学中心“百人计划”丁宝全研究员,北京市肿瘤防治研究所/北京肿瘤医院张连海副主任医师等科研人员,组成的“肿瘤个体化治疗和系统生物学”科技创新交叉与合作团队,经过中科院生物局和人教局的多轮遴选,成功获得资助。
Plant Cell:植物细胞核基因组完整性的维持
近日,上海生科院植生生态所黄海课题组科研人员与英国剑桥大学及John Innes Centre的Janneke Balk博士研究组合作在国际植物科学领域权威期刊《The Plant Cell》发表了题为“The DUF59 family gene AE7 acts in the cytosolic iron-sulfur cluster assembly pathway to maintain n