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Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。

2024-11-23

Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。

2024-11-10

研究揭示尿路上皮癌进化的核心基因密码

上述研究为开发针对ecDNA的精准治疗策略奠定了基础。

2025-03-26

Nature Biotechnology:线粒体基因编辑迎来“超进化”——新型TALEDs效率飙升

这项研究不仅首次阐明了TALEDs依赖于细胞自身的“修复机制”——碱基切除修复 (base excision repair, BER) 通路,还创新性地开发出了性能更强大的升级版TALEDs 。

2025-03-31

豆科植物根瘤共生固氮进化机制研究获进展

研究发现,豆科植物对根瘤菌共生固氮的适应性进化需要植物保守基因、豆科获得基因、豆科丢失基因,而建立豆科植物根瘤菌共生固氮是上述基因共同作用的结果。

2024-10-13

Cell:从细菌毒素到基因剪刀——CRISPR-Cas13的十亿年进化之路

被称作"基因魔剪"的Cas13蛋白,竟起源于一类原始细菌的"自杀式武器"。

2025-02-25

Nature:揭秘SARS-CoV-2在大流行中不断进化背后的分子机制

这篇研究报告中,研究人员通过联合研究对150多万名个体进行了人口层面上的流行病学分析,共涵盖了从疾病大流行开始的四年时间。

2025-02-16

张锋最新Cell论文:利用 AI 工具,揭开CRISPR-Cas13系统进化之谜

该研究通过混合结构和序列进化追踪方法,揭示了 RNA 靶向的 CRISPR-Cas13 系统可能起源于一种古老的 RNA 毒素-抗毒素(TA)系统,特别是 AbiF 系统。

2025-02-23

清华大学程功团队开发AI语言模型,预测新冠病毒突变和进化

该研究开发的SVEP模型,显著提高了数据处理效率,减少了计算资源的消耗,使模型能够更有效地模拟组合突变。

2024-12-27