Cell:染色质重构调节子在核小体中的特异性和方向性
6月22日,Cell杂志报道了染色质重构调节子在核小体中特异性和方向性的最新研究成果。 众多染色质重构调节子是如何相互合作,在基因的开始和结束位点处组织核小体的还不清楚。研究者发现在酿酒酵母细胞全基因组范围内,SWI/ SNF,RSC,ISW1a,ISW1b,ISW2,INO80等染色质重构调节子复合体与单个核小体相结合,并通过缺失分析证实,这些复合体通过辅助核小体定位行使其功能。
Cell:测定活细胞内异染色质动力学的新方法
6月14日,Cell杂志在线报道了一种新颖的体内测定染色质修饰动力学的方法。组蛋白翻译后修饰是非常重要的基因调控,但其传播的模式和对可遗传基因表达状态的贡献大小仍存在争议。为了解决这些问题,研究者开发了一种染色质体内试验(CiA)系统,采用化学诱导接近,启动和终止在活细胞中的染色质修饰。
Cell Reports:染色质调控取决于基因与表观遗传学环境的相互作用
加州大学圣迭戈分校医学院的研究人员巧用基因敲除技术,用同一基因插入酵母染色体上的90个不同位点。他们发现,插入的基因并没有改变附近染色质的表观遗传学环境,而插入环境的差异会明显影响基因的活性。 由DNA和蛋白组成的染色质构成了细胞核,研究人员指出染色质调控中并不存在通用的“组蛋白密码”,染色质调控取决于基因与表观遗传学环境的相互作用。
:酵母细胞抑制子Oaf3p调控脂肪酸应答转录因子的结合以及染色质动态结构的作用机制
近期Biochemical Journal发表了“发育与疾病相关基因”教育部重点实验室”万亚坤课题组的研究工作 (Role of the repressor Oaf3p in the recruitment of transcription factors and chromatin dynamics during oleate response, 2012 Oct 23)。
Genome Res:利用计算模型揭示干细胞分化期间染色质结构和转录因子之间相互作用
2012年12月05日 讯 /生物谷BIOON/ --来自瑞士弗雷德里希米歇尔生物医学研究所(Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research) Dirk Schübeler研究团队和来自巴塞尔大学的Erik van Nimwegen 研究团队开展一项重要的原理循证研究(proof-of-principle study)...
:基于染色质免疫沉淀和高通量测序的鉴定DNA易损位点的手段
2012年12月17日,北京生命科学研究所杜立林实验室在《Genome Research》杂志在线发表题为“Mapping genomic hotspots of DNA damage by a single-strand-DNA-compatible and strand-specific ChIP-seq method”的文章。
Genet:胚胎发育中染色质修饰特异性组合决定增强子活性
称作染色质修饰化学标记(绿色)激活称作远程控制器的增强子(黄色),将一个基因(红色)开启或关闭。图片来自 EMBL/P. Riedinger。 当胚胎发育时,不同细胞中不同基因被打开以便形成肌肉、神经元和身体其他部分。在每个细胞的细胞核内部,称作增强子的基因序列发挥着类似远程控制器(remote control)的作用,打开和关闭基因。
Genet:首次揭示信号传导分子JNK直接调控染色质
来自瑞士弗雷德里克米歇尔研究所生物医学研究中心(Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research, FMI)的研究人员与来自瑞士苏黎世理工学院(ETH Zurich)生物系统科学和工程部门的同事一起合作开展研究,描述了信号传导分子(signaling molecule)JNK如何直接修饰组蛋白从而改变基因转录。
Trends Immunol:时玉舫等揭示间充质干细胞与组织免疫反应作用机理
近日,受国际著名杂志Cell Press的Trends in Immunology杂志邀请,中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所时玉舫研究员领导的免疫与组织干细胞研究组于2012年1月在线发表了题为“How mesenchymal stem cells interact with tissue immune responses”的研究综述文章。
Nature:基因组和染色质扰动的检测
当DNA发生双链断裂时,ATM (ataxia telangiectasia mutated) 激酶便被激发。“乙酰转移酶” KAT5 向被修饰的组蛋白标记物H3K9me3上的结合通过使该激酶乙酰化来促进ATM激发。