Genet:胚胎发育中染色质修饰特异性组合决定增强子活性
称作染色质修饰化学标记(绿色)激活称作远程控制器的增强子(黄色),将一个基因(红色)开启或关闭。图片来自 EMBL/P. Riedinger。 当胚胎发育时,不同细胞中不同基因被打开以便形成肌肉、神经元和身体其他部分。在每个细胞的细胞核内部,称作增强子的基因序列发挥着类似远程控制器(remote control)的作用,打开和关闭基因。
Genet:首次揭示信号传导分子JNK直接调控染色质
来自瑞士弗雷德里克米歇尔研究所生物医学研究中心(Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research, FMI)的研究人员与来自瑞士苏黎世理工学院(ETH Zurich)生物系统科学和工程部门的同事一起合作开展研究,描述了信号传导分子(signaling molecule)JNK如何直接修饰组蛋白从而改变基因转录。
Nature:基因组和染色质扰动的检测
当DNA发生双链断裂时,ATM (ataxia telangiectasia mutated) 激酶便被激发。“乙酰转移酶” KAT5 向被修饰的组蛋白标记物H3K9me3上的结合通过使该激酶乙酰化来促进ATM激发。
:基于染色质免疫沉淀和高通量测序的鉴定DNA易损位点的手段
2012年12月17日,北京生命科学研究所杜立林实验室在《Genome Research》杂志在线发表题为“Mapping genomic hotspots of DNA damage by a single-strand-DNA-compatible and strand-specific ChIP-seq method”的文章。
Nature:人成纤维细胞中的染色质相互作用
Hi-C是基于“染色体构形捕捉”(称之为3C,因为三个单词的首字母都是C)的一项基因组技术,能以没有偏颇的方式在整个基因组中识别长距离成环相互作用。
Nature:染色质组织方式决定肿瘤细胞区域性突变率
7月22日,Nature杂志在线报道,染色质组织方式对人类癌细胞中区域性突变率具有重大影响。 癌症基因组测序,提供了人类体细胞整个基因组的基因突变率差异的第一手资料。通过检测各种遗传学和表观遗传学指标,研究者发现,癌症细胞基因组的基因突变率与染色质组织方式存在惊人的相关性。
Cell:染色质重构调节子在核小体中的特异性和方向性
6月22日,Cell杂志报道了染色质重构调节子在核小体中特异性和方向性的最新研究成果。 众多染色质重构调节子是如何相互合作,在基因的开始和结束位点处组织核小体的还不清楚。研究者发现在酿酒酵母细胞全基因组范围内,SWI/ SNF,RSC,ISW1a,ISW1b,ISW2,INO80等染色质重构调节子复合体与单个核小体相结合,并通过缺失分析证实,这些复合体通过辅助核小体定位行使其功能。
Cell Reports:染色质调控取决于基因与表观遗传学环境的相互作用
加州大学圣迭戈分校医学院的研究人员巧用基因敲除技术,用同一基因插入酵母染色体上的90个不同位点。他们发现,插入的基因并没有改变附近染色质的表观遗传学环境,而插入环境的差异会明显影响基因的活性。 由DNA和蛋白组成的染色质构成了细胞核,研究人员指出染色质调控中并不存在通用的“组蛋白密码”,染色质调控取决于基因与表观遗传学环境的相互作用。