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消除取向优势问题的冷冻电镜三维重构算法获得进展

科研人员利用SIRM方法,对几种带有缺失锥的数据集进行处理。结果显示,使用SIRM方法后的重建图像在缺失锥方向上的分辨率得到提高,恢复了取向优势带来的密度畸变问题,并提升了分辨率。

2024-08-08

基因编辑突破!Cell:AI算法解锁精神疾病遗传密码,精准定位“书中的错乱章节”

这个名为复杂结构变异自动重建算法(ARC-SV)的新工具能够以95%的准确率捕捉各种DNA重排。

2024-10-26

Nature子刊:诸颖团队开发空间转录组语义注释算法Pianno

在这项研究中,研究团队展示了Pianno在注释各种形状的解剖结构以及病灶和细胞类型方面的卓越性能,这些数据来自不同的空间技术平台。

2024-04-10

CRM:哈佛/斯坦福团队借助全新算法,找到调节CD8+T细胞抗癌战斗力的通路!

GMDF算法的优势在于既可以进行跨数据库、跨瘤种的Meta分析寻找共享性特征,也可以分析特定“场景”,例如单一瘤种或根据患者性别、年龄等特征来做定制分析。

2024-07-06

科研人员开发相分离关键氨基酸鉴定算法PSPHunter

该研究报道了一种基于多信息融合的机器学习模型PSPHunter,可用于鉴定相分离蛋白和相分离关键氨基酸。

2024-04-24

Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。

2024-11-27

Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。

2024-11-10

李光远等人开发预测抗原的AI算法,发现癌症免疫治疗通用靶点

研究团队表示,这项研究只是开始,团队目前正在将这一计算工具应用于最难治愈的癌症,以发现新的治疗靶点。

2024-01-19

Nat Biotechnol | 揭开肿瘤亚克隆演化之谜:31种算法在模拟肿瘤中的表现评估

为了更好地理解肿瘤的演化过程,研究人员开发了许多基于高通量测序技术的亚克隆重建算法。这些算法利用肿瘤DNA测序数据中的突变特征来推断肿瘤亚克隆的组成和演化历史。

2024-06-13

Nat Methods:瞿昆/黎斌/陈发来合作系统性评估单细胞多组学分析算法

结果显示,在蛋白质丰度预测方面,totalVI 和 scArches 表现最为优异;在染色质可及性预测中,LS_Lab 算法排名领先。

2024-10-02