微生物所等重建担子菌门骨干类群的演化时间和发育图谱
分类学是一门古老的学科，长期以来分类都是建立在比较形态学之上。近十几年来，在DNA测序基础上的真菌分子系统发育研究发展迅速，随着测序样本量的不断增加，大量新物种被发现的同时，越来越多过去不曾知晓的进化分支也被揭示。目前真菌分类大多依赖于类群进化上的单系发生性和表型特征，并基于此构建分类体系。然而这样的分类体系却远不能和这些数目众多的新支序对应，使之难以命名。其主要原因是目前
Genome Biol：科学家利用新型技术绘制基因图谱 有望改善癌症诊断
2017年7月5日 讯 /生物谷BIOON/ --基因组结构的大规模改变通常在癌细胞中比较常见，近日来自英国巴布拉汉研究所(Babraham Institute)的研究人员通过研究就发现了一种能够检测这些改变的新方法，相关研究刊登于国际杂志Genome Biology上，该研究或为后期研究人员开发增强癌症诊断的新方法及癌症新型靶向疗法提供新的思路和希望。图片来源：Babraham Institut
PNAS：科学家成功绘制出吸烟引发的DNA损伤修复障碍的图谱
2017年6月13日 讯 /生物谷BIOON/ ---几十年来，科学家们早就已经知道吸烟能够引起DNA的损伤，进而引发肺癌的发生。如今，来自NUC医学院的科学家们首次描绘出了全基因组DNA损伤的高分辨率图谱。这一创新性的研究是由来自UNC医学院的诺贝尔奖获得者Aziz Sancar博士领导作出的，相关结果发表在《PNAS》杂志上。Sancer等人开发出了一类描绘基因组损伤修复的图谱的方法，并通过该
Cell:中国学者张泽民、彭吉润、欧阳文君团队首次发布大规模肿瘤单细胞水平免疫图谱
2017年6月15日，北京大学生命科学学院 BIOPIC 中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大 - 清华生命科学联合中心张泽民研究组，首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组，及美国 AMGEN 公司的欧阳文君研究组在《Cell》杂志发表了题为“Landscape of infiltrating T cells in liver cancer reveal
Nature：细胞图谱揭示免疫系统抗击癌症新细节
围绕和侵入肿瘤的免疫细胞可以决定癌症疗法的成败。发表于5月4日的两项研究提出，绘制围绕肿瘤的免疫细胞的详细图谱能帮助人们发现新的治疗靶标，找出可用于选择某种疗法最有可能对其起效的病人的生物标记物，还能帮助了解何时是开始治疗的最佳时机。响应肿瘤的免疫细胞（橙色）类型比人们此前认为的更加多样。Steve Gschmeissner/SPL这两篇论文发表于《细胞》期刊，反映出了癌症研究者一个不断扩大的共识
Cell: 中国学者张泽民、彭吉润、欧阳文君团队首次发布大规模肿瘤单细胞水平免疫图谱
2017 年 6 月 15 日，北京大学生命科学学院 BIOPIC 中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大 - 清华生命科学联合中心张泽民研究组，首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组，及美国 AMGEN 公司的欧阳文君研究组在《Cell》杂志发表了题为“Landscape of infiltrating T cells in liver cancer r
Nature：绘制出有史以来最大的人蛋白相互作用图谱
2017年5月28日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国哈佛医学院的研究人员绘制出人5800多个基因编码的蛋白相互作用图谱（或者说网络）。这些基因代表着超过四分之一的人基因组。相关研究结果发表在2017年5月25日的Nature期刊上，论文标题为“Architecture of the human interactome defines protein communities an
同期两篇Cell论文：癌细胞周围免疫细胞的特征图谱
两个独立的研究组绘制了人类肿瘤周围数千个免疫细胞之间的关联图谱，并确定了这些免疫细胞的分类。其中一个研究组分析的是肾癌，他们发现具有不同临床结果的肿瘤也具有不同特的免疫细胞特征，这可以用于评估癌症患者的预后情况；另外一个研究组则在肺癌中发现即使是早期肿瘤，也出现了免疫细胞活性的紊乱。这两篇文章公布在5月4日的Cell杂志上，将有助于启发精准免疫治疗临床试验。纽约西奈山医学院的Miriam Mera
Annals of Oncology：癌细胞在患者体内扩散的精确时间图谱
2017年5月16日 讯 /生物谷BIOON/ ---科学家们第一次精确地追踪到了癌症患者体内癌细胞的扩散特性，能够精细地揭示肿瘤细胞快速致命化的原因。对于癌症患者来说，最坏的诊断结果无非是癌症的恶化，即癌细胞扩散到了机体的其它部位，形成了次级肿瘤。目前对于癌症恶化的时间的诊断一直比较困难，但这一信息对于医生提高其治疗方案则十分重要。在这一研究中，来自ICR（Institute of Cancer