世界首个野生梨基因组图谱组装成功
8月1日，国际植物学领域权威期刊《植物生物技术杂志》（Plant Biotechnology Journal）在线发表世界首个野生梨高质量基因组图谱。该研究成果由中国农业科学院果树研究所研究员曹玉芬团队和中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员田志喜团队等合作完成。科研人员以山西杜梨为材料，结合PacBio三代测序、Bionano光学图谱、Hi-C技术，组装了高质量的杜梨参考基因组序列，
Nat Biotechnol：开发出混合宏基因组装配器OPERA-MS，更准确地组装复杂的微生物群落
2019年8月6日讯/生物谷BIOON/---通过高通量宏基因组测序已实现了对微生物组的表征。然而，现有方法并不是将来自短读取技术和长读取技术的读取片段结合在一起。在一项新的研究中，来自新加坡国立大学、新加坡基因组研究院、新加坡陈笃生医院、南洋理工大学和克罗地亚萨格勒布大学的研究人员开发出一种称为OPERA-MS的混合宏基因组装配器，它将基于装配的宏基因组聚类与重复识别的精确支架结合在一起，以准确
Nature：新研究揭示胚胎发育早期基因组的组装特征
2019年5月23日 讯 /生物谷BIOON/ --最新一项研究表明，卵母细胞受精后立即会出现DNA活性和非活性区域的分化，该现象甚至在基因被激活之前就已经出现。该研究将有助于更好地了解单个受精卵母细胞发育成由许多不同细胞类型组成的完整生物体的机制。相关结果发表在《Nature》杂志上。受精卵最终会发育成一个完整的，由数万亿个具有多种功能的细胞组成的有机体。尽管这些细胞具有不同的功能，但所有这些细
北京基因组所开发跨物种长非编码RNA鉴定软件LGC
近日，基因组所在国际生物多样性与健康大数据（Global Biodiversity & Health Big Data，简称BHBD）联盟框架下，与沙特阿卜杜拉国王科技大学、巴基斯坦真纳大学以及美国梅奥医学院开展科研合作，联合开发了可跨物种使用的长非编码RNA（long non-coding RNA， lncRNA）鉴定软件LGC。该成果以“Characterization and ide
研究实现28个异源基因组装的维生素从头合成
合成生物学开辟了化学品人为设计合成的新境界，青蒿素生物合成颠覆植物提取路线是合成生物学的经典案例，组装操纵23个基因实现阿片类生物碱的生物合成，成为2015年世界十大科学突破之一。维生素B12是一种含有金属钴的复杂有机分子，广泛应用在药品、饲料、食品和化妆品等领域，需求逐年上升，市场缺口日益突出。微生物发酵是获得维生素B12的现有方式，发酵周期长、生产成本高，工业生产菌种遗传改造困难，提高产量难度
开发出让基因组重新组装的CRISPR-GO技术
2018年10月14日/生物谷BIOON/---大多数哺乳动物细胞含有一个细胞核，这个细胞核中容纳的DNA如果拉成直线的话则长6英尺以上。这种遗传物质决定着细胞的命运，而且如果它处于不合适的位置或者遭受损伤的话，那么它能够导致疾病。之前的研究已表明DNA倾向于在细胞核的某些区域聚集在一起。然而，这种放置如何影响DNA的功能仍然是不清楚的。在一项新的研究中，来自美国斯坦福大学的研究人员通过解除CRI
小麦等大基因组作物核心基因组低成本组装及新基因挖掘研究获进展
6月21日，Nucleic Acids Research 期刊在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组与中科院遗传与发育生物学研究所童依平研究组合作完成的题为CGT-seq： epigenome-guided de novo assembly of the core genome for divergent populations with large genom
报春苣苔属叶绿体基因组装及高变异区段挖掘新策略研究获进展
报春苣苔属是典型的喀斯特岩溶洞穴植物，具有非常丰富的物种多样性和特有性，是研究喀斯特植物适应性进化和物种形成的理想模式。中国科学院华南植物园植物科学研究中心博士冯超等在研究员康明的指导下，以报春苣苔属植物为材料，率先搭建该属三个完整的叶绿体基因组并进行结构注释，提出两种高变异区段挖掘的新策略。策略一命名为Con_Sea：基于多物种叶绿体基因组的联配结果，找出真正的保守区和变异区（Con_Sea），
PLoS Comput Biol：开发出CRISPETa软件大规模设计用于基因组剔除的成对sgRNA
在一项新的研究中，研究人员构建出一种被称作CRISPETa的软件，这种软件能够被用来灵活地设计CRISPR剔除实验。
剑桥Broad开发云端基因组软件GATK4，参与大咖亚马逊、谷歌、IBM、微软......
剑桥Broad研究所带来了它的云端基因组分析工具——与亚马逊、Cloudera、谷歌、IBM、英特尔、微软合作。这个压缩到GATK的工具包，是由哈佛-麻省理工学院开发的高通量测序数据分析软件。自从去年阿尔法（alpha）在谷歌