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bioRixv:单细胞分析和机器学习确定了COVID-19的主要靶点

2020年6月6日讯 /生物谷BIOON /——耶鲁大学医学院的科学家们正在利用单细胞RNA测序来研究SARS-CoV-2如何与宿主细胞相互作用。心血管医学和计算机科学部医学助理教授David van Dijk博士和实验室医学和免疫生物学助理教授Craig Wilen博士利用被感染的人类支气管上皮细胞(HBECs)的单细胞RNA序列数据来确定病毒如何感染和改

2020-06-06

R环结构或能与转录因子Sox2协调作用来调节细胞重编程的多能性

2020年6月14日 讯 /生物谷BIOON/ --R环(R-loops)细胞中的特殊结构,其由RNA-DNA杂交体和可被取代的单链DNA组成,通常在转录基因附近被发现,然而,R环通常也是一种动态和广泛的实体结构,其在基因组中扮演着并不明确的调节和表观遗传角色。图片来源:CC0 Public Domain近日,一项刊登在国际杂志Science Advance

2020-06-14

Genome Biology :单细胞RNA测序可定量检测药物对胰岛细胞的效果

胰腺是产生消化酶以及调节血糖水平的激素的器官。胰岛专门负责激素的分泌,其中有β细胞和α细胞,β细胞会产生降低血液中葡萄糖水平所需的激素——胰岛素,而α细胞会产生负责升高血液中葡萄糖水平的激素——胰高血糖素。

2020-05-12

微生物单细胞人工智能鉴定研究获进展

 微生物高特异性、高灵敏性的快速鉴定在临床检验、食品安全、海关边检等众多领域有广泛的需求。随着国家生物安全重要性的日益凸显,对微生物精准快检的需求更加迫切。当前的微生物检测鉴定方法大多依赖于纯培养,耗时通常较长,很难在分钟级别实现准确的鉴定。拉曼光谱是光子与化学分子之间产生非弹性散射而形成的非连续谱带。每种化学分子都具有自身特异的拉曼光谱,根据拉曼

2020-05-09

单细胞环境中发现遗传连锁反应!

2020年4月23日讯 /生物谷BIOON /——尽管遗传学和基因组学的进展揭示了许多与疾病相关的基因突变,但医生和研究人员仍然面临着将这些突变与实际致病过程联系起来的棘手挑战。再加上单细胞生物学的不断发展,它能在特定时刻检测每个细胞的基因和/或蛋白质的表达,这项任务变得更加艰巨。现在,辛辛那提儿童医院医学中心的研究人员在Nature杂志上发表了一篇研究报告

2020-04-23

研究发现干细胞谱系自我维持新机制

 细胞命运决定是发育生物学的基本问题。植物中细胞命运虽然灵活性较高,但也高度依赖于细胞谱系:即细胞经历过的状态决定当前状态和未来发育潜能。中国科学院遗传与发育生物学研究所焦雨铃课题组长期研究植物侧生分生组织的形成。侧生分生组织位于高等植物叶腋,能够形成新的生长点,与顶端分生组织具有类似的器官发生能力。形成侧生分生组织的干细胞从何而来?研究组前期工作

2020-04-14

Nat Biotechnol:科学家发现能准确高效进行单细胞转录组特性分析的最佳技术—Quartz-seq2

2020年4月9日 讯 /生物谷BIOON/ --为了确保单细胞RNA测序能够使用最好的方法,日前研究人员对13种方法进行了基准性的测试,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中,来自西班牙的科学家们通过研究发现,日本理化所开发的Quartz-seq2方法或许是进行单细胞RNA测序的最佳手段。图片来源:CC0 Public D

2020-04-09

PNAS:发现蝙蝠中的一种新型逆转录病毒不仅感染蝙蝠细胞,也能感染人细胞

2020年4月19日讯/生物谷BIOON/---澳大利亚在今年夏天发生了史无前例的森林大火,当地的考拉(也译为树袋熊)受到了毁灭性的打击。如今,它们正面临着来自另一种哺乳动物---蝙蝠---的威胁,这种威胁可能更严重,也更持久。在一项新的研究中,来自澳大利亚伯纳特研究所和澳大利亚联邦科学与工业研究组织(CSIRO)等研究机构的研究人员揭示蝙蝠携带着一类导致考

2020-04-19

研究发现自然杀伤细胞促进胚胎发育的转录调控新机制

中国科学技术大学免疫学研究所教授魏海明、傅斌清和田志刚课题组合作研究发现,蜕膜自然杀伤细胞(NK细胞)高表达转录因子PBX1,能够增强生长因子转录,促进胚胎发育;NK 细胞 PBX1 功能异常与不明原因复发性流产病因存在相关性。研究成果于4月1日以PBX1 Expression in Uterine Natural Killer Cells Drives F

2020-04-11

Nat Med:超急性期HIV-1感染多细胞免疫动力学的单细胞综合分析

2020年4月10日讯 /生物谷BIOON /——细胞免疫是控制细胞内病原体的关键,但在进化的人类免疫反应中,个体细胞动力学和细胞-细胞协同性仍然知之甚少。单细胞RNA测序(scRNA-seq)是一个强有力的工具,可以用来分析健康和疾病中复杂的多细胞行为,并鉴定可测试的治疗靶点。将其应用于纵向样本可以提供一个揭示与疾病进展演变相关的细胞因子的机会,而不会潜在地混

2020-04-10