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北京基因组开发跨物种长非编码RNA鉴定软件LGC

近日,基因组所在国际生物多样性与健康大数据(Global Biodiversity & Health Big Data,简称BHBD)联盟框架下,与沙特阿卜杜拉国王科技大学、巴基斯坦真纳大学以及美国梅奥医学院开展科研合作,联合开发了可跨物种使用的长非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)鉴定软件LGC。该成果以“Characterization and ide

2019-02-05

北京基因组开发系列特色科学数据库

近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表,并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas、犬类数据库iDog、RNA编辑与疾病相关知识库EDK、植物RNA编辑数据库PED、人类长非编码RNA数

2018-11-11

遗传发育完成橡胶草基因组序列解析

  天然橡胶是与石油、钢铁、煤炭并重的世界四大工业原料之一,2015年全球消耗总量达12.14百万吨,产值约170亿美元。巴西三叶橡胶树是天然橡胶的主要来源,由于种植面积限制、生产成本增加、遗传背景狭窄和病虫害严重等因素,橡胶生产逐渐难以满足需求。我国是天然橡胶消费大国,而巴西三叶橡胶树可种植面积极少,导致我国对外依赖度已超过80%。开发生产天然橡胶的替代资源具有重要的战略意义

2017-09-06

Nature Plants:微生物等发表植物基因组编辑研究综述

 序列特异性核酸酶使得基因组编辑成为可能,快速推动了基础和应用生物学的发展。CRISPR-Cas9系统自出现以来,作为可转化植物的基因组编辑工具已得到广泛应用。CRISPR-Cas9对基因组靶位点进行定向切割,造成DNA双链断裂。DNA双链断裂主要通过两种高度保守的机制进行修复,即非同源末端连接(Non-homologous end joining, NHEJ)和同源重组(Homolog

2017-08-16

微生物合作建立新的谷氨酸棒杆菌基因组规模代谢网络模型

  谷氨酸棒状杆菌(Corynebacterium glutamicum),是重要的工业微生物之一,被广泛应用于氨基酸、有机酸、维生素和生物能源等的工业化生产。作为工业生产菌种,谷氨酸棒杆菌具有耐受高强度发酵的鲁棒性、环境适应性强等特点。该菌的基因组测序已完成,遗传操作系统正在被不断地完善。目前,谷氨酸棒杆菌的代谢工程改造主要集中在解除反馈抑制、减弱竞争途径、增强目标产物合成途

2017-07-05

英特尔与博德研究携手加强基因组学研究解决方案

-英特尔以先进的分析流程迎战基因组学领域重大课题北京2017年5月26日电 /美通社/ -- 近日,英特尔联合博德研究所开发了“博德-英特尔基因组学堆栈 (BIGstack)”,英特尔以先进的分析流程参与和推动了基因组学研究。英特尔公司副总裁兼数据中心解决方案事业部总经理 Jason Waxman 日前就这一成就进行了解读,全文如下:今天我们迎来了基因组学研究领域一个重大里程碑,英特尔很高兴能够参

2017-05-24

Cell Res:中科生化细胞李劲松研究等建立快速分析致死基因在不同组织中功能的新方法

2017年4月21日,国际学术权威刊物自然出版集团旗下子刊《Cell Research》杂志在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所李劲松研究组和中国科学院神经科学研究所于翔研究组的最新研究成果

2017-04-27

Cell Research:北京基因组等发现RNA甲基化调控基因出核新机制

 中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂研究组和郑州大学第一附属医院生殖与遗传专科医院孙莹璞研究组、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究组合作研究,揭示了

2017-04-20

中国农科院哈兽首次表达出猪源三型干扰素

 近日,中国农业科学院哈尔滨兽医研究所猪消化道传染病创新团队研究员冯力和刘平黄在猪流行性腹泻抗病毒方面取得了新进展。团队科研人员首次克隆表达了猪源三型干扰素,可有效抑制流行性腹泻病毒感染。猪流行性

2017-03-14

中国农科院作物研发新型玉米分子育种芯片

玉米是世界上最重要的食粮之一,玉米的用途很广,比如直接食用、饲料用途,工业加工用途等等中国农业科学院作物科学研究所“玉米分子育种技术和应用”创新团队邹枨副研究员在《molecular breeding》杂志上发表了题为

2017-03-06